LIMA1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/15/Protein_LIMA1_PDB_2d8y.png/250px-Protein_LIMA1_PDB_2d8y.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LIMA1, EPLIN, SREBP3, LIM domain and actin binding 1, LDLCQ8 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608364 MGI: 1920992 HomoloGene: 9484 GeneCards: LIMA1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • actin filament binding • actin binding • actin monomer binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • міжклітинні контакти • Борозна розщеплення • цитоскелет • brush border • stress fiber • focal adhesion • actin cytoskeleton • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of actin filament depolymerization • ruffle organization • actin filament bundle assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/36/PBB_GE_LIMA1_217892_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_LIMA1_217892_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001113546 NM_001113547 NM_001243775 NM_016357 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001107018 NP_001107019 NP_001230704 NP_057441 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 50.18 – 50.28 Mb | Хр. 15: 99.68 – 99.77 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LIMA1 (англ. LIM domain and actin binding 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 759 амінокислот, а молекулярна маса — 85 226[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MESSPFNRRQ | | WTSLSLRVTA | | KELSLVNKNK | | SSAIVEIFSK | | YQKAAEETNM |
EKKRSNTENL | | SQHFRKGTLT | | VLKKKWENPG | | LGAESHTDSL | | RNSSTEIRHR |
ADHPPAEVTS | | HAASGAKADQ | | EEQIHPRSRL | | RSPPEALVQG | | RYPHIKDGED |
LKDHSTESKK | | MENCLGESRH | | EVEKSEISEN | | TDASGKIEKY | | NVPLNRLKMM |
FEKGEPTQTK | | ILRAQSRSAS | | GRKISENSYS | | LDDLEIGPGQ | | LSSSTFDSEK |
NESRRNLELP | | RLSETSIKDR | | MAKYQAAVSK | | QSSSTNYTNE | | LKASGGEIKI |
HKMEQKENVP | | PGPEVCITHQ | | EGEKISANEN | | SLAVRSTPAE | | DDSRDSQVKS |
EVQQPVHPKP | | LSPDSRASSL | | SESSPPKAMK | | KFQAPARETC | | VECQKTVYPM |
ERLLANQQVF | | HISCFRCSYC | | NNKLSLGTYA | | SLHGRIYCKP | | HFNQLFKSKG |
NYDEGFGHRP | | HKDLWASKNE | | NEEILERPAQ | | LANARETPHS | | PGVEDAPIAK |
VGVLAASMEA | | KASSQQEKED | | KPAETKKLRI | | AWPPPTELGS | | SGSALEEGIK |
MSKPKWPPED | | EISKPEVPED | | VDLDLKKLRR | | SSSLKERSRP | | FTVAASFQST |
SVKSPKTVSP | | PIRKGWSMSE | | QSEESVGGRV | | AERKQVENAK | | ASKKNGNVGK |
TTWQNKESKG | | ETGKRSKEGH | | SLEMENENLV | | ENGADSDEDD | | NSFLKQQSPQ |
EPKSLNWSSF | | VDNTFAEEFT | | TQNQKSQDVE | | LWEGEVVKEL | | SVEEQIKRNR |
YYDEDEDEE |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах.
Література
- Maul R.S., Chang D.D. (1999). EPLIN, epithelial protein lost in neoplasm. Oncogene. 18: 7838—7841. PMID 10618726 DOI:10.1038/sj.onc.1203206
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Simpson J.C., Wellenreuther R., Poustka A., Pepperkok R., Wiemann S. (2000). Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing. EMBO Rep. 1: 287—292. PMID 11256614 DOI:10.1093/embo-reports/kvd058
- Chen S., Maul R.S., Kim H.R., Chang D.D. (2000). Characterization of the human EPLIN (Epithelial protein lost in neoplasm) gene reveals distinct promoters for the two EPLIN isoforms. Gene. 248: 69—76. PMID 10806352 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00144-X
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24636 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9UHB6 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |