ROBO2

ROBO2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1UEM, 1UJT, 2EDJ

Ідентифікатори
Символи ROBO2, SAX3, roundabout guidance receptor 2
Зовнішні ІД OMIM: 602431 MGI: 1890110 HomoloGene: 43188 GeneCards: ROBO2
Пов'язані генетичні захворювання
періодонтит[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• identical protein binding
• axon guidance receptor activity

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• мембрана
• cell surface
• axolemma
• екзосома
• клітинна мембрана

Біологічний процес

• диференціація клітин
• ureteric bud development
• розвиток нирки
• negative regulation of synapse assembly
• Roundabout signaling pathway
• positive regulation of axonogenesis
• нейробіологія розвитку
• multicellular organism development
• хемотаксис
• central nervous system development
• cellular response to hormone stimulus
• olfactory bulb interneuron development
• apoptotic process involved in luteolysis
• negative regulation of negative chemotaxis
• axon midline choice point recognition
• metanephros development
• homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
• retinal ganglion cell axon guidance
• brain development
• spinal cord development
• axon guidance
• outflow tract septum morphogenesis
• aortic valve morphogenesis
• pulmonary valve morphogenesis
• endocardial cushion formation
• positive regulation of Notch signaling pathway involved in heart induction
• aorta development
• ventricular septum morphogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6092
268902
Ensembl
ENSG00000185008
ENSMUSG00000052516
UniProt
Q9HCK4
Q7TPD3
RefSeq (мРНК)
NM_001128929
NM_001290039
NM_001290040
NM_001290065
NM_002942
NM_001378190
NM_001378191
NM_001378192
NM_001378193
NM_001378194
NM_001378195
NM_001378196
NM_001378197
NM_001378198
NM_001378199
NM_001378200
NM_001378201
NM_001378202
NM_001378203
NM_001394212
NM_001394213
NM_001394214
NM_001395656
NM_001395657
NM_175549
NM_001358490
NM_001358491
NM_001358492
NM_001358493
NM_001358494
RefSeq (білок)
NP_001122401
NP_001276968
NP_001276969
NP_001276994
NP_002933
NP_001365119
NP_001365120
NP_001365121
NP_001365122
NP_001365123
NP_001365124
NP_001365125
NP_001365126
NP_001365127
NP_001365128
NP_001365129
NP_001365130
NP_001365131
NP_001365132
н/д
Локус (UCSC) Хр. 3: 75.91 – 77.65 Mb Хр. 16: 73.69 – 74.21 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ROBO2 (англ. Roundabout guidance receptor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 378 амінокислот, а молекулярна маса — 151 200[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTL
NCKAEGRPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRR
SKPDEGSYVCVARNYLGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPA
ILECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRIDDKEERISIRGGKLMISNTRKSDAGM
YTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRRPINQVVLEEEAVEFRCQVQG
DPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGTYMCIAENRVG
KMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKE
GSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSI
LAKAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVIS
WLKEGFTFPGRDPRATIQEQGTLQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWS
AVLDVTESGATISKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTL
PASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRPNTIYLFMVRAINP
QGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPT
TVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLV
NLKKGVTYEIKVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGS
YNSTSISVSWDPPPPDHQNGIIQEYKIWCLGNETRFHINKTVDAAIRSVI
IGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQPIIIGRRNEVVITENNNSITE
QITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKGLSNYAVTFQRG
DGGLMSNGSRPGLLNAGDPSYPWLADSWPATSLPVNNSNSGPNEIGNFGR
GDVLPPVPGQGDKTATMLSDGAIYSSIDFTTKTSYNSSSQITQATPYATT
QILHSNSIHELAVDLPDPQWKSSIQQKTDLMGFGYSLPDQNKGNNGGKGG
KKKKNKNSSKPQKNNGSTWANVPLPPPPVQPLPGTELEHYAVEQQENGYD
SDSWCPPLPVQTYLHQGLEDELEEDDDRVPTPPVRGVASSPAISFGQQST
ATLTPSPREEMQPMLQAHLDELTRAYQFDIAKQTWHIQSNNQPPQPPVPP
LGYVSGALISDLETDVADDDADDEEEALEIPRPLRALDQTPGSSMDNLDS
SVTGKAFTSSQRPRPTSPFSTDSNTSAALSQSQRPRPTKKHKGGRMDQQP
ALPHRREGMTDEEALVPYSKPSFPSPGGHSSSGTASSKGSTGPRKTEVLR
AGHQRNASDLLDIGYMGSNSQGQFTGEL

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як хемотаксис, диференціація, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

  • Yue Y., Grossmann B., Galetzka D., Zechner U., Haaf T. (2006). Isolation and differential expression of two isoforms of the ROBO2/Robo2 axon guidance receptor gene in humans and mice. Genomics. 88: 772—778. PMID 16829019 DOI:10.1016/j.ygeno.2006.05.011
  • Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ROBO2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10250 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. ↑ UniProt, Q9HCK4 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.