PICK1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2GZV

Ідентифікатори

Символи

PICK1, PICK, PRKCABP, protein interacting with PRKCA 1

Зовнішні ІД

OMIM: 605926 MGI: 894645 HomoloGene: 7470 GeneCards: PICK1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding • Arp2/3 complex binding • зв'язування з іоном металу • actin filament binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • enzyme binding • actin binding • signaling receptor binding • G protein-coupled receptor binding • protein kinase C binding • phospholipid binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • endocytic vesicle membrane • postsynaptic membrane • комплекс Ґольджі • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • клітинна мембрана • синапс • міжклітинні контакти • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection • цитоскелет • presynaptic membrane • мітохондрія • гіалоплазма • aggresome • Синаптичні бульбашки • trans-Golgi network membrane • postsynaptic early endosome
Біологічний процес	• cellular response to glucose starvation • glial cell development • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • positive regulation of receptor internalization • neuronal ion channel clustering • regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation • monoamine transport • receptor clustering • DNA methylation involved in gamete generation • negative regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation • dendritic spine organization • dendritic spine maintenance • protein phosphorylation • protein kinase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway • Довготривале пригнічення • cellular response to decreased oxygen levels • DNA methylation involved in embryo development • intracellular protein transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9463


18693

Ensembl


ENSG00000100151


ENSMUSG00000068206

UniProt


Q9NRD5


Q62083

RefSeq (мРНК)


NM_001039583 NM_001039584 NM_012407


NM_001045558 NM_008837

RefSeq (білок)

NP_001034672 NP_001034673 NP_036539 NP_001034672.1 NP_001034673.1
NP_036539.1


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 22: 38.06 – 38.08 Mb

Хр. 15: 79.11 – 79.13 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PICK1 (англ. Protein interacting with PRKCA 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 415 амінокислот, а молекулярна маса — 46 600^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFADLDYDIE	EDKLGIPTVP	GKVTLQKDAQ	NLIGISIGGG	AQYCPCLYIV
QVFDNTPAAL	DGTVAAGDEI	TGVNGRSIKG	KTKVEVAKMI	QEVKGEVTIH
YNKLQADPKQ	GMSLDIVLKK	VKHRLVENMS	SGTADALGLS	RAILCNDGLV
KRLEELERTA	ELYKGMTEHT	KNLLRAFYEL	SQTHRAFGDV	FSVIGVREPQ
PAASEAFVKF	ADAHRSIEKF	GIRLLKTIKP	MLTDLNTYLN	KAIPDTRLTI
KKYLDVKFEY	LSYCLKVKEM	DDEEYSCIAL	GEPLYRVSTG	NYEYRLILRC
RQEARARFSQ	MRKDVLEKME	LLDQKHVQDI	VFQLQRLVST	MSKYYNDCYA
VLRDADVFPI	EVDLAHTTLA	YGLNQEEFTD	GEEEEEEEDT	AAGEPSRDTR
GAAGPLDKGG	SWCDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, синапсах, синаптосомах^[en].

Література

Takeya R., Takeshige K., Sumimoto H. (2000). Interaction of the PDZ domain of human PICK1 with class I ADP-ribosylation factors. Biochem. Biophys. Res. Commun. 267: 149—155. PMID 10623590 DOI:10.1006/bbrc.1999.1932
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hruska-Hageman A.M., Wemmie J.A., Price M.P., Welsh M.J. (2002). Interaction of the synaptic protein PICK1 (protein interacting with C kinase 1) with the non-voltage gated sodium channels BNC1 (brain Na+ channel 1) and ASIC (acid-sensing ion channel). Biochem. J. 361: 443—450. PMID 11802773 DOI:10.1042/0264-6021:3610443
Ashbourne-Excoffon K.J.D., Hruska-Hageman A.M., Klotz M., Traver G.L., Zabner J. (2004). A role for the PDZ-binding domain of the coxsackie B virus and adenovirus receptor (CAR) in cell adhesion and growth. J. Cell Sci. 117: 4401—4409. PMID 15304526 DOI:10.1242/jcs.01300
Dev K.K., Nakanishi S., Henley J.M. (2004). The PDZ domain of PICK1 differentially accepts protein kinase C-alpha and GluR2 as interacting ligands. J. Biol. Chem. 279: 41393—41397. PMID 15247289 DOI:10.1074/jbc.M404499200
Lin S.H.S., Arai A.C., Wang Z., Nothacker H.-P., Civelli O. (2001). The carboxyl terminus of the prolactin-releasing peptide receptor interacts with PDZ domain proteins involved in alpha-amino-3-hydroxy-5-methylisoxazole-4-propionic acid receptor clustering. Mol. Pharmacol. 60: 916—923. PMID 11641419

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9394 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NRD5 (англ.) . Архів оригіналу за 16 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.