XRCC6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1JEQ, 1JEY, 1JJR, 3RZX | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | XRCC6, X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6, CTC75, CTCBF, G22P1, KU70, ML8, TLAA, X-ray repair cross complementing 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 152690 MGI: 95606 HomoloGene: 37483 GeneCards: XRCC6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • double-stranded telomeric DNA binding • telomeric DNA binding • GO:0008026 helicase activity • 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity • GO:0004003 DNA helicase activity • protein C-terminus binding • каталітична активність • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lyase activity • hydrolase activity • ATP binding • DNA binding • double-stranded DNA binding • damaged DNA binding • RNA binding • cyclin binding • GO:0032403 protein-containing complex binding |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • nuclear telomere cap complex • мембрана • transcription regulator complex • хромосома • нуклеоплазма • nonhomologous end joining complex • клітинне ядро • Ku70:Ku80 complex • цитоплазма • extracellular region • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • protein-DNA complex • ядерце • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • double-strand break repair via classical nonhomologous end joining • protein heterotetramerization • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of smooth muscle cell proliferation • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • DNA ligation • establishment of integrated proviral latency • обмін речовин • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • double-strand break repair via nonhomologous end joining • telomere maintenance • positive regulation of type I interferon production • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • DNA duplex unwinding • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular hyperosmotic salinity response • brain development • DNA recombination • neutrophil degranulation • cellular response to gamma radiation • cellular response to X-ray • positive regulation of protein kinase activity • activation of innate immune response • процес імунної системи • вроджений імунітет |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001469 NM_001288976 NM_001288977 NM_001288978 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001275905 NP_001275906 NP_001275907 NP_001460 NP_001275905.1
| NP_001460.1 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 41.62 – 41.66 Mb | Хр. 15: 81.87 – 81.92 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
Ku70 (англ. X-ray repair cross complementing 6) – білок, який кодується геном XRCC6, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 609 амінокислот, а молекулярна маса — 69 843[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSGWESYYKT | | EGDEEAEEEQ | | EENLEASGDY | | KYSGRDSLIF | | LVDASKAMFE |
SQSEDELTPF | | DMSIQCIQSV | | YISKIISSDR | | DLLAVVFYGT | | EKDKNSVNFK |
NIYVLQELDN | | PGAKRILELD | | QFKGQQGQKR | | FQDMMGHGSD | | YSLSEVLWVC |
ANLFSDVQFK | | MSHKRIMLFT | | NEDNPHGNDS | | AKASRARTKA | | GDLRDTGIFL |
DLMHLKKPGG | | FDISLFYRDI | | ISIAEDEDLR | | VHFEESSKLE | | DLLRKVRAKE |
TRKRALSRLK | | LKLNKDIVIS | | VGIYNLVQKA | | LKPPPIKLYR | | ETNEPVKTKT |
RTFNTSTGGL | | LLPSDTKRSQ | | IYGSRQIILE | | KEETEELKRF | | DDPGLMLMGF |
KPLVLLKKHH | | YLRPSLFVYP | | EESLVIGSST | | LFSALLIKCL | | EKEVAALCRY |
TPRRNIPPYF | | VALVPQEEEL | | DDQKIQVTPP | | GFQLVFLPFA | | DDKRKMPFTE |
KIMATPEQVG | | KMKAIVEKLR | | FTYRSDSFEN | | PVLQQHFRNL | | EALALDLMEP |
EQAVDLTLPK | | VEAMNKRLGS | | LVDEFKELVY | | PPDYNPEGKV | | TKRKHDNEGS |
GSKRPKVEYS | | EEELKTHISK | | GTLGKFTVPM | | LKEACRAYGL | | KSGLKKQELL |
EALTKHFQD |
Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, активаторів, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
- Griffith A.J., Craft J., Evans J., Mimori T., Hardin J.A. (1992). Nucleotide sequence and genomic structure analyses of the p70 subunit of the human Ku autoantigen: evidence for a family of genes encoding Ku (p70)-related polypeptides. Mol. Biol. Rep. 16: 91—97. PMID 1608402 DOI:10.1007/BF00419754
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Oderwald H., Hughes M.J., Jost J.-P. (1996). Non-histone protein 1 (NHP1) is a member of the Ku protein family which is upregulated in differentiating mouse myoblasts and human promyelocytes. FEBS Lett. 382: 313—318. PMID 8605992 DOI:10.1016/0014-5793(96)00189-5
- Jin S., Weaver D.T. (1997). Double-strand break repair by Ku70 requires heterodimerization with Ku80 and DNA binding functions. EMBO J. 16: 6874—6885. PMID 9362500 DOI:10.1093/emboj/16.22.6874
- West R.B., Yaneva M., Lieber M.R. (1998). Productive and nonproductive complexes of Ku and DNA-dependent protein kinase at DNA termini. Mol. Cell. Biol. 18: 5908—5920. PMID 9742108 DOI:10.1128/MCB.18.10.5908
- Chan D.W., Ye R., Veillette C.J., Lees-Miller S.P. (1999). DNA-dependent protein kinase phosphorylation sites in Ku 70/80 heterodimer. Biochemistry. 38: 1819—1828. PMID 10026262 DOI:10.1021/bi982584b
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4055 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2018. Процитовано 6 лютого 2017.
- ↑ UniProt, P12956 (англ.) . Архів оригіналу за 10 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |