KDM1B |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4FWE, 4FWF, 4FWJ, 4GU0, 4GU1, 4GUR, 4GUS, 4GUT, 4GUU, 4HSU | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KDM1B, AOF1, C6orf193, LSD2, bA204B7.3, dJ298J15.2, lysine demethylase 1B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 613081 MGI: 2145261 HomoloGene: 131158 GeneCards: KDM1B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • DNA binding • oxidoreductase activity • flavin adenine dinucleotide binding • histone demethylase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • GO:0031493 histone binding • FAD binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма • Нуклеосома |
---|
Біологічний процес | • multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of gene expression by genetic imprinting • regulation of DNA methylation • transcription, DNA-templated • DNA methylation involved in gamete generation • protein deubiquitination • histone H3-K4 demethylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | | NP_758466 NP_001389837 NP_001389838 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 18.16 – 18.22 Mb | Хр. 13: 47.2 – 47.24 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KDM1B (англ. Lysine demethylase 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 822 амінокислот, а молекулярна маса — 92 098[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATPRGRTKK | | KASFDHSPDS | | LPLRSSGRQA | | KKKATETTDE | | DEDGGSEKKY |
RKCEKAGCTA | | TCPVCFASAS | | ERCAKNGYTS | | RWYHLSCGEH | | FCNECFDHYY |
RSHKDGYDKY | | TTWKKIWTSN | | GKTEPSPKAF | | MADQQLPYWV | | QCTKPECRKW |
RQLTKEIQLT | | PQIAKTYRCG | | MKPNTAIKPE | | TSDHCSLPED | | LRVLEVSNHW |
WYSMLILPPL | | LKDSVAAPLL | | SAYYPDCVGM | | SPSCTSTNRA | | AATGNASPGK |
LEHSKAALSV | | HVPGMNRYFQ | | PFYQPNECGK | | ALCVRPDVME | | LDELYEFPEY |
SRDPTMYLAL | | RNLILALWYT | | NCKEALTPQK | | CIPHIIVRGL | | VRIRCVQEVE |
RILYFMTRKG | | LINTGVLSVG | | ADQYLLPKDY | | HNKSVIIIGA | | GPAGLAAARQ |
LHNFGIKVTV | | LEAKDRIGGR | | VWDDKSFKGV | | TVGRGAQIVN | | GCINNPVALM |
CEQLGISMHK | | FGERCDLIQE | | GGRITDPTID | | KRMDFHFNAL | | LDVVSEWRKD |
KTQLQDVPLG | | EKIEEIYKAF | | IKESGIQFSE | | LEGQVLQFHL | | SNLEYACGSN |
LHQVSARSWD | | HNEFFAQFAG | | DHTLLTPGYS | | VIIEKLAEGL | | DIQLKSPVQC |
IDYSGDEVQV | | TTTDGTGYSA | | QKVLVTVPLA | | LLQKGAIQFN | | PPLSEKKMKA |
INSLGAGIIE | | KIALQFPYRF | | WDSKVQGADF | | FGHVPPSASK | | RGLFAVFYDM |
DPQKKHSVLM | | SVIAGEAVAS | | VRTLDDKQVL | | QQCMATLREL | | FKEQEVPDPT |
KYFVTRWSTD | | PWIQMAYSFV | | KTGGSGEAYD | | IIAEDIQGTV | | FFAGEATNRH |
FPQTVTGAYL | | SGVREASKIA | | AF |
Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, репресорів, регуляторів хроматину, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ФАД, флавопротеїном. Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21577 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8NB78 (англ.) . Архів оригіналу за 4 червня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |