SLIT2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5f/Protein_SLIT2_PDB_2V70.png/250px-Protein_SLIT2_PDB_2V70.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2V70, 2V9S, 2V9T, 2WFH | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SLIT2, SLIL3, Slit-2, slit guidance ligand 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603746 MGI: 1315205 HomoloGene: 3516 GeneCards: SLIT2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • heparin binding • protein homodimerization activity • GTPase inhibitor activity • laminin-1 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • Roundabout binding • proteoglycan binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • мембрана • extracellular region • cell surface • екзосома • клітинна мембрана • міжклітинний простір |
---|
Біологічний процес | • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • negative regulation of chemokine-mediated signaling pathway • negative regulation of neutrophil chemotaxis • negative regulation of cellular response to growth factor stimulus • chemorepulsion involved in embryonic olfactory bulb interneuron precursor migration • диференціація клітин • ureteric bud development • negative chemotaxis • negative regulation of actin filament polymerization • negative regulation of small GTPase mediated signal transduction • negative regulation of retinal ganglion cell axon guidance • negative regulation of mononuclear cell migration • corticospinal neuron axon guidance through spinal cord • negative regulation of smooth muscle cell migration • Roundabout signaling pathway • positive regulation of axonogenesis • нейробіологія розвитку • cell migration involved in sprouting angiogenesis • negative regulation of endothelial cell migration • axon guidance • multicellular organism development • хемотаксис • negative regulation of smooth muscle cell chemotaxis • cellular response to hormone stimulus • negative regulation of cell migration • negative regulation of monocyte chemotaxis • negative regulation of cell growth • response to cortisol • apoptotic process involved in luteolysis • positive regulation of apoptotic process • induction of negative chemotaxis • cellular response to heparin • motor neuron axon guidance • branching morphogenesis of an epithelial tube • negative regulation of leukocyte chemotaxis • chemorepulsion involved in postnatal olfactory bulb interneuron migration • axon extension involved in axon guidance • negative regulation of lamellipodium assembly • negative regulation of vascular permeability • retinal ganglion cell axon guidance • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • aortic valve morphogenesis • pulmonary valve morphogenesis • ventricular septum morphogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0f/PBB_GE_SLIT2_209897_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SLIT2_209897_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001289135 NM_001289136 NM_004787 |
| | NM_001291227 NM_001291228 NM_178804 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001276064 NP_001276065 NP_004778 |
| | NP_001278156 NP_001278157 NP_848919 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 20.25 – 20.62 Mb | Хр. 5: 48.14 – 48.47 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SLIT2 (англ. Slit guidance ligand 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 529 амінокислот, а молекулярна маса — 169 870[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRGVGWQMLS | | LSLGLVLAIL | | NKVAPQACPA | | QCSCSGSTVD | | CHGLALRSVP |
RNIPRNTERL | | DLNGNNITRI | | TKTDFAGLRH | | LRVLQLMENK | | ISTIERGAFQ |
