PCDHB16

Ідентифікатори

Символи

PCDHB16, ME1, PCDH-BETA16, PCDH3X, PCDHB8a, protocadherin beta 16

Зовнішні ІД

OMIM: 606345 MGI: 2136754 HomoloGene: 81881 GeneCards: PCDHB16

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • synapse assembly • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • chemical synaptic transmission • адгезія клітин
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57717


93888

Ensembl


ENSG00000272674


ENSMUSG00000046387

UniProt


Q9NRJ7


Q91VD8

RefSeq (мРНК)


NM_020957


NM_053142

RefSeq (білок)


NP_066008


NP_444372

Локус (UCSC)

Хр. 5: 141.18 – 141.19 Mb

Хр. 18: 37.62 – 37.62 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PCDHB16 (англ. Protocadherin beta 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 776 амінокислот, а молекулярна маса — 84 983^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEIGWMHNRR	QRQVLVFFVL	LSLSGAGAEL	GSYSVVEETE	RGSFVANLGK
DLGLGLTEMS	TRKARIISQG	NKQHLQLKAQ	TGDLLINEKL	DREELCGPTE
PCILHFQVLM	ENPLEIFQAE	LRVIDINDHS	PMFTEKEMIL	KIPENSPLGT
EFPLNHALDL	DVGSNNVQNY	KISPSSHFRV	LIHEFRDGRK	YPELVLDKEL
DREEEPQLRL	TLTALDGGSP	PRSGTAQVRI	EVVDINDNAP	EFEQPIYKVQ
IPENSPLGSL	VATVSARDLD	GGANGKISYT	LFQPSEDISK	TLEVNPMTGE
VRLRKQVDFE	MVTSYEVRIK	ATDGGGLSGK	CTLLLQVVDV	NDNPPQVTMS
ALTSPIPENS	PEIVVAVFSV	SDPDSGNNGK	TISSIQEDLP	FLLKPSVKNF
YTLVTERALD	REARAEYNIT	LTVTDMGTPR	LKTEHNITVQ	ISDVNDNAPT
FTQTSYTLFV	RENNSPALHI	GSVSATDRDS	GTNAQVTYSL	LPPQDPHLPL
ASLVSINADN	GHLFALRSLD	YEALREFEFR	VSATDRGSPA	LSSEALVRVL
VLDANDNSPF	VLYPLQNGSA	PCTELVPRAA	EPGYLVTKVV	AVDGDSGQNA
WLSYQLLKAT	EPGLFGVWAH	NGEVRTARLL	SERDAAKQRL	VVLVKDNGEP
PRSATATLHV	LLVDGFSQPF	LPLPEAAPGQ	TQANSLTVYL	VVALASVSSL
FLFSVLLFVA	VRLCRRSRAA	SVGRCSMPEG	PFPGRLVDVS	GTGTLSQSYQ
YEVCLTGGSE	TSEFKFLKPI	IPNFSP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

Vanhalst K., Kools P., Vanden Eynde E., van Roy F. (2001). The human and murine protocadherin-beta one-exon gene families show high evolutionary conservation, despite the difference in gene number. FEBS Lett. 495: 120—125. PMID 11322959 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02372-9
Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14546 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NRJ7 (англ.) . Архів оригіналу за 20 квітня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.