SCYL2

Ідентифікатори

Символи

SCYL2, CVAK104, SCY1 like pseudokinase 2, AMCNACC, AMC4

Зовнішні ІД

OMIM: 616365 MGI: 1289172 HomoloGene: 13349 GeneCards: SCYL2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ATP binding • signaling receptor binding • protein kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі • endosome membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle • цитоплазма • ендосома • perinuclear region of cytoplasm
Біологічний процес	• receptor internalization involved in canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein phosphorylation • endosome to lysosome transport • positive regulation of clathrin-dependent endocytosis • positive regulation of receptor internalization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55681


213326

Ensembl


ENSG00000136021


ENSMUSG00000069539

UniProt


Q6P3W7


Q8CFE4

RefSeq (мРНК)


NM_017988 NM_001317784 NM_001330253 NM_001330254 NM_001330256


NM_198021 NM_001310704 NM_001358843

RefSeq (білок)


NP_001304713 NP_001317182 NP_001317183 NP_001317185 NP_060458


NP_001297633 NP_932138 NP_001345772

Локус (UCSC)

Хр. 12: 100.27 – 100.34 Mb

Хр. 10: 89.47 – 89.52 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SCYL2 (англ. SCY1 like pseudokinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 929 амінокислот, а молекулярна маса — 103 709^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESMLNKLKS	TVTKVTADVT	SAVMGNPVTR	EFDVGRHIAS	GGNGLAWKIF
NGTKKSTKQE	VAVFVFDKKL	IDKYQKFEKD	QIIDSLKRGV	QQLTRLRHPR
LLTVQHPLEE	SRDCLAFCTE	PVFASLANVL	GNWENLPSPI	SPDIKDYKLY
DVETKYGLLQ	VSEGLSFLHS	SVKMVHGNIT	PENIILNKSG	AWKIMGFDFC
VSSTNPSEQE	PKFPCKEWDP	NLPSLCLPNP	EYLAPEYILS	VSCETASDMY
SLGTVMYAVF	NKGKPIFEVN	KQDIYKSFSR	QLDQLSRLGS	SSLTNIPEEV
REHVKLLLNV	TPTVRPDADQ	MTKIPFFDDV	GAVTLQYFDT	LFQRDNLQKS
QFFKGLPKVL	PKLPKRVIVQ	RILPCLTSEF	VNPDMVPFVL	PNVLLIAEEC
TKEEYVKLIL	PELGPVFKQQ	EPIQILLIFL	QKMDLLLTKT	PPDEIKNSVL
PMVYRALEAP	SIQIQELCLN	IIPTFANLID	YPSMKNALIP	RIKNACLQTS
SLAVRVNSLV	CLGKILEYLD	KWFVLDDILP	FLQQIPSKEP	AVLMGILGIY
KCTFTHKKLG	ITKEQLAGKV	LPHLIPLSIE	NNLNLNQFNS	FISVIKEMLN
RLESEHKTKL	EQLHIMQEQQ	KSLDIGNQMN	VSEEMKVTNI	GNQQIDKVFN
NIGADLLTGS	ESENKEDGLQ	NKHKRASLTL	EEKQKLAKEQ	EQAQKLKSQQ
PLKPQVHTPV	ATVKQTKDLT	DTLMDNMSSL	TSLSVSTPKS	SASSTFTSVP
SMGIGMMFST	PTDNTKRNLT	NGLNANMGFQ	TSGFNMPVNT	NQNFYSSPST
VGVTKMTLGT	PPTLPNFNAL	SVPPAGAKQT	QQRPTDMSAL	NNLFGPQKPK
VSMNQLSQQK	PNQWLNQFVP	PQGSPTMGSS	VMGTQMNVIG	QSAFGMQGNP
FFNPQNFAQP	PTTMTNSSSA	SNDLKDLFG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
Conner S.D., Schmid S.L. (2005). CVAK104 is a novel poly-L-lysine-stimulated kinase that targets the beta2-subunit of AP2. J. Biol. Chem. 280: 21539—21544. PMID 15809293 DOI:10.1074/jbc.M502462200
Duewel M., Ungewickell E.J. (2006). Clathrin-dependent association of CVAK104 with endosomes and the trans-Golgi network. Mol. Biol. Cell. 17: 4513—4525. PMID 16914521 DOI:10.1091/mbc.E06-05-0390

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19286 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q6P3W7 (англ.) . Архів оригіналу за 1 січня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.