RBM11

RBM11
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2YWK

Ідентифікатори
Символи RBM11, RNA binding motif protein 11
Зовнішні ІД OMIM: 617937 MGI: 2447622 HomoloGene: 16988 GeneCards: RBM11
Онтологія гена
Молекулярна функція

• nucleic acid binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• protein homodimerization activity
• RNA binding
• poly(U) RNA binding
• single-stranded RNA binding

Клітинна компонента

• nuclear speck
• клітинне ядро
• нуклеоплазма

Біологічний процес

• multicellular organism development
• cellular response to oxidative stress
• mRNA processing
• диференціація клітин
• regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome
• Сплайсинг РНК

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
54033
224344
Ensembl
ENSG00000185272
ENSMUSG00000032940
UniProt
P57052
Q80YT9
RefSeq (мРНК)
NM_144770
NM_001320602
NM_198302
RefSeq (білок)
NP_001307531
NP_658983
NP_938044
Локус (UCSC) Хр. 21: 14.22 – 14.23 Mb Хр. 16: 75.39 – 75.4 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RBM11 (англ. RNA binding motif protein 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 281 амінокислот, а молекулярна маса — 32 179[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MFPAQEEADRTVFVGNLEARVREEILYELFLQAGPLTKVTICKDREGKPK
SFGFVCFKHPESVSYAIALLNGIRLYGRPINVQYRFGSSRSSEPANQSFE
SCVKINSHNYRNEEMLVGRSSFPMQYFPINNTSLPQEYFLFQKMQWHVYN
PVLQLPYYEMTAPLPNSASVSSSLNHVPDLEAGPSSYKWTHQQPSDSDLY
QMTAPLPNSASVSSSLNHVPDLEAGPSSYKWTHQQPSDSDLYQMNKRKRQ
KQTSDSDSSTDNNRGNECSQKFRKSKKKKRY

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Gardiner K., Slavov D., Bechtel L., Davisson M. (2002). Annotation of human chromosome 21 for relevance to Down syndrome: gene structure and expression analysis. Genomics. 79: 833—843. PMID 12036298 DOI:10.1006/geno.2002.6782
  • Brun M.-E., Ruault M., Ventura M., Roizes G., De Sario A. (2003). Juxtacentromeric region of human chromosome 21: a boundary between centromeric heterochromatin and euchromatic chromosome arms. Gene. 312: 41—50. PMID 12909339 DOI:10.1016/S0378-1119(03)00530-4
  • Pedrotti S., Busa R., Compagnucci C., Sette C. (2012). The RNA recognition motif protein RBM11 is a novel tissue-specific splicing regulator. Nucleic Acids Res. 40: 1021—1032. PMID 21984414 DOI:10.1093/nar/gkr819

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9897 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, P57052 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 21
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.