POLR1C |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | POLR1C, RPA39, RPA40, RPA5, RPAC1, TCS3, AC40, RPC40, HLD11, polymerase (RNA) I subunit C, RNA polymerase I subunit C, RNA polymerase I and III subunit C |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610060 MGI: 103288 HomoloGene: 3586 GeneCards: POLR1C |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
hypomyelinating leukodystrophy 11, Синдром Тричера Коллінза, 4H leukodystrophy[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • protein dimerization activity • RNA polymerase III activity • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase I activity |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • нуклеоплазма • RNA polymerase III complex • клітинне ядро • RNA polymerase I complex |
---|
Біологічний процес | • transcription by RNA polymerase I • termination of RNA polymerase I transcription • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase III • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter • positive regulation of type I interferon production |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_004875 NM_203290 NM_001318876 NM_001363658 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001305805 NP_976035 NP_001350587 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 43.51 – 43.56 Mb | Хр. 17: 46.55 – 46.56 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
POLR1C (англ. RNA polymerase I subunit C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 39 250[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAASQAVEEM | | RSRVVLGEFG | | VRNVHTTDFP | | GNYSGYDDAW | | DQDRFEKNFR |
VDVVHMDENS | | LEFDMVGIDA | | AIANAFRRIL | | LAEVPTMAVE | | KVLVYNNTSI |
VQDEILAHRL | | GLIPIHADPR | | LFEYRNQGDE | | EGTEIDTLQF | | RLQVRCTRNP |
HAAKDSSDPN | | ELYVNHKVYT | | RHMTWIPLGN | | QADLFPEGTI | | RPVHDDILIA |
QLRPGQEIDL | | LMHCVKGIGK | | DHAKFSPVAT | | ASYRLLPDIT | | LLEPVEGEAA |
EELSRCFSPG | | VIEVQEVQGK | | KVARVANPRL | | DTFSREIFRN | | EKLKKVVRLA |
RVRDHYIFSV | | ESTGVLPPDV | | LVSEAIKVLM | | GKCRRFLDEL | | DAVQMD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Dammann R., Pfeifer G.P. (1998). Cloning and characterization of the human RNA polymerase I subunit hRPA40. Biochim. Biophys. Acta. 1396: 153—157. PMID 9540830 DOI:10.1016/S0167-4781(97)00206-6
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з POLR1C переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20194 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O15160 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |