LIN7A

Ідентифікатори

Символи

LIN7A, LIN-7A, LIN7, MALS-1, TIP-33, VELI1, lin-7 homolog A, crumbs cell polarity complex component, MALS1

Зовнішні ІД

OMIM: 603380 MGI: 2135609 HomoloGene: 20976 GeneCards: LIN7A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • L27 domain binding
Клітинна компонента	• postsynaptic membrane • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • cell-cell junction • bicellular tight junction • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • basolateral plasma membrane • neuron projection • екзосома • presynapse • синапс • MPP7-DLG1-LIN7 complex • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• protein localization to basolateral plasma membrane • maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • protein transport • synaptic vesicle transport • inner ear development • GO:0010554 neurotransmitter secretion • екзоцитоз • GO:0015915 транспорт • GO:0034622 protein-containing complex assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8825


108030

Ensembl


ENSG00000111052


ENSMUSG00000019906

UniProt


O14910


Q8JZS0

RefSeq (мРНК)


NM_004664 NM_001324423


NM_001033223 NM_001039354 NM_001284329

RefSeq (білок)


NP_001311352 NP_004655


NP_001028395 NP_001034443 NP_001271258

Локус (UCSC)

Хр. 12: 80.79 – 80.94 Mb

Хр. 10: 107.11 – 107.26 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LIN7A (англ. Lin-7 homolog A, crumbs cell polarity complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 233 амінокислот, а молекулярна маса — 25 997^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLKPSVTSAP	TADMATLTVV	QPLTLDRDVA	RAIELLEKLQ	ESGEVPVHKL
QSLKKVLQSE	FCTAIREVYQ	YMHETITVNG	CPEFRARATA	KATVAAFAAS
EGHSHPRVVE	LPKTDEGLGF	NVMGGKEQNS	PIYISRIIPG	GVAERHGGLK
RGDQLLSVNG	VSVEGEHHEK	AVELLKAAKD	SVKLVVRYTP	KVLEEMEARF
EKLRTARRRQ	QQQLLIQQQQ	QQQQQQTQQN	HMS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, екзоцитоз. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах, синапсах, синаптосомах^[en].

Література

Butz S., Okamoto M., Suedhof T.C. (1998). A tripartite protein complex with the potential to couple synaptic vesicle exocytosis to cell adhesion in brain. Cell. 94: 773—782. PMID 9753324 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81736-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Rousset R., Fabre S., Desbois C., Bantignies F., Jalinot P. (1998). The C-terminus of the HTLV-1 Tax oncoprotein mediates interaction with the PDZ domain of cellular proteins. Oncogene. 16: 643—654. PMID 9482110 DOI:10.1038/sj.onc.1201567
Bohl J., Brimer N., Lyons C., Vande Pol S.B. (2007). The stardust family protein MPP7 forms a tripartite complex with LIN7 and DLG1 that regulates the stability and localization of DLG1 to cell junctions. J. Biol. Chem. 282: 9392—9400. PMID 17237226 DOI:10.1074/jbc.M610002200
Jo K., Derin R., Li M., Bredt D.S. (1999). Characterization of MALS/Velis-1, -2, and -3: a family of mammalian LIN-7 homologs enriched at brain synapses in association with the postsynaptic density-95/NMDA receptor postsynaptic complex. J. Neurosci. 19: 4189—4199. PMID 10341223

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17787 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, O14910 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.