NIFK

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2AFF

Ідентифікатори

Символи

NIFK, MKI67IP, Nopp34, nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67

Зовнішні ІД

OMIM: 611970 MGI: 1915199 HomoloGene: 49862 GeneCards: NIFK

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • condensed nuclear chromosome • хромосома • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• negative regulation of phosphatase activity • rRNA transcription • rRNA metabolic process • GO:0034622 protein-containing complex assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84365


67949

Ensembl


ENSG00000155438


ENSMUSG00000026377

UniProt


Q9BYG3


Q91VE6

RefSeq (мРНК)


NM_032390


NM_026472

RefSeq (білок)


NP_115766


NP_080748

Локус (UCSC)

Хр. 2: 121.73 – 121.74 Mb

Хр. 1: 118.25 – 118.26 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NIFK (англ. Nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 293 амінокислот, а молекулярна маса — 34 222^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATFSGPAGP	ILSLNPQEDV	EFQKEVAQVR	KRITQRKKQE	QLTPGVVYVR
HLPNLLDETQ	IFSYFSQFGT	VTRFRLSRSK	RTGNSKGYAF	VEFESEDVAK
IVAETMNNYL	FGERLLECHF	MPPEKVHKEL	FKDWNIPFKQ	PSYPSVKRYN
RNRTLTQKLR	MEERFKKKER	LLRKKLAKKG	IDYDFPSLIL	QKTESISKTN
RQTSTKGQVL	RKKKKKVSGT	LDTPEKTVDS	QGPTPVCTPT	FLERRKSQVA
ELNDDDKDDE	IVFKQPISCV	KEEIQETQTP	THSRKKRRRS	SNQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Takagi M., Sueishi M., Saiwaki T., Kametaka A., Yoneda Y. (2001). A novel nucleolar protein, NIFK, interacts with the forkhead associated domain of Ki-67 antigen in mitosis. J. Biol. Chem. 276: 25386—25391. PMID 11342549 DOI:10.1074/jbc.M102227200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Li H., Byeon I.-J., Ju Y., Tsai M.-D. (2004). Structure of human Ki67 FHA domain and its binding to a phosphoprotein fragment from hNIFK reveal unique recognition sites and new views to the structural basis of FHA domain functions. J. Mol. Biol. 335: 371—381. PMID 14659764 DOI:10.1016/j.jmb.2003.10.032
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Byeon I.-J., Li H., Song H., Gronenborn A.M., Tsai M.-D. (2005). Sequential phosphorylation and multisite interactions characterize specific target recognition by the FHA domain of Ki67. Nat. Struct. Mol. Biol. 12: 987—993. PMID 16244663 DOI:10.1038/nsmb1008

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17838 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9BYG3 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.