SARNP

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DO1

Ідентифікатори

Символи

SARNP, CIP29, HCC1, HSPC316, THO1, SAP domain containing ribonucleoprotein

Зовнішні ІД

OMIM: 610049 MGI: 1913368 HomoloGene: 41628 GeneCards: SARNP

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • protein C-terminus binding • RS domain binding
Клітинна компонента	• nuclear speck • transcription export complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • cytoplasmic ribonucleoprotein granule
Біологічний процес	• mRNA transport • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of translation • transcription, DNA-templated • RNA export from nucleus • mRNA export from nucleus • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA 3'-end processing • GO:0015915 транспорт • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84324


66118

Ensembl


н/д


ENSMUSG00000078427

UniProt


P82979


Q9D1J3

RefSeq (мРНК)


NM_033082


NM_025364

RefSeq (білок)


NP_149073

NP_079640 NP_001346332 NP_001346333 NP_001346334 NP_001346335
NP_001346336

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 10: 128.82 – 128.88 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SARNP (англ. SAP domain containing ribonucleoprotein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 210 амінокислот, а молекулярна маса — 23 671^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATETVELHK	LKLAELKQEC	LARGLETKGI	KQDLIHRLQA	YLEEHAEEEA
NEEDVLGDET	EEEETKPIEL	PVKEEEPPEK	TVDVAAEKKV	VKITSEIPQT
ERMQKRAERF	NVPVSLESKK	AARAARFGIS	SVPTKGLSSD	NKPMVNLDKL
KERAQRFGLN	VSSISRKSED	DEKLKKRKER	FGIVTSSAGT	GTTEDTEAKK
RKRAERFGIA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Fukuda S., Wu D.W., Stark K., Pelus L.M. (2002). Cloning and characterization of a proliferation-associated cytokine-inducible protein, CIP29. Biochem. Biophys. Res. Commun. 292: 593—600. PMID 11922608 DOI:10.1006/bbrc.2002.6680
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Leaw C.L., Ren E.C., Choong M.L. (2004). Hcc-1 is a novel component of the nuclear matrix with growth inhibitory function. Cell. Mol. Life Sci. 61: 2264—2273. PMID 15338056 DOI:10.1007/s00018-004-4205-x
Sugiura T., Sakurai K., Nagano Y. (2007). Intracellular characterization of DDX39, a novel growth-associated RNA helicase. Exp. Cell Res. 313: 782—790. PMID 17196963 DOI:10.1016/j.yexcr.2006.11.014

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24432 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P82979 (англ.) . Архів оригіналу за 28 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.