SMARCA5
SMARCA5 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SMARCA5, ISWI, SNF2H, WCRF135, hISWI, hSNF2H, SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603375 MGI: 1935129 HomoloGene: 55764 GeneCards: SMARCA5 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 4: 143.51 – 143.56 Mb | Хр. 8: 81.43 – 81.47 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
SMARCA5 (англ. SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 052 амінокислот, а молекулярна маса — 121 905[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSSAAEPPPP | PPPESAPSKP | AASIASGGSN | SSNKGGPEGV | AAQAVASAAS | ||||
AGPADAEMEE | IFDDASPGKQ | KEIQEPDPTY | EEKMQTDRAN | RFEYLLKQTE | ||||
LFAHFIQPAA | QKTPTSPLKM | KPGRPRIKKD | EKQNLLSVGD | YRHRRTEQEE | ||||
DEELLTESSK | ATNVCTRFED | SPSYVKWGKL | RDYQVRGLNW | LISLYENGIN | ||||
GILADEMGLG | KTLQTISLLG | YMKHYRNIPG | PHMVLVPKST | LHNWMSEFKR | ||||
WVPTLRSVCL | IGDKEQRAAF | VRDVLLPGEW | DVCVTSYEML | IKEKSVFKKF | ||||
NWRYLVIDEA | HRIKNEKSKL | SEIVREFKTT | NRLLLTGTPL | QNNLHELWSL | ||||
LNFLLPDVFN | SADDFDSWFD | TNNCLGDQKL | VERLHMVLRP | FLLRRIKADV | ||||
EKSLPPKKEV | KIYVGLSKMQ | REWYTRILMK | DIDILNSAGK | MDKMRLLNIL | ||||
MQLRKCCNHP | YLFDGAEPGP | PYTTDMHLVT | NSGKMVVLDK | LLPKLKEQGS | ||||
RVLIFSQMTR | VLDILEDYCM | WRNYEYCRLD | GQTPHDERQD | SINAYNEPNS | ||||
TKFVFMLSTR | AGGLGINLAT | ADVVILYDSD | WNPQVDLQAM | DRAHRIGQTK | ||||
TVRVFRFITD | NTVEERIVER | AEMKLRLDSI | VIQQGRLVDQ | NLNKIGKDEM | ||||
LQMIRHGATH | VFASKESEIT | DEDIDGILER | GAKKTAEMNE | KLSKMGESSL | ||||
RNFTMDTESS | VYNFEGEDYR | EKQKIAFTEW | IEPPKRERKA | NYAVDAYFRE | ||||
ALRVSEPKAP | KAPRPPKQPN | VQDFQFFPPR | LFELLEKEIL | FYRKTIGYKV | ||||
PRNPELPNAA | QAQKEEQLKI | DEAESLNDEE | LEEKEKLLTQ | GFTNWNKRDF | ||||
NQFIKANEKW | GRDDIENIAR | EVEGKTPEEV | IEYSAVFWER | CNELQDIEKI | ||||
MAQIERGEAR | IQRRISIKKA | LDTKIGRYKA | PFHQLRISYG | TNKGKNYTEE | ||||
EDRFLICMLH | KLGFDKENVY | DELRQCIRNS | PQFRFDWFLK | SRTAMELQRR | ||||
CNTLITLIER | ENMELEEKEK | AEKKKRGPKP | STQKRKMDGA | PDGRGRKKKL | ||||
KL |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Aalfs J.D., Narlikar G.J., Kingston R.E. (2001). Functional differences between the human ATP-dependent nucleosome remodeling proteins BRG1 and SNF2H. J. Biol. Chem. 276: 34270—34278. PMID 11435432 DOI:10.1074/jbc.M104163200
- Bozhenok L., Wade P.A., Varga-Weisz P. (2002). WSTF-ISWI chromatin remodeling complex targets heterochromatic replication foci. EMBO J. 21: 2231—2241. PMID 11980720 DOI:10.1093/emboj/21.9.2231
- Dirscherl S.S., Krebs J.E. (2004). Functional diversity of ISWI complexes. Biochem. Cell Biol. 82: 482—489. PMID 15284901 DOI:10.1139/o04-044
- Cavellan E., Asp P., Percipalle P., Oestlund Farrants A.-K. (2006). The WSTF-SNF2h chromatin remodeling complex interacts with several nuclear proteins in transcription. J. Biol. Chem. 281: 16264—16271. PMID 16603771 DOI:10.1074/jbc.M600233200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11101 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O60264 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
- Хромосома 4
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|