LSM8

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3JCR

Ідентифікатори

Символи

LSM8, NAA38, LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated

Зовнішні ІД

OMIM: 607288 MGI: 1923772 HomoloGene: 9419 GeneCards: LSM8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • U6 snRNA binding • RNA binding
Клітинна компонента	• spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • U6 snRNP • precatalytic spliceosome • U2-type precatalytic spliceosome • Lsm2-8 complex
Біологічний процес	• mRNA processing • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome • RNA metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51691


76522

Ensembl


ENSG00000128534


ENSMUSG00000044155

UniProt


O95777


Q6ZWM4

RefSeq (мРНК)


NM_016200


NM_133939

RefSeq (білок)


NP_057284


NP_598700

Локус (UCSC)

Хр. 7: 118.18 – 118.2 Mb

Хр. 6: 18.85 – 18.86 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LSM8 (англ. LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 96 амінокислот, а молекулярна маса — 10 403^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSALENYIN		RTVAVITSDG		RMIVGTLKGF		DQTINLILDE		SHERVFSSSQ
GVEQVVLGLY		IVRGDNVAVI		GEIDEETDSA		LDLGNIRAEP		LNSVAH

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20471 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O95777 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.