DLKELERLRL | | NRNHLQLFPE | | LLFLGTAKLY | | RLDLSENQIQ | | AIPRKAFRGA |
VDIKNLQLDY | | NQISCIEDGA | | FRALRDLEVL | | TLNNNNITRL | | SVASFNHMPK |
LRTFRLHSNN | | LYCDCHLAWL | | SDWLRQRPRV | | GLYTQCMGPS | | HLRGHNVAEV |
QKREFVCSGH | | QSFMAPSCSV | | LHCPAACTCS | | NNIVDCRGKG | | LTEIPTNLPE |
TITEIRLEQN | | TIKVIPPGAF | | SPYKKLRRID | | LSNNQISELA | | PDAFQGLRSL |
NSLVLYGNKI | | TELPKSLFEG | | LFSLQLLLLN | | ANKINCLRVD | | AFQDLHNLNL |
LSLYDNKLQT | | IAKGTFSPLR | | AIQTMHLAQN | | PFICDCHLKW | | LADYLHTNPI |
ETSGARCTSP | | RRLANKRIGQ | | IKSKKFRCSA | | KEQYFIPGTE | | DYRSKLSGDC |
FADLACPEKC | | RCEGTTVDCS | | NQKLNKIPEH | | IPQYTAELRL | | NNNEFTVLEA |
TGIFKKLPQL | | RKINFSNNKI | | TDIEEGAFEG | | ASGVNEILLT | | SNRLENVQHK |
MFKGLESLKT | | LMLRSNRITC | | VGNDSFIGLS | | SVRLLSLYDN | | QITTVAPGAF |
DTLHSLSTLN | | LLANPFNCNC | | YLAWLGEWLR | | KKRIVTGNPR | | CQKPYFLKEI |
PIQDVAIQDF | | TCDDGNDDNS | | CSPLSRCPTE | | CTCLDTVVRC | | SNKGLKVLPK |
GIPRDVTELY | | LDGNQFTLVP | | KELSNYKHLT | | LIDLSNNRIS | | TLSNQSFSNM |
TQLLTLILSY | | NRLRCIPPRT | | FDGLKSLRLL | | SLHGNDISVV | | PEGAFNDLSA |
LSHLAIGANP | | LYCDCNMQWL | | SDWVKSEYKE | | PGIARCAGPG | | EMADKLLLTT |
PSKKFTCQGP | | VDVNILAKCN | | PCLSNPCKND | | GTCNSDPVDF | | YRCTCPYGFK |
GQDCDVPIHA | | CISNPCKHGG | | TCHLKEGEED | | GFWCICADGF | | EGENCEVNVD |
DCEDNDCENN | | STCVDGINNY | | TCLCPPEYTG | | ELCEEKLDFC | | AQDLNPCQHD |
SKCILTPKGF | | KCDCTPGYVG | | EHCDIDFDDC | | QDNKCKNGAH | | CTDAVNGYTC |
ICPEGYSGLF | | CEFSPPMVLP | | RTSPCDNFDC | | QNGAQCIVRI | | NEPICQCLPG |
YQGEKCEKLV | | SVNFINKESY | | LQIPSAKVRP | | QTNITLQIAT | | DEDSGILLYK |
GDKDHIAVEL | | YRGRVRASYD | | TGSHPASAIY | | SVETINDGNF | | HIVELLALDQ |
SLSLSVDGGN | | PKIITNLSKQ | | STLNFDSPLY | | VGGMPGKSNV | | ASLRQAPGQN |
GTSFHGCIRN | | LYINSELQDF | | QKVPMQTGIL | | PGCEPCHKKV | | CAHGTCQPSS |
QAGFTCECQE | | GWMGPLCDQR | | TNDPCLGNKC | | VHGTCLPINA | | FSYSCKCLEG |
HGGVLCDEEE | | DLFNPCQAIK | | CKHGKCRLSG | | LGQPYCECSS | | GYTGDSCDRE |
ISCRGERIRD | | YYQKQQGYAA | | CQTTKKVSRL | | ECRGGCAGGQ | | CCGPLRSKRR |
KYSFECTDGS | | SFVDEVEKVV | | KCGCTRCVS |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як хемотаксис, диференціація, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину. Секретований назовні.
Література
- Itoh A., Miyabayashi T., Ohno M., Sakano S. (1998). Cloning and expressions of three mammalian homologues of Drosophila slit suggest possible roles for Slit in the formation and maintenance of the nervous system. Brain Res. Mol. Brain Res. 62: 175—186. PMID 9813312 DOI:10.1016/S0169-328X(98)00224-1
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zou Y., Stoeckli E., Chen H., Tessier-Lavigne M. (2000). Squeezing axons out of the gray matter: a role for slit and semaphorin proteins from midline and ventral spinal cord. Cell. 102: 363—375. PMID 10975526 DOI:10.1016/S0092-8674(00)00041-6
- Stein E., Tessier-Lavigne M. (2001). Hierarchical organization of guidance receptors: silencing of netrin attraction by slit through a Robo/DCC receptor complex. Science. 291: 1928—1938. PMID 11239147 DOI:10.1126/science.1058445
- Wong K., Park H.T., Wu J.Y., Rao Y. (2002). Slit proteins: molecular guidance cues for cells ranging from neurons to leukocytes. Curr. Opin. Genet. Dev. 12: 583—591. PMID 12200164 DOI:10.1016/S0959-437X(02)00343-X
- Niclou S.P., Jia L., Raper J.A. (2000). Slit2 is a repellent for retinal ganglion cell axons. J. Neurosci. 20: 4962—4974. PMID 10864954
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11086 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O94813 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |