OPCML : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

OPCML

Ідентифікатори

Символи

OPCML, IGLON1, OBCAM, OPCM, opioid binding protein/cell adhesion molecule-like, opioid binding protein/cell adhesion molecule like

Зовнішні ІД

OMIM: 600632 MGI: 97397 HomoloGene: 55663 GeneCards: OPCML

Пов'язані генетичні захворювання

alcohol dependence^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• anchored component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • extracellular region
Біологічний процес	• neuron recognition • адгезія клітин
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4978


330908

Ensembl


ENSG00000183715


ENSMUSG00000062257

UniProt


Q14982


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001012393 NM_002545 NM_001319103 NM_001319104 NM_001319105
NM_001319106


NM_177906

RefSeq (білок)

NP_001012393 NP_001306032 NP_001306033 NP_001306034 NP_001306035
NP_002536 NP_002536.1


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 11: 132.41 – 133.53 Mb

Хр. 9: 27.79 – 28.93 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

OPCML (англ. Opioid binding protein/cell adhesion molecule like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 345 амінокислот, а молекулярна маса — 38 008^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGVCGYLFLP	WKCLVVVSLR	LLFLVPTGVP	VRSGDATFPK	AMDNVTVRQG
ESATLRCTID	DRVTRVAWLN	RSTILYAGND	KWSIDPRVII	LVNTPTQYSI
MIQNVDVYDE	GPYTCSVQTD	NHPKTSRVHL	IVQVPPQIMN	ISSDITVNEG
SSVTLLCLAI	GRPEPTVTWR	HLSVKEGQGF	VSEDEYLEIS	DIKRDQSGEY
ECSALNDVAA	PDVRKVKITV	NYPPYISKAK	NTGVSVGQKG	ILSCEASAVP
MAEFQWFKEE	TRLATGLDGM	RIENKGRMST	LTFFNVSEKD	YGNYTCVATN
KLGNTNASIT	LYGPGAVIDG	VNSASRALAC	LWLSGTLLAH	FFIKF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Shark K.B., Lee N.M. (1995). Cloning, sequencing and localization to chromosome 11 of a cDNA encoding a human opioid-binding cell adhesion molecule (OBCAM). Gene. 155: 213—217. PMID 7721093 DOI:10.1016/0378-1119(94)00830-L
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з OPCML переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8143 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q14982 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.