LIN7C

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3LRA

Ідентифікатори

Символи

LIN7C, LIN-7-C, LIN-7C, MALS-3, MALS3, VELI3, lin-7 homolog C, crumbs cell polarity complex component

Зовнішні ІД

OMIM: 612332 MGI: 1330839 HomoloGene: 22649 GeneCards: LIN7C

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding • cytoskeletal protein binding • L27 domain binding • PDZ domain binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • postsynaptic membrane • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • cell-cell junction • bicellular tight junction • клітинна мембрана • MPP7-DLG1-LIN7 complex • міжклітинні контакти • basolateral plasma membrane • neuron projection • presynapse • синапс • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• protein localization to basolateral plasma membrane • maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • protein transport • morphogenesis of an epithelial sheet • GO:0010554 neurotransmitter secretion • екзоцитоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55327


22343

Ensembl


ENSG00000148943


ENSMUSG00000027162

UniProt


Q9NUP9


O88952

RefSeq (мРНК)


NM_018362


NM_011699

RefSeq (білок)


NP_060832


NP_035829

Локус (UCSC)

Хр. 11: 27.49 – 27.51 Mb

Хр. 2: 109.72 – 109.73 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LIN7C (англ. Lin-7 homolog C, crumbs cell polarity complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 197 амінокислот, а молекулярна маса — 21 834^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAALGEPVRL	ERDICRAIEL	LEKLQRSGEV	PPQKLQALQR	VLQSEFCNAV
REVYEHVYET	VDISSSPEVR	ANATAKATVA	AFAASEGHSH	PRVVELPKTE
EGLGFNIMGG	KEQNSPIYIS	RIIPGGIADR	HGGLKRGDQL	LSVNGVSVEG
EHHEKAVELL	KAAQGKVKLV	VRYTPKVLEE	MESRFEKMRS	AKRRQQT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, екзоцитоз, ацетилювання. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах, синапсах, синаптосомах^[en].

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bohl J., Brimer N., Lyons C., Vande Pol S.B. (2007). The stardust family protein MPP7 forms a tripartite complex with LIN7 and DLG1 that regulates the stability and localization of DLG1 to cell junctions. J. Biol. Chem. 282: 9392—9400. PMID 17237226 DOI:10.1074/jbc.M610002200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17789 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NUP9 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.