RAPH1

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4GMV, 4GN1

Ідентифікатори

Символи

RAPH1, ALS2CR18, ALS2CR9, LPD, PREL-2, PREL2, RMO1, RalGDS/AF-6, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1

Зовнішні ІД

OMIM: 609035 MGI: 1924550 HomoloGene: 71030 GeneCards: RAPH1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • Філоподія • cell projection • цитоскелет • cell leading edge • мембрана • lamellipodium • гіалоплазма • клітинна мембрана • ядерні тільця
Біологічний процес	• GO:0072468 сигнальна трансдукція • axon extension
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


65059


77300

Ensembl


ENSG00000173166


ENSMUSG00000026014

UniProt


Q70E73


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_025252 NM_203365 NM_213589 NM_001329728


NM_001045513

RefSeq (білок)


NP_001316657 NP_976241 NP_998754


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 2: 203.39 – 203.54 Mb

Хр. 1: 60.52 – 60.61 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAPH1 (англ. Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 250 амінокислот, а молекулярна маса — 135 256^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEQLSDEEID	HGAEEDSDKE	DQDLDKMFGA	WLGELDKLTQ	SLDSDKPMEP
VKRSPLRQET	NMANFSYRFS	IYNLNEALNQ	GETVDLDALM	ADLCSIEQEL
SSIGSGNSKR	QITETKATQK	LPVSRHTLKH	GTLKGLSSSS	NRIAKPSHAS
YSLDDVTAQL	EQASLSMDEA	AQQSVLEDTK	PLVTNQHRRT	ASAGTVSDAE
VHSISNSSHS	SITSAASSMD	SLDIDKVTRP	QELDLTHQGQ	PITEEEQAAK
LKAEKIRVAL	EKIKEAQVKK	LVIRVHMSDD	SSKTMMVDER	QTVRQVLDNL
MDKSHCGYSL	DWSLVETVSE	LQMERIFEDH	ENLVENLLNW	TRDSQNKLIF
MERIEKYALF	KNPQNYLLGK	KETAEMADRN	KEVLLEECFC	GSSVTVPEIE
GVLWLKDDGK	KSWKKRYFLL	RASGIYYVPK	GKAKVSRDLV	CFLQLDHVNV
YYGQDYRNKY	KAPTDYCLVL	KHPQIQKKSQ	YIKYLCCDDV	RTLHQWVNGI
RIAKYGKQLY	MNYQEALKRT	ESAYDWTSLS	SSSIKSGSSS	SSIPESQSNH
SNQSDSGVSD	TQPAGHVRSQ	SIVSSVFSEA	WKRGTQLEES	SKARMESMNR
PYTSLVPPLS	PQPKIVTPYT	ASQPSPPLPP	PPPPPPPPPP	PPPPPPPPLP
SQSAPSAGSA	APMFVKYSTI	TRLQNASQHS	GALFKPPTPP	VMQSQSVKPQ
ILVPPNGVVP	PPPPPPPPPT	PGSAMAQLKP	APCAPSLPQF	SAPPPPLKIH
QVQHITQVAP	PTPPPPPPIP	APLPPQAPPK	PLVTIPAPTS	TKTVAPVVTQ
AAPPTPTPPV	PPAKKQPAFP	ASYIPPSPPT	PPVPVPPPTL	PKQQSFCAKP
PPSPLSPVPS	VVKQIASQFP	PPPTPPAMES	QPLKPVPANV	APQSPPAVKA
KPKWQPSSIP	VPSPDFPPPP	PESSLVFPPP	PPSPVPAPPP	PPPPTASPTP
DKSGSPGKKT	SKTSSPGGKK	PPPTPQRNSS	IKSSSGAEHP	EPKRPSVDSL
VSKFTPPAES	GSPSKETLPP	PAAPPKPGKL	NLSGVNLPGV	LQQGCVSAKA
PVLSGRGKDS	VVEFPSPPSD	SDFPPPPPET	ELPLPPIEIP	AVFSGNTSPK
VAVVNPQPQQ	WSKMSVKKAP	PPTRPKRNDS	TRLTQAEISE	QPTMATVVPQ
VPTSPKSSLS	VQPGFLADLN	RTLQRKSITR	HGSLSSRMSR	AEPTATMDDM
ALPPPPPELL	SDQQKAGYGG	SHISGYATLR	RGPPPAPPKR	DQNTKLSRDW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.

Література

Michael M., Vehlow A., Navarro C., Krause M. (2010). c-Abl, Lamellipodin, and Ena/VASP proteins cooperate in dorsal ruffling of fibroblasts and axonal morphogenesis. Curr. Biol. 20: 783—791. PMID 20417104 DOI:10.1016/j.cub.2010.03.048
Quinn C.C., Pfeil D.S., Wadsworth W.G. (2008). CED-10/Rac1 mediates axon guidance by regulating the asymmetric distribution of MIG-10/lamellipodin. Curr. Biol. 18: 808—813. PMID 18499456 DOI:10.1016/j.cub.2008.04.050

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14436 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q70E73 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.