MICAL2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2E9K

Ідентифікатори

Символи

MICAL2, MICAL-2, MICAL2PV1, MICAL2PV2, microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 2

Зовнішні ІД

OMIM: 608881 MGI: 2444947 HomoloGene: 8760 GeneCards: MICAL2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin binding • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen • FAD binding • зв'язування з іоном металу • monooxygenase activity • oxidoreductase activity • NADPH:sulfur oxidoreductase activity • NAD(P)H oxidase H2O2-forming activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• heart looping • actin filament depolymerization • heart development • cytoskeleton organization • sulfur oxidation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9645


320878

Ensembl


ENSG00000133816


ENSMUSG00000038244

UniProt


O94851


Q8BML1

RefSeq (мРНК)

NM_001282663 NM_001282664 NM_001282665 NM_001282666 NM_001282667
NM_001282668 NM_001346292 NM_001346293 NM_001346294 NM_001346295 NM_001346296 NM_001346297 NM_001346298 NM_001346299 NM_014632


NM_001193305 NM_177282

RefSeq (білок)

NP_001269592 NP_001269593 NP_001269594 NP_001269595 NP_001269596
NP_001269597 NP_001333221 NP_001333222 NP_001333223 NP_001333224 NP_001333225 NP_001333226 NP_001333227 NP_001333228 NP_055447


NP_001180234 NP_796256

Локус (UCSC)

Хр. 11: 12.09 – 12.36 Mb

Хр. 7: 112.23 – 112.41 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MICAL2 (англ. Microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 124 амінокислот, а молекулярна маса — 126 689^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGENEDEKQA	QAGQVFENFV	QASTCKGTLQ	AFNILTRHLD	LDPLDHRNFY
SKLKSKVTTW	KAKALWYKLD	KRGSHKEYKR	GKSCTNTKCL	IVGGGPCGLR
TAIELAYLGA	KVVVVEKRDS	FSRNNVLHLW	PFTIHDLRGL	GAKKFYGKFC
AGSIDHISIR	QLQLILFKVA	LMLGVEIHVN	VEFVKVLEPP	EDQENQKIGW
RAEFLPTDHS	LSEFEFDVII	GADGRRNTLE	GFRRKEFRGK	LAIAITANFI
NRNSTAEAKV	EEISGVAFIF	NQKFFQDLKE	ETGIDLENIV	YYKDCTHYFV
MTAKKQSLLD	KGVIINDYID	TEMLLCAENV	NQDNLLSYAR	EAADFATNYQ
LPSLDFAMNH	YGQPDVAMFD	FTCMYASENA	ALVRERQAHQ	LLVALVGDSL
LEPFWPMGTG	CARGFLAAFD	TAWMVKSWNQ	GTPPLELLAE	RESLYRLLPQ
TTPENINKNF	EQYTLDPGTR	YPNLNSHCVR	PHQVKHLYIT	KELEHYPLER
LGSVRRSVNL	SRKESDIRPS	KLLTWCQQQT	EGYQHVNVTD	LTTSWRSGLA
LCAIIHRFRP	ELINFDSLNE	DDAVENNQLA	FDVAEREFGI	PPVTTGKEMA
SAQEPDKLSM	VMYLSKFYEL	FRGTPLRPVD	SWRKNYGENA	DLSLAKSSIS
NNYLNLTFPR	KRTPRVDGQT	GENDMNKRRR	KGFTNLDEPS	NFSSRSLGSN
QECGSSKEGG	NQNKVKSMAN	QLLAKFEEST	RNPSLMKQER	RVSGIGKPVL
CSSSGPPVHS	CCPKPEEATP	SPSPPLKRQF	PSVVVTGHVL	RELKQVSAGS
ECLSRPWRAR	AKSDLQLGGT	ENFATLPSTR	PRAQALSGVL	WRLQQVEEKI
LQKRAQNLAN	REFHTKNIKE	KAAHLASMFG	HGDFPQNKLL	SKGLSHTHPP
SPPSRLPSPD	PAASSSPSTV	DSASPARKEK	KSPSGFHFHP	SHLRTVHPQL
TVGKVSSGIG	AAAEVLVNLY	MNDHRPKAQA	TSPDLESMRK	SFPLNLGGSD
TCYFCKKRVY	VMERLSAEGH	FFHRECFRCS	ICATTLRLAA	YTFDCDEGKF
YCKPHFIHCK	TNSKQRKRRA	ELKQQREEEA	TWQEQEAPRR	DTPTESSCAV
AAIGTLEGSP	PVHFSLPVLH	PLLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку, НАДФ, ФАД, флавопротеїном. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Terman J.R., Mao T., Pasterkamp R.J., Yu H.-H., Kolodkin A.L. (2002). MICALs, a family of conserved flavoprotein oxidoreductases, function in plexin-mediated axonal repulsion. Cell. 109: 887—900. PMID 12110185 DOI:10.1016/S0092-8674(02)00794-8
Fischer J., Weide T., Barnekow A. (2005). The MICAL proteins and rab1: a possible link to the cytoskeleton?. Biochem. Biophys. Res. Commun. 328: 415—423. PMID 15694364 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.12.182
McDonald C.A., Liu Y.Y., Palfey B.A. (2013). Actin stimulates reduction of the MICAL-2 monooxygenase domain. Biochemistry. 52: 6076—6084. PMID 23927065 DOI:10.1021/bi4008462

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24693 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O94851 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.