NOP2

Ідентифікатори

Символи

NOP2, NOL1, NOP120, NSUN1, p120, NOP2 nucleolar protein

Зовнішні ІД

OMIM: 164031 MGI: 107891 HomoloGene: 135865 GeneCards: NOP2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity • rRNA (cytosine-C5-)-methyltransferase activity • RNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • ядерце • нуклеоплазма
Біологічний процес	• rRNA processing • Метилювання • rRNA base methylation • maturation of LSU-rRNA • positive regulation of cell population proliferation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • ribosomal large subunit assembly • regulation of signal transduction by p53 class mediator • ribosome biogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4839


110109

Ensembl


ENSG00000111641


ENSMUSG00000038279

UniProt


P46087


Q922K7

RefSeq (мРНК)


NM_001033714 NM_001258308 NM_001258309 NM_001258310 NM_006170


NM_138747

RefSeq (білок)


NP_001028886 NP_001245237 NP_001245238 NP_001245239 NP_006161


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 12: 6.56 – 6.57 Mb

Хр. 6: 125.11 – 125.12 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NOP2 (англ. NOP2 nucleolar protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 812 амінокислот, а молекулярна маса — 89 302^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGRKLDPTKE	KRGPGRKARK	QKGAETELVR	FLPAVSDENS	KRLSSRARKR
AAKRRLGSVE	APKTNKSPEA	KPLPGKLPKG	ISAGAVQTAG	KKGPQSLFNA
PRGKKRPAPG	SDEEEEEEDS	EEDGMVNHGD	LWGSEDDADT	VDDYGADSNS
EDEEEGEALL	PIERAARKQK	AREAAAGIQW	SEEETEDEEE	EKEVTPESGP
PKVEEADGGL	QINVDEEPFV	LPPAGEMEQD	AQAPDLQRVH	KRIQDIVGIL
RDFGAQREEG	RSRSEYLNRL	KKDLAIYYSY	GDFLLGKLMD	LFPLSELVEF
LEANEVPRPV	TLRTNTLKTR	RRDLAQALIN	RGVNLDPLGK	WSKTGLVVYD
SSVPIGATPE	YLAGHYMLQG	ASSMLPVMAL	APQEHERILD	MCCAPGGKTS
YMAQLMKNTG	VILANDANAE	RLKSVVGNLH	RLGVTNTIIS	HYDGRQFPKV
VGGFDRVLLD	APCSGTGVIS	KDPAVKTNKD	EKDILRCAHL	QKELLLSAID
SVNATSKTGG	YLVYCTCSIT	VEENEWVVDY	ALKKRNVRLV	PTGLDFGQEG
FTRFRERRFH	PSLRSTRRFY	PHTHNMDGFF	IAKFKKFSNS	IPQSQTGNSE
TATPTNVDLP	QVIPKSENSS	QPAKKAKGAA	KTKQQLQKQQ	HPKKASFQKL
NGISKGADSE	LSTVPSVTKT	QASSSFQDSS	QPAGKAEGIR	EPKVTGKLKQ
RSPKLQSSKK	VAFLRQNAPP	KGTDTQTPAV	LSPSKTQATL	KPKDHHQPLG
RAKGVEKQQL	PEQPFEKAAF	QKQNDTPKGP	QPPTVSPIRS	SRPPPAKRKK
SQSRGNSQLL	LS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесмнг рРНК, біогенез рибосом, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ren Y., Busch R.K., Perlaky L., Busch H. (1998). The 58-kDa microspherule protein (MSP58), a nucleolar protein, interacts with nucleolar protein p120. Eur. J. Biochem. 253: 734—742. PMID 9654073 DOI:10.1046/j.1432-1327.1998.2530734.x
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Sloan K.E., Bohnsack M.T., Watkins N.J. (2013). The 5S RNP couples p53 homeostasis to ribosome biogenesis and nucleolar stress. Cell Rep. 5: 237—247. PMID 24120868 DOI:10.1016/j.celrep.2013.08.049
Sharma S., Yang J., Watzinger P., Kotter P., Entian K.D. (2013). Yeast Nop2 and Rcm1 methylate C2870 and C2278 of the 25S rRNA, respectively. Nucleic Acids Res. 41: 9062—9076. PMID 23913415 DOI:10.1093/nar/gkt679
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7867 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P46087 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.