PPFIA4 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PPFIA4, PTPRF interacting protein alpha 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603145 GeneCards: PPFIA4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • presynaptic active zone • cell surface • гіалоплазма • синапс • внутрішньоклітинний |
---|
Біологічний процес | • glutamate secretion • GO:0010554 neurotransmitter secretion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001304331 NM_001304332 NM_015053 NM_001393950 NM_001393951
| NM_001393952 NM_001393953 NM_001393954 NM_001393955 NM_001393956 NM_001393957 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 203.03 – 203.08 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PPFIA4 (англ. PTPRF interacting protein alpha 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 185 амінокислот, а молекулярна маса — 134 404[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MCEVMPTINE | | GDRLGPPHGA | | DADANFEQLM | | VNMLDEREKL | | LESLRESQET |
LAATQSRLQD | | AIHERDQLQR | | HLNSALPQEF | | ATLTRELSMC | | REQLLEREEE |
ISELKAERNN | | TRLLLEHLEC | | LVSRHERSLR | | MTVVKRQAQS | | PSGVSSEVEV |
LKALKSLFEH | | HKALDEKVRE | | RLRAALERVT | | TLEEQLAGAH | | QQVSALQQGA |
GVRDGAAEEE | | GTVELGPKRL | | WKEDTGRVEE | | LQELLEKQNF | | ELSQARERLV |
TLTTTVTELE | | EDLGTARRDL | | IKSEELSSKH | | QRDLREALAQ | | KEDMEERITT |
LEKRYLAAQR | | EATSIHDLND | | KLENELANKE | | SLHRQCEEKA | | RHLQELLEVA |
EQKLQQTMRK | | AETLPEVEAE | | LAQRIAALTK | | AEERHGNIEE | | HLRQLEGQLE |
EKNQELARTA | | VQVRQREKMN | | EDHNKRLSDT | | VDRLLSESNE | | RLQLHLKERM |
AALEEKNTLI | | QELESSQRQI | | EEQHHHKGRL | | SEEIEKLRQE | | VDQLKGRGGP |
FVDGVHSRSH | | MGSAADVRFS | | LGTTTHAPPG | | VHRRYSALRE | | ESAKLALPLT |
VTLRSPTWMR | | MSQGVCCNLE | | YHSSGTLCGS | | SGPLPVPEMI | | QEEKESTELR |
AEEIETRVTS | | GSMEALNLKQ | | LRKRGSIPTS | | LTALSLASAS | | PPLSGRSTPK |
LTSRSAAQDL | | DRMGVMTLPS | | DLRKHRRKLL | | SPVSREENRE | | DKATIKCETS |
PPSSPRTLRL | | EKLGHPALSQ | | EEGKSALEDQ | | GSNPSSSNSS | | QDSLHKGAKR |
KGIKSSIGRL | | FGKKEKGRLI | | QLSRDGATGH | | VLLTDSEFSM | | QEPMVPAKLG |
TQAEKDRRLK | | KKHQLLEDAR | | RKGMPFAQWD | | GPTVVSWLEL | | WVGMPAWYVA |
ACRANVKSGA | | IMSALSDTEI | | QREIGISNAL | | HRLKLRLAIQ | | EMVSLTSPSA |
PPTSRTSSGN | | VWVTHEEMET | | LETSTKTDSE | | EGSWAQTLAY | | GDMNHEWIGN |
EWLPSLGLPQ | | YRSYFMECLV | | DARMLDHLTK | | KDLRVHLKMV | | DSFHRTSLQY |
GIMCLKRLNY | | DRKELEKRRE | | ESQHEIKDVL | | VWTNDQVVHW | | VQSIGLRDYA |
GNLHESGVHG | | ALLALDENFD | | HNTLALILQI | | PTQNTQARQV | | MEREFNNLLA |
LGTDRKLDDG | | DDKVFRRAPS | | WRKRFRPREH | | HGRGGMLSAS | | AETLPAGFRV |
STLGTLQPPP | | APPKKIMPEA | | HSHYLYGHML | | SAFRD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins. J. Biol. Chem. 273: 15611—15620. PMID 9624153 DOI:10.1074/jbc.273.25.15611
- Katoh M., Katoh M. (2003). Identification and characterization of human PPFIA4 gene in silico. Int. J. Mol. Med. 12: 1009—1014. PMID 14612982
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9248 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O75335 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |