RAB6B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2E9S, 2FE4, 2FFQ

Ідентифікатори

Символи

RAB6B, member RAS oncogene family

Зовнішні ІД

OMIM: 615852 MGI: 107283 HomoloGene: 39749 GeneCards: RAB6B

Пов'язані генетичні захворювання

натуральна віспа^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GTP binding • myosin V binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity
Клітинна компонента	• Golgi membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • presynapse • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • protein transport • intra-Golgi vesicle-mediated transport • retrograde transport, endosome to Golgi • vesicle-mediated transport • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction • small GTPase mediated signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51560


270192

Ensembl


ENSG00000154917


ENSMUSG00000032549

UniProt


Q9NRW1


P61294

RefSeq (мРНК)


NM_016577 NM_001363953


NM_173781

RefSeq (білок)


NP_057661 NP_001350882


NP_776142

Локус (UCSC)

Хр. 3: 133.82 – 133.9 Mb

Хр. 9: 102.99 – 103.06 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAB6B (англ. RAB6B, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 208 амінокислот, а молекулярна маса — 23 462^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAGGDFGNP	LRKFKLVFLG	EQSVGKTSLI	TRFMYDSFDN	TYQATIGIDF
LSKTMYLEDR	TVRLQLWDTA	GQERFRSLIP	SYIRDSTVAV	VVYDITNLNS
FQQTSKWIDD	VRTERGSDVI	IMLVGNKTDL	ADKRQITIEE	GEQRAKELSV
MFIETSAKTG	YNVKQLFRRV	ASALPGMENV	QEKSKEGMID	IKLDKPQEPP
ASEGGCSC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chen D., Guo J., Gahl W.A. (1997). RAB GTPases expressed in human melanoma cells. Biochim. Biophys. Acta. 1355: 1—6. PMID 9030196 DOI:10.1016/S0167-4889(96)00169-3
Garcia-Saez I., Tcherniuk S., Kozielski F. (2006). The structure of human neuronal Rab6B in the active and inactive form. Acta Crystallogr. D. 62: 725—733. PMID 16790928 DOI:10.1107/S0907444906015319

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з RAB6B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14902 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NRW1 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.