| PDGFRA |
|---|
|
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | PDGFRA, CD140A, PDGFR-2, PDGFR2, RHEGAS9, platelet derived growth factor receptor alpha |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 173490 MGI: 97530 HomoloGene: 31361 GeneCards: PDGFRA |
|---|
| |
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| астигматизм, gastrointestinal stromal tumor[1] |
| |
| Реагує на сполуку |
|---|
| cediranib, crenolanib, Масітиніб, Нінтеданіб[2] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • vascular endothelial growth factor-activated receptor activity
• transferase activity
• protein kinase activity
• nucleotide binding
• protein homodimerization activity
• vascular endothelial growth factor binding
• platelet-derived growth factor receptor binding
• kinase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity
• platelet-derived growth factor alpha-receptor activity
• protein tyrosine kinase activity
• ATP binding
• phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity
• GO:0032403 protein-containing complex binding
• platelet-derived growth factor binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • integral component of membrane
• мембрана
• intrinsic component of plasma membrane
• integral component of plasma membrane
• клітинна мембрана
• міжклітинні контакти
• клітинне ядро
• цитоплазма
• Мікроворсинки
• external side of plasma membrane
• cell surface
• комплекс Ґольджі
• війка
• GO:0009327 protein-containing complex
• cell projection
• receptor complex
|
|---|
| Біологічний процес | • embryonic skeletal system morphogenesis
• regulation of actin cytoskeleton reorganization
• regulation of chemotaxis
• фосфорилювання
• positive regulation of phospholipase C activity
• transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway
• positive regulation of cell migration
• positive regulation of fibroblast proliferation
• positive regulation of cytosolic calcium ion concentration
• cell activation
• MAPK cascade
• positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity
• GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species
• positive regulation of DNA replication
• negative regulation of platelet activation
• protein phosphorylation
• хемотаксис
• multicellular organism development
• positive regulation of cell population proliferation
• positive regulation of cell proliferation by VEGF-activated platelet derived growth factor receptor signaling pathway
• positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
• positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
• platelet-derived growth factor receptor signaling pathway
• GO:0022415 viral process
• platelet aggregation
• regulation of mesenchymal stem cell differentiation
• phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process
• negative regulation of platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway
• luteinization
• in utero embryonic development
• hematopoietic progenitor cell differentiation
• estrogen metabolic process
• female gonad development
• anatomical structure morphogenesis
• animal organ morphogenesis
• cell migration
• peptidyl-tyrosine phosphorylation
• signal transduction involved in regulation of gene expression
• extracellular matrix organization
• lung development
• adrenal gland development
• male genitalia development
• Leydig cell differentiation
• platelet-derived growth factor receptor-alpha signaling pathway
• Загоєння ран
• odontogenesis of dentin-containing tooth
• protein autophosphorylation
• embryonic digestive tract morphogenesis
• embryonic cranial skeleton morphogenesis
• skeletal system morphogenesis
• cardiac myofibril assembly
• roof of mouth development
• face morphogenesis
• cell chemotaxis
• retina vasculature development in camera-type eye
• cellular response to amino acid stimulus
• metanephric glomerular capillary formation
• phosphatidylinositol-mediated signaling
• positive regulation of protein kinase B signaling
• positive regulation of MAPK cascade
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | NM_006206
NM_001347827
NM_001347828
NM_001347829
NM_001347830 |
| | NM_001083316
NM_011058
NM_001347718
NM_001347719 |
|
|---|
| RefSeq (білок) | | NP_001334756
NP_001334757
NP_001334758
NP_001334759
NP_006197 |
| | NP_001076785
NP_001334647
NP_001334648
NP_035188 |
|
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 4: 54.23 – 54.3 Mb | Хр. 5: 75.31 – 75.36 Mb |
|---|
| PubMed search | [3] | [4] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PDGFRA (англ. Platelet derived growth factor receptor alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 089 амінокислот, а молекулярна маса — 122 670[6].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MGTSHPAFLV | | LGCLLTGLSL | | ILCQLSLPSI | | LPNENEKVVQ | | LNSSFSLRCF |
| GESEVSWQYP | | MSEEESSDVE | | IRNEENNSGL | | FVTVLEVSSA | | SAAHTGLYTC |
| YYNHTQTEEN | | ELEGRHIYIY | | VPDPDVAFVP | | LGMTDYLVIV | | EDDDSAIIPC |
| RTTDPETPVT | | LHNSEGVVPA | | SYDSRQGFNG | | TFTVGPYICE | | ATVKGKKFQT |
| IPFNVYALKA | | TSELDLEMEA | | LKTVYKSGET | | IVVTCAVFNN | | EVVDLQWTYP |
| GEVKGKGITM | | LEEIKVPSIK | | LVYTLTVPEA | | TVKDSGDYEC | | AARQATREVK |
| EMKKVTISVH | | EKGFIEIKPT | | FSQLEAVNLH | | EVKHFVVEVR | | AYPPPRISWL |
| KNNLTLIENL | | TEITTDVEKI | | QEIRYRSKLK | | LIRAKEEDSG | | HYTIVAQNED |
| AVKSYTFELL | | TQVPSSILDL | | VDDHHGSTGG | | QTVRCTAEGT | | PLPDIEWMIC |
| KDIKKCNNET | | SWTILANNVS | | NIITEIHSRD | | RSTVEGRVTF | | AKVEETIAVR |
| CLAKNLLGAE | | NRELKLVAPT | | LRSELTVAAA | | VLVLLVIVII | | SLIVLVVIWK |
| QKPRYEIRWR | | VIESISPDGH | | EYIYVDPMQL | | PYDSRWEFPR | | DGLVLGRVLG |
| SGAFGKVVEG | | TAYGLSRSQP | | VMKVAVKMLK | | PTARSSEKQA | | LMSELKIMTH |
| LGPHLNIVNL | | LGACTKSGPI | | YIITEYCFYG | | DLVNYLHKNR | | DSFLSHHPEK |
| PKKELDIFGL | | NPADESTRSY | | VILSFENNGD | | YMDMKQADTT | | QYVPMLERKE |
| VSKYSDIQRS | | LYDRPASYKK | | KSMLDSEVKN | | LLSDDNSEGL | | TLLDLLSFTY |
| QVARGMEFLA | | SKNCVHRDLA | | ARNVLLAQGK | | IVKICDFGLA | | RDIMHDSNYV |
| SKGSTFLPVK | | WMAPESIFDN | | LYTTLSDVWS | | YGILLWEIFS | | LGGTPYPGMM |
| VDSTFYNKIK | | SGYRMAKPDH | | ATSEVYEIMV | | KCWNSEPEKR | | PSFYHLSEIV |
| ENLLPGQYKK | | SYEKIHLDFL | | KSDHPAVARM | | RVDSDNAYIG | | VTYKNEEDKL |
| KDWEGGLDEQ | | RLSADSGYII | | PLPDIDPVPE | | EEDLGKRNRH | | SSQTSEESAI |
| ETGSSSSTFI | | KREDETIEDI | | DMMDDIGIDS | | SDLVEDSFL |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, білків розвитку, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, хемотаксис, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані.
Література
- Claesson-Welsh L., Eriksson A., Westermark B., Heldin C.H. (1989). cDNA cloning and expression of the human A-type platelet-derived growth factor (PDGF) receptor establishes structural similarity to the B-type PDGF receptor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 4917—4921. PMID 2544881 DOI:10.1073/pnas.86.13.4917
- Kawagishi J., Ku T. (1995). Structure, organization, and transcription units of the human alpha-platelet-derived growth factor receptor gene, PDGFRA. Genomics. 30: 224—232. PMID 8586421 DOI:10.1006/geno.1995.9883
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Griffin J.H., Leung J., Bruner R.J., Caligiuri M.A., Briesewitz R. (2003). Discovery of a fusion kinase in EOL-1 cells and idiopathic hypereosinophilic syndrome. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 7830—7835. PMID 12808148 DOI:10.1073/pnas.0932698100
- Yokote K., Margolis B., Heldin C.H., Claesson-Welsh L. (1996). Grb7 is a downstream signaling component of platelet-derived growth factor alpha- and beta-receptors. J. Biol. Chem. 271: 30942—30949. PMID 8940081 DOI:10.1074/jbc.271.48.30942
- Bazenet C.E., Gelderloos J.A., Kazlauskas A. (1996). Phosphorylation of tyrosine 720 in the platelet-derived growth factor alpha receptor is required for binding of Grb2 and SHP-2 but not for activation of Ras or cell proliferation. Mol. Cell. Biol. 16: 6926—6936. PMID 8943348 DOI:10.1128/MCB.16.12.6926
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PDGFRA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Platelet derived growth factor receptor alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8803 (англ.) . Архів оригіналу за 19 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P16234 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
