RAB7A |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1T91, 1YHN, 3LAW | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RAB7A, PRO2706, RAB7, member RAS oncogene family, CMT2B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602298 MGI: 105068 HomoloGene: 3408 GeneCards: RAB7A |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Charcot-Marie-Tooth disease type 2B[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • retromer complex binding • GO:0006184 GTPase activity • GDP binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • phagophore assembly site membrane • ендосома • phagocytic vesicle membrane • комплекс Ґольджі • late endosome • мембрана • late endosome membrane • extrinsic component of lysosome membrane • lipid droplet • melanosome membrane • retromer complex • lysosomal membrane • autophagosome membrane • phagocytic vesicle • лізосома • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • клітинна мембрана • endosome membrane • secretory granule membrane • terminal bouton • alveolar lamellar body • vacuolar membrane • внутрішньоклітинний |
---|
Біологічний процес | • protein to membrane docking • protein targeting to lysosome • lipophagy • viral release from host cell • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • phagosome-lysosome fusion • ендоцитоз • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • lipid metabolism • endosome to lysosome transport • phagosome acidification • автофагія • lipid catabolic process • phagosome maturation • early endosome to late endosome transport • retrograde transport, endosome to Golgi • protein transport • positive regulation of exosomal secretion • epidermal growth factor catabolic process • positive regulation of viral process • neutrophil degranulation • negative regulation of exosomal secretion • negative regulation of intralumenal vesicle formation • autophagosome assembly • кісткова резорбція • GO:0015915 транспорт • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction • small GTPase mediated signal transduction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001293652 NM_001293653 NM_001293654 NM_001293655 NM_009005 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001280581 NP_001280582 NP_001280583 NP_001280584 NP_033031 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 128.69 – 128.83 Mb | Хр. 6: 87.98 – 88.02 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RAB7A (англ. RAB7A, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 207 амінокислот, а молекулярна маса — 23 490[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTSRKKVLLK | | VIILGDSGVG | | KTSLMNQYVN | | KKFSNQYKAT | | IGADFLTKEV |
MVDDRLVTMQ | | IWDTAGQERF | | QSLGVAFYRG | | ADCCVLVFDV | | TAPNTFKTLD |
SWRDEFLIQA | | SPRDPENFPF | | VVLGNKIDLE | | NRQVATKRAQ | | AWCYSKNNIP |
YFETSAKEAI | | NVEQAFQTIA | | RNALKQETEV | | ELYNEFPEPI | | KLDKNDRAKA |
SAESCSC |
Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм ліпідів, транспорт, транспорт білків, деградація ліпідів, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ліпідних краплях, ендосомах.
Література
- Vitelli R., Chiariello M., Lattero D., Bruni C.B., Bucci C. (1996). Molecular cloning and expression analysis of the human Rab7 GTP-ase complementary deoxyribonucleic acid. Biochem. Biophys. Res. Commun. 229: 887—890. PMID 8954989 DOI:10.1006/bbrc.1996.1897
- Davies J.P., Cotter P.D., Ioannou Y.A. (1997). Cloning and mapping of human Rab7 and Rab9 cDNA sequences and identification of a Rab9 pseudogene. Genomics. 41: 131—134. PMID 9126495 DOI:10.1006/geno.1997.4644
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Cantalupo G., Alifano P., Roberti V., Bruni C.B., Bucci C. (2001). Rab-interacting lysosomal protein (RILP): the Rab7 effector required for transport to lysosomes. EMBO J. 20: 683—693. PMID 11179213 DOI:10.1093/emboj/20.4.683
- Harrison R.E., Bucci C., Vieira O.V., Schroer T.A., Grinstein S. (2003). Phagosomes fuse with late endosomes and/or lysosomes by extension of membrane protrusions along microtubules: role of Rab7 and RILP. Mol. Cell. Biol. 23: 6494—6506. PMID 12944476 DOI:10.1128/MCB.23.18.6494-6506.2003
- Stein M.P., Feng Y., Cooper K.L., Welford A.M., Wandinger-Ness A. (2003). Human VPS34 and p150 are Rab7 interacting partners. Traffic. 4: 754—771. PMID 14617358 DOI:10.1034/j.1600-0854.2003.00133.x
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з RAB7A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з RAB7A, member RAS oncogene family переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9788 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
- ↑ UniProt, P51149 (англ.) . Архів оригіналу за 1 січня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |