RNF38

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1X4J, 4V3K, 4V3L

Ідентифікатори

Символи

RNF38, ring finger protein 38

Зовнішні ІД

OMIM: 612488 MGI: 1920719 HomoloGene: 32550 GeneCards: RNF38

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity
Клітинна компонента	• sperm flagellum • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• male gonad development • Убіквітин-залежний протеоліз • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


152006


73469

Ensembl


ENSG00000137075


ENSMUSG00000035696

UniProt


Q9H0F5


Q8BI21

RefSeq (мРНК)

NM_022781 NM_194328 NM_194329 NM_194330 NM_194331
NM_194332

NM_001038993 NM_175201 NM_001355181 NM_001379574 NM_001379575
NM_001379576 NM_001379577 NM_001379578 NM_001379579 NM_001379580 NM_001379581

RefSeq (білок)


NP_073618 NP_919309 NP_919310 NP_919311 NP_919313

NP_001034082 NP_780410 NP_001342110 NP_001366503 NP_001366504
NP_001366505 NP_001366506 NP_001366507 NP_001366508 NP_001366509 NP_001366510

Локус (UCSC)

Хр. 9: 36.34 – 36.49 Mb

Хр. 4: 44.13 – 44.23 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RNF38 (англ. Ring finger protein 38) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 515 амінокислот, а молекулярна маса — 57 595^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MACKISPGAN	SASLPGHPNK	VICERVRLQS	LFPLLPSDQN	TTVQEDAHFK
AFFQSEDSPS	PKRQRLSHSV	FDYTSASPAP	SPPMRPWEMT	SNRQPPSVRP
SQHHFSGERC	NTPARNRRSP	PVRRQRGRRD	RLSRHNSISQ	DENYHHLPYA
QQQAIEEPRA	FHPPNVSPRL	LHPAAHPPQQ	NAVMVDIHDQ	LHQGTVPVSY
TVTTVAPHGI	PLCTGQHIPA	CSTQQVPGCS	VVFSGQHLPV	CSVPPPMLQA
CSVQHLPVPY	AAFPPLISSD	PFLIHPPHLS	PHHPPHLPPP	GQFVPFQTQQ
SRSPLQRIEN	EVELLGEHLP	VGGFTYPPSA	HPPTLPPSAP	LQFLTHDPLH
QEVSFGVPYP	PFMPRRLTGR	SRYRSQQPIP	PPPYHPSLLP	YVLSMLPVPP
AVGPTFSFEL	DVEDGEVENY	EALLNLAERL	GEAKPRGLTK	ADIEQLPSYR
FNPNNHQSEQ	TLCVVCMCDF	ESRQLLRVLP	CNHEFHAKCV	DKWLKANRTC
PICRADASEV	HRDSE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Sheren J.E., Kassenbrock C.K. (2013). RNF38 encodes a nuclear ubiquitin protein ligase that modifies p53. Biochem. Biophys. Res. Commun. 440: 473—478. PMID 23973461 DOI:10.1016/j.bbrc.2013.08.031

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18052 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H0F5 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.