RNF7

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2ECL

Ідентифікатори

Символи

RNF7, CKBBP1, ROC2, SAG, ring finger protein 7, rbx2

Зовнішні ІД

OMIM: 603863 MGI: 1337096 HomoloGene: 84476 GeneCards: RNF7

Пов'язані генетичні захворювання

гепатит C^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • copper ion binding • cullin family protein binding • зв'язування з іоном металу • NEDD8 transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • клітинне ядро • Cul5-RING ubiquitin ligase complex • цитоплазма • гіалоплазма • Cul2-RING ubiquitin ligase complex • Cul3-RING ubiquitin ligase complex • Cul7-RING ubiquitin ligase complex • nuclear SCF ubiquitin ligase complex • Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex • cullin-RING ubiquitin ligase complex
Біологічний процес	• response to redox state • Убіквітин-залежний протеоліз • protein neddylation • посттрансляційна модифікація • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9616


19823

Ensembl


ENSG00000114125


ENSMUSG00000051234

UniProt


Q9UBF6


Q9WTZ1

RefSeq (мРНК)


NM_001201370 NM_014245 NM_183063 NM_183237


NM_011279 NM_001311135

RefSeq (білок)


NP_001188299 NP_055060 NP_899060


NP_001298064 NP_035409

Локус (UCSC)

Хр. 3: 141.74 – 141.75 Mb

Хр. 9: 96.35 – 96.36 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RNF7 (англ. Ring finger protein 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 113 амінокислот, а молекулярна маса — 12 683^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADVEDGEET	CALASHSGSS	GSKSGGDKMF	SLKKWNAVAM	WSWDVECDTC
AICRVQVMDA	CLRCQAENKQ	EDCVVVWGEC	NHSFHNCCMS	LWVKQNNRCP
LCQQDWVVQR	IGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

W: Триптофан

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Ohta T., Michel J.J., Schottelius A.J., Xiong Y. (1999). ROC1, a homolog of APC11, represents a family of cullin partners with an associated ubiquitin ligase activity. Mol. Cell. 3: 535—541. PMID 10230407 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80482-7
Swaroop M., Gosink M., Sun Y. (2001). SAG/ROC2/Rbx2/Hrt2, a component of SCF E3 ubiquitin ligase: genomic structure, a splicing variant, and two family pseudogenes. DNA Cell Biol. 20: 425—434. PMID 11506706 DOI:10.1089/104454901750361488
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kim Y.-S., Lee J.-Y., Son M.-Y., Park W., Bae Y.-S. (2003). Phosphorylation of threonine 10 on CKBBP1/SAG/ROC2/Rbx2 by protein kinase CKII promotes the degradation of IkappaBalpha and p27Kip1. J. Biol. Chem. 278: 28462—28469. PMID 12748192 DOI:10.1074/jbc.M302584200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з RNF7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10070 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UBF6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.