RNF7 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RNF7, CKBBP1, ROC2, SAG, ring finger protein 7, rbx2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603863 MGI: 1337096 HomoloGene: 84476 GeneCards: RNF7 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
гепатит C[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • copper ion binding • cullin family protein binding • зв'язування з іоном металу • NEDD8 transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity |
---|
Клітинна компонента | • нуклеоплазма • клітинне ядро • Cul5-RING ubiquitin ligase complex • цитоплазма • гіалоплазма • Cul2-RING ubiquitin ligase complex • Cul3-RING ubiquitin ligase complex • Cul7-RING ubiquitin ligase complex • nuclear SCF ubiquitin ligase complex • Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex • cullin-RING ubiquitin ligase complex |
---|
Біологічний процес | • response to redox state • Убіквітин-залежний протеоліз • protein neddylation • посттрансляційна модифікація • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/01/PBB_GE_RNF7_218286_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_RNF7_218286_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001201370 NM_014245 NM_183063 NM_183237 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001188299 NP_055060 NP_899060 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 141.74 – 141.75 Mb | Хр. 9: 96.35 – 96.36 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RNF7 (англ. Ring finger protein 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 113 амінокислот, а молекулярна маса — 12 683[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MADVEDGEET | | CALASHSGSS | | GSKSGGDKMF | | SLKKWNAVAM | | WSWDVECDTC |
AICRVQVMDA | | CLRCQAENKQ | | EDCVVVWGEC | | NHSFHNCCMS | | LWVKQNNRCP |
LCQQDWVVQR | | IGK |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Ohta T., Michel J.J., Schottelius A.J., Xiong Y. (1999). ROC1, a homolog of APC11, represents a family of cullin partners with an associated ubiquitin ligase activity. Mol. Cell. 3: 535—541. PMID 10230407 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80482-7
- Swaroop M., Gosink M., Sun Y. (2001). SAG/ROC2/Rbx2/Hrt2, a component of SCF E3 ubiquitin ligase: genomic structure, a splicing variant, and two family pseudogenes. DNA Cell Biol. 20: 425—434. PMID 11506706 DOI:10.1089/104454901750361488
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kim Y.-S., Lee J.-Y., Son M.-Y., Park W., Bae Y.-S. (2003). Phosphorylation of threonine 10 on CKBBP1/SAG/ROC2/Rbx2 by protein kinase CKII promotes the degradation of IkappaBalpha and p27Kip1. J. Biol. Chem. 278: 28462—28469. PMID 12748192 DOI:10.1074/jbc.M302584200
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з RNF7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10070 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UBF6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |