SLITRK2

Ідентифікатори

Символи

SLITRK2, CXorf2, SLITL1, SLIT and NTRK like family member 2, CXorf1, TMEM257

Зовнішні ІД

OMIM: 300561 MGI: 2679449 HomoloGene: 13054 GeneCards: SLITRK2

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84631


245450

Ensembl


ENSG00000185985


ENSMUSG00000036790

UniProt


Q9H156


Q810C0

RefSeq (мРНК)

NM_001144003 NM_001144004 NM_001144005 NM_001144006 NM_001144007
NM_001144008 NM_001144009 NM_001144010 NM_032539


NM_001161431 NM_198863

RefSeq (білок)

NP_001137475 NP_001137476 NP_001137477 NP_001137478 NP_001137480
NP_001137481 NP_001137482 NP_115928


NP_001154903 NP_942563

Локус (UCSC)

Хр. X: 145.82 – 145.83 Mb

Хр. X: 65.69 – 65.7 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SLITRK2 (англ. SLIT and NTRK like family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 845 амінокислот, а молекулярна маса — 95 404^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLSGVWFLSV	LTVAGILQTE	SRKTAKDICK	IRCLCEEKEN	VLNINCENKG
FTTVSLLQPP	QYRIYQLFLN	GNLLTRLYPN	EFVNYSNAVT	LHLGNNGLQE
IRTGAFSGLK	TLKRLHLNNN	KLEILREDTF	LGLESLEYLQ	ADYNYISAIE
AGAFSKLNKL	KVLILNDNLL	LSLPSNVFRF	VLLTHLDLRG	NRLKVMPFAG
VLEHIGGIME	IQLEENPWNC	TCDLLPLKAW	LDTITVFVGE	IVCETPFRLH
GKDVTQLTRQ	DLCPRKSASD	SSQRGSHADT	HVQRLSPTMN	PALNPTRAPK
ASRPPKMRNR	PTPRVTVSKD	RQSFGPIMVY	QTKSPVPLTC	PSSCVCTSQS
SDNGLNVNCQ	ERKFTNISDL	QPKPTSPKKL	YLTGNYLQTV	YKNDLLEYSS
LDLLHLGNNR	IAVIQEGAFT	NLTSLRRLYL	NGNYLEVLYP	SMFDGLQSLQ
YLYLEYNVIK	EIKPLTFDAL	INLQLLFLNN	NLLRSLPDNI	FGGTALTRLN
LRNNHFSHLP	VKGVLDQLPA	FIQIDLQENP	WDCTCDIMGL	KDWTEHANSP
VIINEVTCES	PAKHAGEILK	FLGREAICPD	SPNLSDGTVL	SMNHNTDTPR
SLSVSPSSYP	ELHTEVPLSV	LILGLLVVFI	LSVCFGAGLF	VFVLKRRKGV
PSVPRNTNNL	DVSSFQLQYG	SYNTETHDKT	DGHVYNYIPP	PVGQMCQNPI
YMQKEGDPVA	YYRNLQEFSY	SNLEEKKEEP	ATPAYTISAT	ELLEKQATPR
EPELLYQNIA	ERVKELPSAG	LVHYNFCTLP	KRQFAPSYES	RRQNQDRINK
TVLYGTPRKC	FVGQSKPNHP	LLQAKPQSEP	DYLEVLEKQT	AISQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
Aruga J., Yokota N., Mikoshiba K. (2003). Human SLITRK family genes: genomic organization and expression profiling in normal brain and brain tumor tissue. Gene. 315: 87—94. PMID 14557068 DOI:10.1016/S0378-1119(03)00715-7
Beaubien F., Raja R., Kennedy T.E., Fournier A.E., Cloutier J.F. (2016). Slitrk1 is localized to excitatory synapses and promotes their development. Sci. Rep. 6: 27343—27343. PMID 27273464 DOI:10.1038/srep27343

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13449 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H156 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.