SFSWAP |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2E5Z, 2E60 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SFSWAP, SFRS8, SWAP, splicing factor SWAP homolog, splicing factor SWAP |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601945 MGI: 101760 HomoloGene: 134548 GeneCards: SFSWAP |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Альтернативний сплайсинг • transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • mRNA 5'-splice site recognition |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001261411 NM_004592 NM_152235 |
| NM_001035259 NM_172276 NM_001359952 NM_001378915 NM_001378916
| NM_001378917 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_758480 NP_001346881 NP_001365844 NP_001365845 NP_001365846 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 131.71 – 131.8 Mb | Хр. 5: 129.58 – 129.65 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SFSWAP (англ. Splicing factor SWAP homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 951 амінокислот, а молекулярна маса — 104 822[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MYGASGGRAK | | PERKSGAKEE | | AGPGGAGGGG | | SRVELLVFGY | | ACKLFRDDER |
ALAQEQGQHL | | IPWMGDHKIL | | IDRYDGRGHL | | HDLSEYDAEY | | STWNRDYQLS |
EEEARIEALC | | DEERYLALHT | | DLLEEEARQE | | EEYKRLSEAL | | AEDGSYNAVG |
FTYGSDYYDP | | SEPTEEEEPS | | KQREKNEAEN | | LEENEEPFVA | | PLGLSVPSDV |
ELPPTAKMHA | | IIERTASFVC | | RQGAQFEIML | | KAKQARNSQF | | DFLRFDHYLN |
PYYKFIQKAM | | KEGRYTVLAE | | NKSDEKKKSG | | VSSDNEDDDD | | EEDGNYLHPS |
LFASKKCNRL | | EELMKPLKVV | | DPDHPLAALV | | RKAQADSSTP | | TPHNADGAPV |
QPSQVEYTAD | | STVAAMYYSY | | YMLPDGTYCL | | APPPPGIDVT | | TYYSTLPAGV |
TVSNSPGVTT | | TAPPPPGTTP | | LPPPTTAETS | | SGATSTTTTT | | SALAPVAAII |
PPPPDVQPVI | | DKLAEYVARN | | GLKFETSVRA | | KNDQRFEFLQ | | PWHQYNAYYE |
FKKQFFLQKE | | GGDSMQAVSA | | PEEAPTDSAP | | EKPSDAGEDG | | APEDAAEVGA |
RAGSGGKKEA | | SSSKTVPDGK | | LVKASFAPIS | | FAIKAKENDL | | LPLEKNRVKL |
DDDSDDDEES | | KEGQESSSSA | | ANTNPAVAPP | | CVVVEEKKPQ | | LTQEELEAKQ |
AKQKLEDRLA | | AAAREKLAQA | | SKESKEKQLQ | | AERKRKAALF | | LQTLKNPLPE |
AEAGKIEESP | | FSVEESSTTP | | CPLLTGGRPL | | PTLEVKPPDR | | PSSKSKDPPR |
EEEKEKKKKK | | HKKRSRTRSR | | SPKYHSSSKS | | RSRSHSKAKH | | SLPSAYRTVR |
RSRSRSRSPR | | RRAHSPERRR | | EERSVPTAYR | | VSRSPGASRK | | RTRSRSPHEK |
KKKRRSRSRT | | KSKARSQSVS | | PSKQAAPRPA | | APAAHSAHSA | | SVSPVESRGS |
SQERSRGVSQ | | EKEAQISSAI | | VSSVQSKITQ | | DLMAKVRAML | | AASKNLQTSA |
S |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Sarkissian M., Winne A., Lafyatis R. (1996). The mammalian homolog of suppressor-of-white-apricot regulates alternative mRNA splicing of CD45 exon 4 and fibronectin IIICS. J. Biol. Chem. 271: 31106—31114. PMID 8940107 DOI:10.1074/jbc.271.49.31106
- Denhez F., Lafyatis R. (1994). Conservation of regulated alternative splicing and identification of functional domains in vertebrate homologs to the Drosophila splicing regulator, suppressor-of-white-apricot. J. Biol. Chem. 269: 16170—16179. PMID 8206918
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10790 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q12872 (англ.) . Архів оригіналу за 2 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |