RIF1

RIF1
Ідентифікатори
Символи RIF1, replication timing regulatory factor 1
Зовнішні ІД OMIM: 608952 MGI: 1098622 HomoloGene: 41231 GeneCards: RIF1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0001948, GO:0016582 protein binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• теломера
• клітинна мембрана
• веретено поділу
• male pronucleus
• female pronucleus
• клітинне ядро
• цитоскелет
• нуклеоплазма
• хромосома
• condensed chromosome
• ядерні тільця
• ядерна мембрана
• spindle midzone
• site of double-strand break

Біологічний процес

• stem cell population maintenance
• клітинний цикл
• double-strand break repair via nonhomologous end joining
• GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• telomere maintenance
• telomere maintenance in response to DNA damage
• positive regulation of histone H3-K9 methylation
• cellular response to DNA damage stimulus
• positive regulation of isotype switching
• negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination
• positive regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining
• GO:0100026 Репарація ДНК
• cellular response to leukemia inhibitory factor

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
55183
51869
Ensembl
ENSG00000080345
ENSMUSG00000036202
UniProt
Q5UIP0
Q6PR54
RefSeq (мРНК)
NM_001177663
NM_001177664
NM_001177665
NM_018151
NM_175238
NM_001355414
NM_001355415
RefSeq (білок)
NP_001171134
NP_001171135
NP_001171136
NP_060621
NP_780447
NP_001342343
NP_001342344
Локус (UCSC) Хр. 2: 151.41 – 151.51 Mb Хр. 2: 51.96 – 52.01 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RIF1 (англ. Replication timing regulatory factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 472 амінокислот, а молекулярна маса — 274 466[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTARGQSPLAPLLETLEDPSASHGGQTDAYLTLTSRMTGEEGKEVITEIE
KKLPRLYKVLKTHISSQNSELSSAALQALGFCLYNPKITSELSEANALEL
LSKLNDTIKNSDKNVRTRALWVISKQTFPSEVVGKMVSSIIDSLEILFNK
GETHSAVVDFEALNVIVRLIEQAPIQMGEEAVRWAKLVIPLVVHSAQKVH
LRGATALEMGMPLLLQKQQEIASITEQLMTTKLISELQKLFMSKNETYVL
KLWPLFVKLLGRTLHRSGSFINSLLQLEELGFRSGAPMIKKIAFIAWKSL
IDNFALNPDILCSAKRLKLLMQPLSSIHVRTETLALTKLEVWWYLLMRLG
PHLPANFEQVCVPLIQSTISIDSNASPQGNSCHVATSPGLNPMTPVHKGA
SSPYGAPGTPRMNLSSNLGGMATIPSIQLLGLEMLLHFLLGPEALSFAKQ
NKLVLSLEPLEHPLISSPSFFSKHANTLITAVHDSFVAVGKDAPDVVVSA
IWKELISLVKSVTESGNKKEKPGSEVLTLLLKSLESIVKSEVFPVSKTLV
LMEITIKGLPQKVLGSPAYQVANMDILNGTPALFLIQLIFNNFLECGVSD
ERFFLSLESLVGCVLSGPTSPLAFSDSVLNVINQNAKQLENKEHLWKMWS
VIVTPLTELINQTNEVNQGDALEHNFSAIYGALTLPVNHIFSEQRFPVAT
MKTLLRTWSELYRAFARCAALVATAEENLCCEELSSKIMSSLEDEGFSNL
LFVDRIIYIITVMVDCIDFSPYNIKYQPKVKSPQRPSDWSKKKNEPLGKL
TSLFKLIVKVIYSFHTLSFKEAHSDTLFTIGNSITGIISSVLGHISLPSM
IRKIFATLTRPLALFYENSKLDEVPKVYSCLNNKLEKLLGEIIACLQFSY
TGTYDSELLEQLSPLLCIIFLHKNKQIRKQSAQFWNATFAKVMMLVYPEE
LKPVLTQAKQKFLLLLPGLETVEMMEESSGPYSDGTENSQLNVKISGMER
KSNGKRDSFLAQTKNKKENMKPAAKLKLESSSLKVKGEILLEEEKSTDFV
FIPPEGKDAKERILTDHQKEVLKTKRCDIPAMYNNLDVSQDTLFTQYSQE
EPMEIPTLTRKPKEDSKMMITEEQMDSDIVIPQDVTEDCGMAEHLEKSSL
SNNECGSLDKTSPEMSNSNNDERKKALISSRKTSTECASSTENSFVVSSS
SVSNTTVAGTPPYPTSRRQTFITLEKFDGSENRPFSPSPLNNISSTVTVK
NNQETMIKTDFLPKAKQREGTFSKSDSEKIVNGTKRSSRRAGKAEQTGNK
RSKPLMRSEPEKNTEESVEGIVVLENNPPGLLNQTECVSDNQVHLSESTM
EHDNTKLKAATVENAVLLETNTVEEKNVEINLESKENTPPVVISADQMVN
EDSQVQITPNQKTLRRSSRRRSEVVESTTESQDKENSHQKKERRKEEEKP
LQKSPLHIKDDVLPKQKLIAEQTLQENLIEKGSNLHEKTLGETSANAETE
QNKKKADPENIKSEGDGTQDIVDKSSEKLVRGRTRYQTRRASQGLLSSIE
NSESDSSEAKEEGSRKKRSGKWKNKSNESVDIQDQEEKVVKQECIKAENQ
SHDYKATSEEDVSIKSPICEKQDESNTVICQDSTVTSDLLQVPDDLPNVC
EEKNETSKYAEYSFTSLPVPESNLRTRNAIKRLHKRDSFDNCSLGESSKI
GISDISSLSEKTFQTLECQHKRSRRVRRSKGCDCCGEKSQPQEKSLIGLK
NTENNDVEISETKKADVQAPVSPSETSQANPYSEGQFLDEHHSVNFHLGL
KEDNDTINDSLIVSETKSKENTMQESLPSGIVNFREEICDMDSSEAMSLE
SQESPNENFKTVGPCLGDSKNVSQESLETKEEKPEETPKMELSLENVTVE
GNACKVTESNLEKAKTMELNVGNEASFHGQERTKTGISEEAAIEENKRND
DSEADTAKLNAKEVATEEFNSDISLSDNTTPVKLNAQTEISEQTAAGELD
GGNDVSDLHSSEETNTKMKNNEEMMIGEAMAETGHDGETENEGITTKTSK
PDEAETNMLTAEMDNFVCDTVEMSTEEGIIDANKTETNTEYSKSEEKLDN
NQMVMESDILQEDHHTSQKVEEPSQCLASGTAISELIIEDNNASPQKLRE
LDPSLVSANDSPSGMQTRCVWSPLASPSTSILKRGLKRSQEDEISSPVNK
VRRVSFADPIYQAGLADDIDRRCSIVRSHSSNSSPIGKSVKTSPTTQSKH
NTTSAKGFLSPGSRSPKFKSSKKCLISEMAKESIPCPTESVYPPLVNCVA
PVDIILPQITSNMWARGLGQLIRAKNIKTIGDLSTLTASEIKTLPIRSPK
VSNVKKALRIYHEQQVKTRGLEEIPVFDISEKTVNGIENKSLSPDEERLV
SDIIDPVALEIPLSKNLLAQISALALQLDSEDLHNYSGSQLFEMHEKLSC
MANSVIKNLQSRWRSPSHENSI

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.

Література

  • Silverman J., Takai H., Buonomo S.B.C., Eisenhaber F., De Lange T. (2004). Human Rif1, ortholog of a yeast telomeric protein, is regulated by ATM and 53BP1 and functions in the S-phase checkpoint. Genes Dev. 18: 2108—2119. PMID 15342490 DOI:10.1101/gad.1216004
  • Xu L., Blackburn E.H. (2004). Human Rif1 protein binds aberrant telomeres and aligns along anaphase midzone microtubules. J. Cell Biol. 167: 819—830. PMID 15583028 DOI:10.1083/jcb.200408181
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23207 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 29 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q5UIP0 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.