PCDHA9 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PCDHA9, PCDH-ALPHA9, protocadherin alpha 9 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606315 MGI: 2681879 HomoloGene: 129614 GeneCards: PCDHA9 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 140.85 – 141.01 Mb | Хр. 18: 37.13 – 37.32 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PCDHA9 (англ. Protocadherin alpha 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 950 амінокислот, а молекулярна маса — 102 402[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLYSSRGDPE | | GQPLLLSLLI | | LAMWVVGSGQ | | LHYSVPEEAE | | HGTFVGRIAQ |
DLGLELAELV | | PRLFQLDSKG | | RGDLLEVNLQ | | NGILFVNSRI | | DREELCGRSA |
ECSIHLEVIV | | DRPLQVFHVD | | VEVKDINDNP | | PVFPATQKNL | | FIAESRPLDS |
RFPLEGASDA | | DIGENALLTY | | RLSPNEYFFL | | DVPTSNQQVK | | PLGLVLRKLL |
DREETPELHL | | LLTATDGGKP | | ELTGTVQLLI | | TVLDNNDNAP | | VFDRTLYTVK |
LPENVSIGTL | | VIHPNASDLD | | EGLNGDIIYS | | FSSDVSPDIK | | SKFHMDPLSG |
AITVIGHMDF | | EESRAHKIPV | | EAVDKGFPPL | | AGHCTLLVEV | | VDVNDNAPQL |
TIKTLSVPVK | | EDAQLGTVIA | | LISVIDLDAD | | ANGQVTCSLT | | PHVPFKLVST |
YKNYYSLVLD | | RALDRESVSA | | YELVVTARDG | | GSPSLWATAR | | VSVEVADVND |
NAPAFAQSEY | | TVFVKENNPP | | GCHIFTVSAR | | DADAQENALV | | SYSLVERRLG |
ERSLSSYVSV | | HAESGKVYAL | | QPLDHEELEL | | LQFQVSARDA | | GVPPLGSNVT |
LQVFVLDEND | | NAPALLTPRM | | RGTDGAVSEM | | VLRSVGAGVV | | VGKVRAVDAD |
SGYNAWLSYE | | LQPETASASI | | PFRVGLYTGE | | ISTTRALDET | | DAPRQRLLVL |
VKDHGEPALT | | ATATVLVSLV | | ESGQAPKSSS | | RASVGATGPE | | VTLVDVNVYL |
IIAICAVSSL | | LVLTLLLYTV | | LRCSAMPTEG | | ECAPGKPTLV | | CSSAVGSWSY |
SQQRRQRVCS | | GEGKQKTDLM | | AFSPGLSPCA | | GSTERTGEPS | | ASSDSTGKPR |
QPNPDWRYSA | | SLRAGMHSSV | | HLEEAGILRA | | GPGGPDQQWP | | TVSSATPEPE |
AGEVSPPVGA | | GVNSNSWTFK | | YGPGNPKQSG | | PGELPDKFII | | PGSPAIISIR |
QEPTNSQIDK | | SDFITFGKKE | | ETKKKKKKKK | | GNKTQEKKEK | | GNSTTDNSDQ |
|
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8675 (англ.) . Архів оригіналу за 30 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y5H5 (англ.) . Архів оригіналу за 8 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |