SART1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SART1, Ara1, HOMS1, SART1259, SNRNP110, Snu66, squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 1, HAF, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, spliceosome associated factor 1, recruiter of U4/U6.U5 tri-snRNP |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605941 MGI: 1309453 HomoloGene: 133770 GeneCards: SART1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • Тільце Кахаля • комплекс Ґольджі • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck • U2-type precatalytic spliceosome |
---|
Біологічний процес | • mRNA cis splicing, via spliceosome • positive regulation of cytotoxic T cell differentiation • intrinsic apoptotic signaling pathway • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • maturation of 5S rRNA • spliceosomal snRNP assembly • Сплайсинг РНК |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 65.96 – 65.98 Mb | Хр. 19: 5.43 – 5.44 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SART1 (англ. SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 800 амінокислот, а молекулярна маса — 90 255[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGSSKKHRGE | | KEAAGTTAAA | | GTGGATEQPP | | RHREHKKHKH | | RSGGSGGSGG |
ERRKRSRERG | | GERGSGRRGA | | EAEARSSTHG | | RERSQAEPSE | | RRVKREKRDD |
GYEAAASSKT | | SSGDASSLSI | | EETNKLRAKL | | GLKPLEVNAI | | KKEAGTKEEP |
VTADVINPMA | | LRQREELREK | | LAAAKEKRLL | | NQKLGKIKTL | | GEDDPWLDDT |
AAWIERSRQL | | QKEKDLAEKR | | AKLLEEMDQE | | FGVSTLVEEE | | FGQRRQDLYS |
ARDLQGLTVE | | HAIDSFREGE | | TMILTLKDKG | | VLQEEEDVLV | | NVNLVDKERA |
EKNVELRKKK | | PDYLPYAEDE | | SVDDLAQQKP | | RSILSKYDEE | | LEGERPHSFR |
LEQGGTADGL | | RERELEEIRA | | KLRLQAQSLS | | TVGPRLASEY | | LTPEEMVTFK |
KTKRRVKKIR | | KKEKEVVVRA | | DDLLPLGDQT | | QDGDFGSRLR | | GRGRRRVSEV |
EEEKEPVPQP | | LPSDDTRVEN | | MDISDEEEGG | | APPPGSPQVL | | EEDEAELELQ |
KQLEKGRRLR | | QLQQLQQLRD | | SGEKVVEIVK | | KLESRQRGWE | | EDEDPERKGA |
IVFNATSEFC | | RTLGEIPTYG | | LAGNREEQEE | | LMDFERDEER | | SANGGSESDG |
EENIGWSTVN | | LDEEKQQQDF | | SASSTTILDE | | EPIVNRGLAA | | ALLLCQNKGL |
LETTVQKVAR | | VKAPNKSLPS | | AVYCIEDKMA | | IDDKYSRREE | | YRGFTQDFKE |
KDGYKPDVKI | | EYVDETGRKL | | TPKEAFRQLS | | HRFHGKGSGK | | MKTERRMKKL |
DEEALLKKMS | | SSDTPLGTVA | | LLQEKQKAQK | | TPYIVLSGSG | | KSMNANTITK |
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Makarova O.V., Makarov E.M., Luehrmann R. (2001). The 65 and 110 kDa SR-related proteins of the U4/U6*U5 tri-snRNP are essential for the assembly of mature spliceosomes. EMBO J. 20: 2553—2563. PMID 11350945 DOI:10.1093/emboj/20.10.2553
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bolland D.J., Hewitt J.E. (2001). Intron loss in the SART1 genes of Fugu rubripes and Tetraodon nigroviridis. Gene. 271: 43—49. PMID 11410364 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00504-2
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10538 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O43290 (англ.) . Архів оригіналу за 6 листопада 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |