PPRC1

Ідентифікатори

Символи

PPRC1, PRC, peroxisome proliferator-activated receptor gamma, coactivator-related 1, PPARG related coactivator 1

Зовнішні ІД

OMIM: 617462 MGI: 2385096 HomoloGene: 9006 GeneCards: PPRC1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nuclear receptor coactivator activity • nucleic acid binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • RNA binding • transcription factor binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • mitochondrion organization • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23082


226169

Ensembl


ENSG00000148840


ENSMUSG00000055491

UniProt


Q5VV67


Q6NZN1

RefSeq (мРНК)


NM_001288727 NM_001288728 NM_015062


NM_001081214 NM_145504 NM_001346801

RefSeq (білок)


NP_001275656 NP_001275657 NP_055877


NP_001074683 NP_001333730

Локус (UCSC)

Хр. 10: 102.13 – 102.15 Mb

Хр. 19: 46.03 – 46.06 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PPRC1 (англ. Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, coactivator-related 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 664 амінокислот, а молекулярна маса — 177 544^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAARRGRRDG	VAPPPSGGPG	PDPGGGARGS	GWGSRSQAPY	GTLGAVSGGE
QVLLHEEAGD	SGFVSLSRLG	PSLRDKDLEM	EELMLQDETL	LGTMQSYMDA
SLISLIEDFG	SLGESRLSLE	DQNEVSLLTA	LTEILDNADS	ENLSPFDSIP
DSELLVSPRE	GSSLHKLLTL	SRTPPERDLI	TPVDPLGPST	GSSRGSGVEM
SLPDPSWDFS	PPSFLETSSP	KLPSWRPPRS	RPRWGQSPPP	QQRSDGEEEE
EVASFSGQIL	AGELDNCVSS	IPDFPMHLAC	PEEEDKATAA	EMAVPAAGDE
SISSLSELVR	AMHPYCLPNL	THLASLEDEL	QEQPDDLTLP	EGCVVLEIVG
QAATAGDDLE	IPVVVRQVSP	GPRPVLLDDS	LETSSALQLL	MPTLESETEA
AVPKVTLCSE	KEGLSLNSEE	KLDSACLLKP	REVVEPVVPK	EPQNPPANAA
PGSQRARKGR	KKKSKEQPAA	CVEGYARRLR	SSSRGQSTVG	TEVTSQVDNL
QKQPQEELQK	ESGPLQGKGK	PRAWARAWAA	ALENSSPKNL	ERSAGQSSPA
KEGPLDLYPK	LADTIQTNPI	PTHLSLVDSA	QASPMPVDSV	EADPTAVGPV
LAGPVPVDPG	LVDLASTSSE	LVEPLPAEPV	LINPVLADSA	AVDPAVVPIS
DNLPPVDAVP	SGPAPVDLAL	VDPVPNDLTP	VDPVLVKSRP	TDPRRGAVSS
ALGGSAPQLL	VESESLDPPK	TIIPEVKEVV	DSLKIESGTS	ATTHEARPRP
LSLSEYRRRR	QQRQAETEER	SPQPPTGKWP	SLPETPTGLA	DIPCLVIPPA
PAKKTALQRS	PETPLEICLV	PVGPSPASPS	PEPPVSKPVA	SSPTEQVPSQ
EMPLLARPSP	PVQSVSPAVP	TPPSMSAALP	FPAGGLGMPP	SLPPPPLQPP
SLPLSMGPVL	PDPFTHYAPL	PSWPCYPHVS	PSGYPCLPPP	PTVPLVSGTP
GAYAVPPTCS	VPWAPPPAPV	SPYSSTCTYG	PLGWGPGPQH	APFWSTVPPP
PLPPASIGRA	VPQPKMESRG	TPAGPPENVL	PLSMAPPLSL	GLPGHGAPQT
EPTKVEVKPV	PASPHPKHKV	SALVQSPQMK	ALACVSAEGV	TVEEPASERL
KPETQETRPR	EKPPLPATKA	VPTPRQSTVP	KLPAVHPARL	RKLSFLPTPR
TQGSEDVVQA	FISEIGIEAS	DLSSLLEQFE	KSEAKKECPP	PAPADSLAVG
NSGGVDIPQE	KRPLDRLQAP	ELANVAGLTP	PATPPHQLWK	PLAAVSLLAK
AKSPKSTAQE	GTLKPEGVTE	AKHPAAVRLQ	EGVHGPSRVH	VGSGDHDYCV
RSRTPPKKMP	ALVIPEVGSR	WNVKRHQDIT	IKPVLSLGPA	APPPPCIAAS
REPLDHRTSS	EQADPSAPCL	APSSLLSPEA	SPCRNDMNTR	TPPEPSAKQR
SMRCYRKACR	SASPSSQGWQ	GRRGRNSRSV	SSGSNRTSEA	SSSSSSSSSS
SRSRSRSLSP	PHKRWRRSSC	SSSGRSRRCS	SSSSSSSSSS	SSSSSSSSSR
SRSRSPSPRR	RSDRRRRYSS	YRSHDHYQRQ	RVLQKERAIE	ERRVVFIGKI
PGRMTRSELK	QRFSVFGEIE	ECTIHFRVQG	DNYGFVTYRY	AEEAFAAIES
GHKLRQADEQ	PFDLCFGGRR	QFCKRSYSDL	DSNREDFDPA	PVKSKFDSLD
FDTLLKQAQK	NLRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Andersson U., Scarpulla R.C. (2001). Pgc-1-related coactivator, a novel, serum-inducible coactivator of nuclear respiratory factor 1-dependent transcription in mammalian cells. Mol. Cell. Biol. 21: 3738—3749. PMID 11340167 DOI:10.1128/MCB.21.11.3738-3749.2001
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Vercauteren K., Pasko R.A., Gleyzer N., Marino V.M., Scarpulla R.C. (2006). PGC-1-related coactivator: immediate early expression and characterization of a CREB/NRF-1 binding domain associated with cytochrome c promoter occupancy and respiratory growth. Mol. Cell. Biol. 26: 7409—7419. PMID 16908542 DOI:10.1128/MCB.00585-06

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30025 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q5VV67 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.