| SEMA5A |
|---|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | SEMA5A, SEMAF, semF, semaphorin 5A |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 609297 MGI: 107556 HomoloGene: 2949 GeneCards: SEMA5A |
|---|
| |
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| ожиріння, хвороба Паркінсона[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • chondroitin sulfate proteoglycan binding
• heparan sulfate proteoglycan binding
• syndecan binding
• semaphorin receptor binding
• neuropilin binding
• chemorepellent activity
|
|---|
| Клітинна компонента | • мембрана
• клітинна мембрана
• екзосома
• integral component of membrane
• міжклітинний простір
|
|---|
| Біологічний процес | • negative regulation of endothelial cell apoptotic process
• negative regulation of cell adhesion
• диференціація клітин
• positive regulation of protein kinase B signaling
• positive regulation of endothelial cell proliferation
• positive regulation of endothelial cell chemotaxis
• cell-cell signaling
• positive regulation of axon extension involved in axon guidance
• blood vessel endothelial cell proliferation involved in sprouting angiogenesis
• нейробіологія розвитку
• positive regulation of angiogenesis
• multicellular organism development
• diencephalon development
• адгезія клітин
• signal clustering
• cell chemotaxis
• positive chemotaxis
• axonal fasciculation
• positive regulation of actin filament depolymerization
• negative regulation of axon extension involved in axon guidance
• negative chemotaxis
• neural crest cell migration
• positive regulation of cell migration
• semaphorin-plexin signaling pathway
• positive regulation of canonical Wnt signaling pathway
• axon extension
• neuron projection guidance
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 5: 9.04 – 9.55 Mb | Хр. 15: 32.24 – 32.7 Mb |
|---|
| PubMed search | [2] | [3] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SEMA5A (англ. Semaphorin 5A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 074 амінокислот, а молекулярна маса — 120 615[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MKGTCVIAWL | | FSSLGLWRLA | | HPEAQGTTQC | | QRTEHPVISY | | KEIGPWLREF |
| RAKNAVDFSQ | | LTFDPGQKEL | | VVGARNYLFR | | LQLEDLSLIQ | | AVEWECDEAT |
| KKACYSKGKS | | KEECQNYIRV | | LLVGGDRLFT | | CGTNAFTPVC | | TNRSLSNLTE |
| IHDQISGMAR | | CPYSPQHNST | | ALLTAGGELY | | AATAMDFPGR | | DPAIYRSLGI |
| LPPLRTAQYN | | SKWLNEPNFV | | SSYDIGNFTY | | FFFRENAVEH | | DCGKTVFSRA |
| ARVCKNDIGG | | RFLLEDTWTT | | FMKARLNCSR | | PGEVPFYYNE | | LQSTFFLPEL |
| DLIYGIFTTN | | VNSIAASAVC | | VFNLSAIAQA | | FSGPFKYQEN | | SRSAWLPYPN |
| PNPHFQCGTV | | DQGLYVNLTE | | RNLQDAQKFI | | LMHEVVQPVT | | TVPSFMEDNS |
| RFSHVAVDVV | | QGREALVHII | | YLATDYGTIK | | KVRVPLNQTS | | SSCLLEEIEL |
| FPERRREPIR | | SLQILHSQSV | | LFVGLREHVV | | KIPLKRCQFY | | RTRSTCIGAQ |
| DPYCGWDVVM | | KKCTSLEESL | | SMTQWEQSIS | | ACPTRNLTVD | | GHFGVWSPWT |
| PCTHTDGSAV | | GSCLCRTRSC | | DSPAPQCGGW | | QCEGPGMEIA | | NCSRNGGWTP |
| WTSWSPCSTT | | CGIGFQVRQR | | SCSNPTPRHG | | GRVCVGQNRE | | ERYCNEHLLC |
| PPHMFWTGWG | | PWERCTAQCG | | GGIQARRRIC | | ENGPDCAGCN | | VEYQSCNTNP |
| CPELKKTTPW | | TPWTPVNISD | | NGGHYEQRFR | | YTCKARLADP | | NLLEVGRQRI |
| EMRYCSSDGT | | SGCSTDGLSG | | DFLRAGRYSA | | HTVNGAWSAW | | TSWSQCSRDC |
| SRGIRNRKRV | | CNNPEPKYGG | | MPCLGPSLEY | | QECNILPCPV | | DGVWSCWSPW |
| TKCSATCGGG | | HYMRTRSCSN | | PAPAYGGDIC | | LGLHTEEALC | | NTQPCPESWS |
| EWSDWSECEA | | SGVQVRARQC | | ILLFPMGSQC | | SGNTTESRPC | | VFDSNFIPEV |
| SVARSSSVEE | | KRCGEFNMFH | | MIAVGLSSSI | | LGCLLTLLVY | | TYCQRYQQQS |
| HDATVIHPVS | | PAPLNTSITN | | HINKLDKYDS | | VEAIKAFNKN | | NLILEERNKY |
| FNPHLTGKTY | | SNAYFTDLNN | | YDEY |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, поліморфізм. Локалізований у мембрані.
Література
- Simmons A.D., Puschel A.W., McPherson J.D., Overhauser J., Lovett M. (1998). Molecular cloning and mapping of human semaphorin F from the Cri-du-chat candidate interval. Biochem. Biophys. Res. Commun. 242: 685—691. PMID 9464278 DOI:10.1006/bbrc.1997.8027
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Li X., Lee A.Y. (2010). Semaphorin 5A and plexin-B3 inhibit human glioma cell motility through RhoGDIalpha-mediated inactivation of Rac1 GTPase. J. Biol. Chem. 285: 32436—32445. PMID 20696765 DOI:10.1074/jbc.M110.120451
- Sadanandam A., Rosenbaugh E.G., Singh S., Varney M., Singh R.K. (2010). Semaphorin 5A promotes angiogenesis by increasing endothelial cell proliferation, migration, and decreasing apoptosis. Microvasc. Res. 79: 1—9. PMID 19850054 DOI:10.1016/j.mvr.2009.10.005
- Li X., Law J.W., Lee A.Y. (2012). Semaphorin 5A and plexin-B3 regulate human glioma cell motility and morphology through Rac1 and the actin cytoskeleton. Oncogene. 31: 595—610. PMID 21706053 DOI:10.1038/onc.2011.256
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SEMA5A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10736 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13591 (англ.) . Архів оригіналу за 9 травня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
| На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
