KRR1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

KRR1

Ідентифікатори

Символи

KRR1, HRB2, RIP-1, small subunit processome component homolog, KRR1 small subunit processome component homolog

Зовнішні ІД

OMIM: 612817 MGI: 1289274 HomoloGene: 5114 GeneCards: KRR1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • small-subunit processome • ядерце • мембрана • клітинне ядро • intercellular bridge • нуклеоплазма
Біологічний процес	• ribosome biogenesis • maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • rRNA processing
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11103


52705

Ensembl


ENSG00000111615


ENSMUSG00000063334

UniProt


Q13601


Q8BGA5

RefSeq (мРНК)


NM_007043


NM_178610

RefSeq (білок)


NP_008974


NP_848725

Локус (UCSC)

Хр. 12: 75.49 – 75.51 Mb

Хр. 10: 111.81 – 111.82 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KRR1 (англ. KRR1, small subunit processome component homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 381 амінокислот, а молекулярна маса — 43 665^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASPSLERPE	KGAGKSEFRN	QKPKPENQDE	SELLTVPDGW	KEPAFSKEDN
PRGLLEESSF	ATLFPKYREA	YLKECWPLVQ	KALNEHHVNA	TLDLIEGSMT
VCTTKKTFDP	YIIIRARDLI	KLLARSVSFE	QAVRILQDDV	ACDIIKIGSL
VRNKERFVKR	RQRLIGPKGS	TLKALELLTN	CYIMVQGNTV	SAIGPFSGLK
EVRKVVLDTM	KNIHPIYNIK	SLMIKRELAK	DSELRSQSWE	RFLPQFKHKN
VNKRKEPKKK	TVKKEYTPFP	PPQPESQIDK	ELASGEYFLK	ANQKKRQKME
AIKAKQAEAI	SKRQEERNKA	FIPPKEKPIV	KPKEASTETK	IDVASIKEKV
KKAKNKKLGA	LTAEEIALKM	EADEKKKKKK	K

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесмнг рРНК, біогенез рибосом, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Refaeli Y., Levy D.N., Weiner D.B. (1995). The glucocorticoid receptor type II complex is a target of the HIV-1 vpr gene product. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 3621—3625. PMID 7724608 DOI:10.1073/pnas.92.8.3621

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5176 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13601 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.