RREB1

Ідентифікатори

Символи

RREB1, FINB, HNT, LZ321, RREB-1, Zep-1, ras responsive element binding protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602209 MGI: 2443664 HomoloGene: 2218 GeneCards: RREB1

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• ядерні тільця • екзосома • fibrillar center • клітинне ядро • цитоплазма • nuclear speck
Біологічний процес	• positive regulation of mammary gland epithelial cell proliferation • positive regulation of lamellipodium morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of epithelial cell migration • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • Ras protein signal transduction • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of wound healing, spreading of epidermal cells • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6239


68750

Ensembl


ENSG00000124782


ENSMUSG00000039087

UniProt


Q92766


Q3UH06

RefSeq (мРНК)


NM_001003698 NM_001003699 NM_001003700 NM_001168344 NM_002955


NM_001013392 NM_001039188 NM_001177868 NM_001177869 NM_026830

RefSeq (білок)

NP_001003698 NP_001003699 NP_001003700 NP_001161816 NP_001003698.1
NP_001161816.1

NP_001034277 NP_001171339 NP_001171340 NP_081106 NP_001391686
NP_001391687 NP_001391688 NP_001391689

Локус (UCSC)

Хр. 6: 7.11 – 7.25 Mb

Хр. 13: 37.96 – 38.14 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RREB1 (англ. Ras responsive element binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 687 амінокислот, а молекулярна маса — 181 420^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSSSPAGLE	GSDLSSINTM	MSAVMSVGKV	TENGGSPQGI	KSPSKPPGPN
RIGRRNQETK	EEKSSYNCPL	CEKICTTQHQ	LTMHIRQHNT	DTGGADHSCS
ICGKSLSSAS	SLDRHMLVHS	GERPYKCTVC	GQSFTTNGNM	HRHMKIHEKD
PNSATATAPP	SPLKRRRLSS	KRKLSHDAES	EREDPAPAKK	MVEDGQSGDL
EKKADEVFHC	PVCFKEFVCK	YGLETHMETH	SDNPLRCDIC	CVTFRTHRGL
LRHNALVHKQ	LPRDAMGRPF	IQNNPSIPAG	FHDLGFTDFS	CRKFPRISQA
WCETNLRRCI	SEQHRFVCDT	CDKAFPMLCS	LALHKQTHVA	ADQGQEKPQA
TPLPGDALDQ	KGFLALLGLQ	HTKDVRPAPA	EEPLPDDNQA	IQLQTLKCQL
PQDPGCTNLL	SLSPFEAASL	GGSLTVLPAT	KDSIKHLSLQ	PFQKGFIIQP
DSSIVVKPIS	GESAIELADI	QQILKMAASA	PPQISLPPFS	KAPAAPLQAI
FKHMPPLKPK	PLVTPRTVVA	TSTPPPLINA	QQASPGCISP	SLPPPPLKLL
KGSVEAASNA	HLLQSKSGTQ	PHAATRLSLQ	QPRAELPGQP	EMKTQLEQDS
IIEALLPLSM	EAKIKQEITE	GELKAFMTAP	GGKKTPAMRK	VLYPCRFCNQ
VFAFSGVLRA	HVRSHLGISP	YQCNICDYIA	ADKAALIRHL	RTHSGERPYI
CKICHYPFTV	KANCERHLRK	KHLKATRKDI	EKNIEYVSSS	AAELVDAFCA
PDTVCRLCGE	DLKHYRALRI	HMRTHCGRGL	GGGHKGRKPF	ECKECSAAFA
AKRNCIHHIL	KQHLHVPEQD	IESYVLAADG	LGPAEAPAAE	ASGRGEDSGC
AALGDCKPLT	AFLEPQNGFL	HRGPTQPPPP	HVSIKLEPAS	SFAVDFNEPL
DFSQKGLALV	QVKQENISFL	SPSSLVPYDC	SMEPIDLSIP	KNFRKGDKDL
ATPSEAKKPE	EEAGSSEQPS	PCPAPGPSLP	VTLGPSGILE	SPMAPAPAAT
PEPPAQPLQG	PVQLAVPIYS	SALVSSPPLV	GSSALLSGTA	LLRPLRPKPP
LLLPKPPVTE	ELPPLASIAQ	IISSVSSAPT	LLKTKVADPG	PASTGSNTTA
SDSLGGSVPK	AATTATPAAT	TSPKESSEPP	APASSPEAAS	PTEQGPAGTS
KKRGRKRGMR	SRPRANSGGV	DLDSSGEFAS	IEKMLATTDT	NKFSPFLQTA
EDNTQDEVAG	APADHHGPSD	EEQGSPPEDK	LLRAKRNSYT	NCLQKITCPH
CPRVFPWASS	LQRHMLTHTD	SQSDAETAAA	AGEVLDLTSR	DREQPSEGAT
ELRQVAGDAP	VEQATAETAS	PVHREEHGRG	ESHEPEEEHG	TEESTGDADG
AEEDASSNQS	LDLDFATKLM	DFKLAEGDGE	AGAGGAASQE	QKLACDTCGK
SFKFLGTLSR	HRKAHGRQEP	KDEKGDGAST	AEEGPQPAPE	QEEKPPETPA
EVVESAPGAG	EAPAEKLAEE	TEGPSDGESA	AEKRSSEKSD	DDKKPKTDSP
KSVASKADKR	KKVCSVCNKR	FWSLQDLTRH	MRSHTGERPY	KCQTCERTFT
LKHSLVRHQR	IHQKARHAKH	HGKDSDKEER	GEEDSENEST	HSGNNAVSEN
EAELAPNASN	HMAVTRSRKE	GLASATKDCS	HREEKVTAGW	PSEPGQGDLN
PESPAALGQD	LLEPRSKRPA	HPILATADGA	SQLVGME

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Fujimoto-Nishiyama A., Ishii S., Matsuda S., Inoue J., Yamamoto T. (1997). A novel zinc finger protein, Finb, is a transcriptional activator and localized in nuclear bodies. Gene. 195: 267—275. PMID 9305772 DOI:10.1016/S0378-1119(97)00172-8
Nitz M.D., Harding M.A., Smith S.C., Thomas S., Theodorescu D. (2011). RREB1 transcription factor splice variants in urologic cancer. Am. J. Pathol. 179: 477—486. PMID 21703425 DOI:10.1016/j.ajpath.2011.03.038
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang L., Zhao J., Edenberg H.J. (1999). A human Raf-responsive zinc-finger protein that binds to divergent sequences. Nucleic Acids Res. 27: 2947—2956. PMID 10390538 DOI:10.1093/nar/27.14.2947
Ray S.K., Nishitani J., Petry M.W., Fessing M.Y., Leiter A.B. (2003). Novel transcriptional potentiation of BETA2/NeuroD on the secretin gene promoter by the DNA-binding protein Finb/RREB-1. Mol. Cell. Biol. 23: 259—271. PMID 12482979 DOI:10.1128/MCB.23.1.259-271.2003
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з RREB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10449 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q92766 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.