KDM3A

Ідентифікатори

Символи

KDM3A, JHDM2A, JHMD2A, JMJD1, JMJD1A, TSGA, lysine demethylase 3A

Зовнішні ІД

OMIM: 611512 MGI: 98847 HomoloGene: 10196 GeneCards: KDM3A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• iron ion binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • androgen receptor binding • oxidoreductase activity • histone demethylase activity • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • chromatin DNA binding • histone H3-methyl-lysine-9 demethylase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро • Хроматин
Біологічний процес	• androgen receptor signaling pathway • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K9 dimethylation • regulation of stem cell differentiation • regulation of stem cell population maintenance • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Сперматогенез • hormone-mediated signaling pathway • negative regulation of histone H3-K9 methylation • регуляція експресії генів • formaldehyde biosynthetic process • spermatid nucleus elongation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H3-K9 demethylation • cellular response to leukemia inhibitory factor • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55818


104263

Ensembl


ENSG00000115548


ENSMUSG00000053470

UniProt


Q9Y4C1


Q6PCM1

RefSeq (мРНК)


NM_001146688 NM_018433


NM_001038695 NM_173001 NM_001362200 NM_001362201

RefSeq (білок)


NP_001140160 NP_060903


NP_001033784 NP_766589 NP_001349129 NP_001349130

Локус (UCSC)

Хр. 2: 86.44 – 86.49 Mb

Хр. 6: 71.57 – 71.61 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KDM3A (англ. Lysine demethylase 3A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 321 амінокислот, а молекулярна маса — 147 341^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVLTLGESWP	VLVGRRFLSL	SAADGSDGSH	DSWDVERVAE	WPWLSGTIRA
VSHTDVTKKD	LKVCVEFDGE	SWRKRRWIEV	YSLLRRAFLV	EHNLVLAERK
SPEISERIVQ	WPAITYKPLL	DKAGLGSITS	VRFLGDQQRV	FLSKDLLKPI
QDVNSLRLSL	TDNQIVSKEF	QALIVKHLDE	SHLLKGDKNL	VGSEVKIYSL
DPSTQWFSAT	VINGNPASKT	LQVNCEEIPA	LKIVDPSLIH	VEVVHDNLVT
CGNSARIGAV	KRKSSENNGT	LVSKQAKSCS	EASPSMCPVQ	SVPTTVFKEI
LLGCTAATPP	SKDPRQQSTP	QAANSPPNLG	AKIPQGCHKQ	SLPEEISSCL
NTKSEALRTK	PDVCKAGLLS	KSSQIGTGDL	KILTEPKGSC	TQPKTNTDQE
NRLESVPQAL	TGLPKECLPT	KASSKAELEI	ANPPELQKHL	EHAPSPSDVS
NAPEVKAGVN	SDSPNNCSGK	KVEPSALACR	SQNLKESSVK	VDNESCCSRS
NNKIQNAPSR	KSVLTDPAKL	KKLQQSGEAF	VQDDSCVNIV	AQLPKCRECR
LDSLRKDKEQ	QKDSPVFCRF	FHFRRLQFNK	HGVLRVEGFL	TPNKYDNEAI
GLWLPLTKNV	VGIDLDTAKY	ILANIGDHFC	QMVISEKEAM	STIEPHRQVA
WKRAVKGVRE	MCDVCDTTIF	NLHWVCPRCG	FGVCVDCYRM	KRKNCQQGAA
YKTFSWLKCV	KSQIHEPENL	MPTQIIPGKA	LYDVGDIVHS	VRAKWGIKAN
CPCSNRQFKL	FSKPASKEDL	KQTSLAGEKP	TLGAVLQQNP	SVLEPAAVGG
EAASKPAGSM	KPACPASTSP	LNWLADLTSG	NVNKENKEKQ	PTMPILKNEI
KCLPPLPPLS	KSSTVLHTFN	STILTPVSNN	NSGFLRNLLN	SSTGKTENGL
KNTPKILDDI	FASLVQNKTT	SDLSKRPQGL	TIKPSILGFD	TPHYWLCDNR
LLCLQDPNNK	SNWNVFRECW	KQGQPVMVSG	VHHKLNSELW	KPESFRKEFG
EQEVDLVNCR	TNEIITGATV	GDFWDGFEDV	PNRLKNEKEP	MVLKLKDWPP
GEDFRDMMPS	RFDDLMANIP	LPEYTRRDGK	LNLASRLPNY	FVRPDLGPKM
YNAYGLITPE	DRKYGTTNLH	LDVSDAANVM	VYVGIPKGQC	EQEEEVLKTI
QDGDSDELTI	KRFIEGKEKP	GALWHIYAAK	DTEKIREFLK	KVSEEQGQEN
PADHDPIHDQ	SWYLDRSLRK	RLHQEYGVQG	WAIVQFLGDV	VFIPAGAPHQ
VHNLYSCIKV	AEDFVSPEHV	KHCFWLTQEF	RYLSQTHTNH	EDKLQVKNVI
YHAVKDAVAM	LKASESSFGK	P

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, сперматогенез, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20815 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y4C1 (англ.) . Архів оригіналу за 14 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.