RREB1
RREB1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | RREB1, FINB, HNT, LZ321, RREB-1, Zep-1, ras responsive element binding protein 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602209 MGI: 2443664 HomoloGene: 2218 GeneCards: RREB1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
розсіяний склероз, макулодистрофія[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 7.11 – 7.25 Mb | Хр. 13: 37.96 – 38.14 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
RREB1 (англ. Ras responsive element binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 687 амінокислот, а молекулярна маса — 181 420[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MTSSSPAGLE | GSDLSSINTM | MSAVMSVGKV | TENGGSPQGI | KSPSKPPGPN | ||||
RIGRRNQETK | EEKSSYNCPL | CEKICTTQHQ | LTMHIRQHNT | DTGGADHSCS | ||||
ICGKSLSSAS | SLDRHMLVHS | GERPYKCTVC | GQSFTTNGNM | HRHMKIHEKD | ||||
PNSATATAPP | SPLKRRRLSS | KRKLSHDAES | EREDPAPAKK | MVEDGQSGDL | ||||
EKKADEVFHC | PVCFKEFVCK | YGLETHMETH | SDNPLRCDIC | CVTFRTHRGL | ||||
LRHNALVHKQ | LPRDAMGRPF | IQNNPSIPAG | FHDLGFTDFS | CRKFPRISQA | ||||
WCETNLRRCI | SEQHRFVCDT | CDKAFPMLCS | LALHKQTHVA | ADQGQEKPQA | ||||
TPLPGDALDQ | KGFLALLGLQ | HTKDVRPAPA | EEPLPDDNQA | IQLQTLKCQL | ||||
PQDPGCTNLL | SLSPFEAASL | GGSLTVLPAT | KDSIKHLSLQ | PFQKGFIIQP | ||||
DSSIVVKPIS | GESAIELADI | QQILKMAASA | PPQISLPPFS | KAPAAPLQAI | ||||
FKHMPPLKPK | PLVTPRTVVA | TSTPPPLINA | QQASPGCISP | SLPPPPLKLL | ||||
KGSVEAASNA | HLLQSKSGTQ | PHAATRLSLQ | QPRAELPGQP | EMKTQLEQDS | ||||
IIEALLPLSM | EAKIKQEITE | GELKAFMTAP | GGKKTPAMRK | VLYPCRFCNQ | ||||
VFAFSGVLRA | HVRSHLGISP | YQCNICDYIA | ADKAALIRHL | RTHSGERPYI | ||||
CKICHYPFTV | KANCERHLRK | KHLKATRKDI | EKNIEYVSSS | AAELVDAFCA | ||||
PDTVCRLCGE | DLKHYRALRI | HMRTHCGRGL | GGGHKGRKPF | ECKECSAAFA | ||||
AKRNCIHHIL | KQHLHVPEQD | IESYVLAADG | LGPAEAPAAE | ASGRGEDSGC | ||||
AALGDCKPLT | AFLEPQNGFL | HRGPTQPPPP | HVSIKLEPAS | SFAVDFNEPL | ||||
DFSQKGLALV | QVKQENISFL | SPSSLVPYDC | SMEPIDLSIP | KNFRKGDKDL | ||||
ATPSEAKKPE | EEAGSSEQPS | PCPAPGPSLP | VTLGPSGILE | SPMAPAPAAT | ||||
PEPPAQPLQG | PVQLAVPIYS | SALVSSPPLV | GSSALLSGTA | LLRPLRPKPP | ||||
LLLPKPPVTE | ELPPLASIAQ | IISSVSSAPT | LLKTKVADPG | PASTGSNTTA | ||||
SDSLGGSVPK | AATTATPAAT | TSPKESSEPP | APASSPEAAS | PTEQGPAGTS | ||||
KKRGRKRGMR | SRPRANSGGV | DLDSSGEFAS | IEKMLATTDT | NKFSPFLQTA | ||||
EDNTQDEVAG | APADHHGPSD | EEQGSPPEDK | LLRAKRNSYT | NCLQKITCPH | ||||
CPRVFPWASS | LQRHMLTHTD | SQSDAETAAA | AGEVLDLTSR | DREQPSEGAT | ||||
ELRQVAGDAP | VEQATAETAS | PVHREEHGRG | ESHEPEEEHG | TEESTGDADG | ||||
AEEDASSNQS | LDLDFATKLM | DFKLAEGDGE | AGAGGAASQE | QKLACDTCGK | ||||
SFKFLGTLSR | HRKAHGRQEP | KDEKGDGAST | AEEGPQPAPE | QEEKPPETPA | ||||
EVVESAPGAG | EAPAEKLAEE | TEGPSDGESA | AEKRSSEKSD | DDKKPKTDSP | ||||
KSVASKADKR | KKVCSVCNKR | FWSLQDLTRH | MRSHTGERPY | KCQTCERTFT | ||||
LKHSLVRHQR | IHQKARHAKH | HGKDSDKEER | GEEDSENEST | HSGNNAVSEN | ||||
EAELAPNASN | HMAVTRSRKE | GLASATKDCS | HREEKVTAGW | PSEPGQGDLN | ||||
PESPAALGQD | LLEPRSKRPA | HPILATADGA | SQLVGME |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Fujimoto-Nishiyama A., Ishii S., Matsuda S., Inoue J., Yamamoto T. (1997). A novel zinc finger protein, Finb, is a transcriptional activator and localized in nuclear bodies. Gene. 195: 267—275. PMID 9305772 DOI:10.1016/S0378-1119(97)00172-8
- Nitz M.D., Harding M.A., Smith S.C., Thomas S., Theodorescu D. (2011). RREB1 transcription factor splice variants in urologic cancer. Am. J. Pathol. 179: 477—486. PMID 21703425 DOI:10.1016/j.ajpath.2011.03.038
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhang L., Zhao J., Edenberg H.J. (1999). A human Raf-responsive zinc-finger protein that binds to divergent sequences. Nucleic Acids Res. 27: 2947—2956. PMID 10390538 DOI:10.1093/nar/27.14.2947
- Ray S.K., Nishitani J., Petry M.W., Fessing M.Y., Leiter A.B. (2003). Novel transcriptional potentiation of BETA2/NeuroD on the secretin gene promoter by the DNA-binding protein Finb/RREB-1. Mol. Cell. Biol. 23: 259—271. PMID 12482979 DOI:10.1128/MCB.23.1.259-271.2003
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з RREB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10449 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q92766 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 6
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |