SF3B4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1X5T, 1X5U | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SF3B4, AFD1, Hsh49, SAP49, SF3b49, splicing factor 3b subunit 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605593 MGI: 109580 HomoloGene: 134086 GeneCards: SF3B4 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Nager acrofacial dysostosis[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • U12-type spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • spliceosomal complex • ядерце • U2-type precatalytic spliceosome • Рибонуклеопротеїни |
---|
Біологічний процес | • RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 149.92 – 149.93 Mb | Хр. 3: 96.08 – 96.08 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SF3B4 (англ. Splicing factor 3b subunit 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 424 амінокислот, а молекулярна маса — 44 386[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAGPISERN | | QDATVYVGGL | | DEKVSEPLLW | | ELFLQAGPVV | | NTHMPKDRVT |
GQHQGYGFVE | | FLSEEDADYA | | IKIMNMIKLY | | GKPIRVNKAS | | AHNKNLDVGA |
NIFIGNLDPE | | IDEKLLYDTF | | SAFGVILQTP | | KIMRDPDTGN | | SKGYAFINFA |
SFDASDAAIE | | AMNGQYLCNR | | PITVSYAFKK | | DSKGERHGSA | | AERLLAAQNP |
LSQADRPHQL | | FADAPPPPSA | | PNPVVSSLGS | | GLPPPGMPPP | | GSFPPPVPPP |
GALPPGIPPA | | MPPPPMPPGA | | AGHGPPSAGT | | PGAGHPGHGH | | SHPHPFPPGG |
MPHPGMSQMQ | | LAHHGPHGLG | | HPHAGPPGSG | | GQPPPRPPPG | | MPHPGPPPMG |
MPPRGPPFGS | | PMGHPGPMPP | | HGMRGPPPLM | | PPHGYTGPPR | | PPPYGYQRGP |
LPPPRPTPRP | | PVPPRGPLRG | | PLPQ |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Champion-Arnaud P., Reed R. (1994). The prespliceosome components SAP 49 and SAP 145 interact in a complex implicated in tethering U2 snRNP to the branch site. Genes Dev. 8: 1974—1983. PMID 7958871 DOI:10.1101/gad.8.16.1974
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Das R., Zhou Z., Reed R. (2000). Functional association of U2 snRNP with the ATP-independent spliceosomal complex E. Mol. Cell. 5: 779—787. PMID 10882114 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80318-4
- Golas M.M., Sander B., Will C.L., Luhrmann R., Stark H. (2003). Molecular architecture of the multiprotein splicing factor SF3b. Science. 300: 980—984. PMID 12738865 DOI:10.1126/science.1084155
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SF3B4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10771 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q15427 (англ.) . Архів оригіналу за 11 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |