LRRK2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2ZEJ, 3D6T | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LRRK2, AURA17, DARDARIN, PARK8, RIPK7, ROCO2, leucine-rich repeat kinase 2, leucine rich repeat kinase 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609007 MGI: 1913975 HomoloGene: 18982 GeneCards: LRRK2 |
---|
шифр КФ | 2.7.11.1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
хвороба Паркінсона, autosomal dominant Parkinson disease 8, хвороба Паркінсона, young-onset Parkinson disease, hereditary late onset Parkinson disease[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein homodimerization activity • signaling receptor complex adaptor activity • clathrin binding • co-receptor binding • transferase activity • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • protein kinase activity • protein kinase A binding • peroxidase inhibitor activity • SNARE binding • nucleotide binding • identical protein binding • GO:0006184 GTPase activity • syntaxin-1 binding • protein serine/threonine kinase activity • tubulin binding • transmembrane transporter binding • microtubule binding • MAP kinase kinase activity • GTP binding • ATP binding • GTP-dependent protein kinase activity • beta-catenin destruction complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinase activity • actin binding • magnesium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • ендосома • екзосома • Wnt signalosome • neuronal cell body • trans-Golgi network • мітохондріальна мембрана • синапс • цитоплазма • мітохондріальна зовнішня мембрана • synaptic vesicle membrane • перикаріон • ендоплазматичний ретикулум • клітинна мембрана • Мікроворсинки • мітохондріальний матрикс • dendrite cytoplasm • growth cone • cell projection • дендрит (нейробіологія) • лізосома • neuron projection • Golgi-associated vesicle • мітохондрія • мітохондріальна внутрішня мембрана • autolysosome • terminal bouton • внутрішньоклітинний • мембрана • membrane raft • аксон • amphisome • multivesicular body, internal vesicle • Синаптичні бульбашки • inclusion body • міжклітинні контакти • cytoplasmic side of mitochondrial outer membrane • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • postsynapse • міжклітинний простір • клітинне ядро • внутрішньоклітинна мембранна органела • caveola neck • endoplasmic reticulum exit site • glutamatergic synapse • presynaptic cytosol • Рибонуклеопротеїни |
---|
Біологічний процес | • lysosome organization • GO:0001306 response to oxidative stress • cellular response to dopamine • regulation of autophagy • positive regulation of autophagy • positive regulation of dopamine receptor signaling pathway • regulation of neuroblast proliferation • intracellular distribution of mitochondria • negative regulation of protein processing • negative regulation of protein processing involved in protein targeting to mitochondrion • protein localization to mitochondrion • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • автофагія • neuromuscular junction development • фосфорилювання • positive regulation of protein binding • regulation of branching morphogenesis of a nerve • mitochondrion localization • positive regulation of protein autoubiquitination • regulation of synaptic vesicle transport • positive regulation of protein phosphorylation • regulation of kidney size • regulation of synaptic vesicle exocytosis • positive regulation of MAP kinase activity • peptidyl-threonine phosphorylation • MAPK cascade • Wnt signalosome assembly • protein phosphorylation • regulation of synaptic transmission, glutamatergic • excitatory postsynaptic potential • negative regulation of hydrogen peroxide-induced cell death • regulation of dopamine receptor signaling pathway • regulation of membrane potential • protein autophosphorylation • regulation of mitochondrial fission • regulation of neuron maturation • reactive oxygen species metabolic process • positive regulation of programmed cell death • regulation of neuron death • regulation of mitochondrial depolarization • cellular response to oxidative stress • negative regulation of late endosome to lysosome transport • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of lysosomal lumen pH • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • locomotory exploration behavior • Golgi organization • canonical Wnt signaling pathway • neuron projection morphogenesis • positive regulation of protein ubiquitination • regulation of canonical Wnt signaling pathway • exploration behavior • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • tangential migration from the subventricular zone to the olfactory bulb • regulation of protein kinase A signaling • calcium-mediated signaling • negative regulation of thioredoxin peroxidase activity by peptidyl-threonine phosphorylation • negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of neuron death • negative regulation of protein targeting to mitochondrion • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • determination of adult lifespan • negative regulation of excitatory postsynaptic potential • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • neuron death • GTP metabolic process • negative regulation of autophagosome assembly • olfactory bulb development • cellular response to starvation • regulation of dendritic spine morphogenesis • диференціація клітин • ендоцитоз • negative regulation of protein binding • mitochondrion organization • cellular response to manganese ion • negative regulation of macroautophagy • regulation of locomotion • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of retrograde transport, endosome to Golgi • regulation of CAMKK-AMPK signaling cascade • positive regulation of histone deacetylase activity • endoplasmic reticulum organization • Сперматогенез • регуляція експресії генів • negative regulation of neuron projection development • striatum development • regulation of protein stability • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process • regulation of ER to Golgi vesicle-mediated transport • protein localization to endoplasmic reticulum exit site • neuron projection arborization • regulation of synaptic vesicle endocytosis • positive regulation of synaptic vesicle endocytosis • positive regulation of microglial cell activation • protein import into nucleus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 40.2 – 40.37 Mb | Хр. 15: 91.56 – 91.7 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LRRK2 (англ. Leucine rich repeat kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 527 амінокислот, а молекулярна маса — 286 103[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASGSCQGCE | | EDEETLKKLI | | VRLNNVQEGK | | QIETLVQILE | | DLLVFTYSER |
ASKLFQGKNI | | HVPLLIVLDS | | YMRVASVQQV | | GWSLLCKLIE | | VCPGTMQSLM |
GPQDVGNDWE | | VLGVHQLILK | | MLTVHNASVN | | LSVIGLKTLD | | LLLTSGKITL |
LILDEESDIF | | MLIFDAMHSF | | PANDEVQKLG | | CKALHVLFER | | VSEEQLTEFV |
ENKDYMILLS | | ALTNFKDEEE | | IVLHVLHCLH | | SLAIPCNNVE | | VLMSGNVRCY |
NIVVEAMKAF | | PMSERIQEVS | | CCLLHRLTLG | | NFFNILVLNE | | VHEFVVKAVQ |
QYPENAALQI | | SALSCLALLT | | ETIFLNQDLE | | EKNENQENDD | | EGEEDKLFWL |
EACYKALTWH | | RKNKHVQEAA | | CWALNNLLMY | | QNSLHEKIGD | | EDGHFPAHRE |
VMLSMLMHSS | | SKEVFQASAN | | ALSTLLEQNV | | NFRKILLSKG | | IHLNVLELMQ |
KHIHSPEVAE | | SGCKMLNHLF | | EGSNTSLDIM | | AAVVPKILTV | | MKRHETSLPV |
QLEALRAILH | | FIVPGMPEES | | REDTEFHHKL | | NMVKKQCFKN | | DIHKLVLAAL |
NRFIGNPGIQ | | KCGLKVISSI | | VHFPDALEML | | SLEGAMDSVL | | HTLQMYPDDQ |
EIQCLGLSLI | | GYLITKKNVF | | IGTGHLLAKI | | LVSSLYRFKD | | VAEIQTKGFQ |
TILAILKLSA | | SFSKLLVHHS | | FDLVIFHQMS | | SNIMEQKDQQ | | FLNLCCKCFA |
KVAMDDYLKN | | VMLERACDQN | | NSIMVECLLL | | LGADANQAKE | | GSSLICQVCE |
KESSPKLVEL | | LLNSGSREQD | | VRKALTISIG | | KGDSQIISLL | | LRRLALDVAN |
NSICLGGFCI | | GKVEPSWLGP | | LFPDKTSNLR | | KQTNIASTLA | | RMVIRYQMKS |
AVEEGTASGS | | DGNFSEDVLS | | KFDEWTFIPD | | SSMDSVFAQS | | DDLDSEGSEG |
SFLVKKKSNS | | ISVGEFYRDA | | VLQRCSPNLQ | | RHSNSLGPIF | | DHEDLLKRKR |
KILSSDDSLR | | SSKLQSHMRH | | SDSISSLASE | | REYITSLDLS | | ANELRDIDAL |
SQKCCISVHL | | EHLEKLELHQ | | NALTSFPQQL | | CETLKSLTHL | | DLHSNKFTSF |
PSYLLKMSCI | | ANLDVSRNDI | | GPSVVLDPTV | | KCPTLKQFNL | | SYNQLSFVPE |
NLTDVVEKLE | | QLILEGNKIS | | GICSPLRLKE | | LKILNLSKNH | | ISSLSENFLE |
ACPKVESFSA | | RMNFLAAMPF | | LPPSMTILKL | | SQNKFSCIPE | | AILNLPHLRS |
LDMSSNDIQY | | LPGPAHWKSL | | NLRELLFSHN | | QISILDLSEK | | AYLWSRVEKL |
HLSHNKLKEI | | PPEIGCLENL | | TSLDVSYNLE | | LRSFPNEMGK | | LSKIWDLPLD |
ELHLNFDFKH | | IGCKAKDIIR | | FLQQRLKKAV | | PYNRMKLMIV | | GNTGSGKTTL |
LQQLMKTKKS | | DLGMQSATVG | | IDVKDWPIQI | | RDKRKRDLVL | | NVWDFAGREE |
FYSTHPHFMT | | QRALYLAVYD | | LSKGQAEVDA | | MKPWLFNIKA | | RASSSPVILV |
GTHLDVSDEK | | QRKACMSKIT | | KELLNKRGFP | | AIRDYHFVNA | | TEESDALAKL |
RKTIINESLN | | FKIRDQLVVG | | QLIPDCYVEL | | EKIILSERKN | | VPIEFPVIDR |
KRLLQLVREN | | QLQLDENELP | | HAVHFLNESG | | VLLHFQDPAL | | QLSDLYFVEP |
KWLCKIMAQI | | LTVKVEGCPK | | HPKGIISRRD | | VEKFLSKKRK | | FPKNYMSQYF |
KLLEKFQIAL | | PIGEEYLLVP | | SSLSDHRPVI | | ELPHCENSEI | | IIRLYEMPYF |
PMGFWSRLIN | | RLLEISPYML | | SGRERALRPN | | RMYWRQGIYL | | NWSPEAYCLV |
GSEVLDNHPE | | SFLKITVPSC | | RKGCILLGQV | | VDHIDSLMEE | | WFPGLLEIDI |
CGEGETLLKK | | WALYSFNDGE | | EHQKILLDDL | | MKKAEEGDLL | | VNPDQPRLTI |
PISQIAPDLI | | LADLPRNIML | | NNDELEFEQA | | PEFLLGDGSF | | GSVYRAAYEG |
EEVAVKIFNK | | HTSLRLLRQE | | LVVLCHLHHP | | SLISLLAAGI | | RPRMLVMELA |
SKGSLDRLLQ | | QDKASLTRTL | | QHRIALHVAD | | GLRYLHSAMI | | IYRDLKPHNV |
LLFTLYPNAA | | IIAKIADYGI | | AQYCCRMGIK | | TSEGTPGFRA | | PEVARGNVIY |
NQQADVYSFG | | LLLYDILTTG | | GRIVEGLKFP | | NEFDELEIQG | | KLPDPVKEYG |
CAPWPMVEKL | | IKQCLKENPQ | | ERPTSAQVFD | | ILNSAELVCL | | TRRILLPKNV |
IVECMVATHH | | NSRNASIWLG | | CGHTDRGQLS | | FLDLNTEGYT | | SEEVADSRIL |
CLALVHLPVE | | KESWIVSGTQ | | SGTLLVINTE | | DGKKRHTLEK | | MTDSVTCLYC |
NSFSKQSKQK | | NFLLVGTADG | | KLAIFEDKTV | | KLKGAAPLKI | | LNIGNVSTPL |
MCLSESTNST | | ERNVMWGGCG | | TKIFSFSNDF | | TIQKLIETRT | | SQLFSYAAFS |
DSNIITVVVD | | TALYIAKQNS | | PVVEVWDKKT | | EKLCGLIDCV | | HFLREVMVKE |
NKESKHKMSY | | SGRVKTLCLQ | | KNTALWIGTG | | GGHILLLDLS | | TRRLIRVIYN |
FCNSVRVMMT | | AQLGSLKNVM | | LVLGYNRKNT | | EGTQKQKEIQ | | SCLTVWDINL |
PHEVQNLEKH | | IEVRKELAEK | | MRRTSVE |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, диференціація клітин. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, зовнішній мембрані мітохондрій, апараті гольджі, синапсах, ендосомах.
Література
- Zach S., Felk S., Gillardon F. (2010). Signal transduction protein array analysis links LRRK2 to Ste20 kinases and PKC zeta that modulate neuronal plasticity. PLoS ONE. 5: E13191—E13191. PMID 20949042 DOI:10.1371/journal.pone.0013191
- Wang Y., Jiang F., Zhuo Z., Wu X.H., Wu Y.D. (2013). A method for WD40 repeat detection and secondary structure prediction. PLoS ONE. 8: E65705—E65705. PMID 23776530 DOI:10.1371/journal.pone.0065705
- Toft M., Mata I.F., Kachergus J.M., Ross O.A., Farrer M.J. (2005). LRRK2 mutations and Parkinsonism. Lancet. 365: 1229—1230. PMID 15811454 DOI:10.1016/S0140-6736(05)74809-1
- Kay D.M., Kramer P., Higgins D.S., Zabetian C.P., Payami H. (2005). Escaping Parkinson's disease: a neurologically healthy octogenarian with the LRRK2 G2019S mutation. Mov. Disord. 20: 1077—1078. PMID 16001413 DOI:10.1002/mds.20618
- Paisan-Ruiz C., Nath P., Washecka N., Gibbs J.R., Singleton A.B. (2008). Comprehensive analysis of LRRK2 in publicly available Parkinson's disease cases and neurologically normal controls. Hum. Mutat. 29: 485—490. PMID 18213618 DOI:10.1002/humu.20668
- Bardien S., Lesage S., Brice A., Carr J. (2011). Genetic characteristics of leucine-rich repeat kinase 2 (LRRK2) associated Parkinson's disease. Parkinsonism Relat. Disord. 17: 501—508. PMID 21641266 DOI:10.1016/j.parkreldis.2010.11.008
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LRRK2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18618 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q5S007 (англ.) . Архів оригіналу за 28 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |