IKZF4

IKZF4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2MA7

Ідентифікатори
Символи IKZF4, EOS, ZNFN1A4, IKAROS family zinc finger 4
Зовнішні ІД OMIM: 606239 MGI: 1343139 HomoloGene: 69103 GeneCards: IKZF4
Пов'язані генетичні захворювання
вітиліго, цукровий діабет 1-го типу, бронхіальна астма, alopecia areata[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
• nucleic acid binding
• sequence-specific DNA binding
• DNA binding
• bHLH transcription factor binding
• protein homodimerization activity
• зв'язування з іоном металу
• protein heterodimerization activity
• zinc ion binding
• protein domain specific binding
• GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

• клітинне ядро
• нуклеоплазма
• ядерні тільця
• GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

• GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• transcription, DNA-templated
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• protein homooligomerization
• protein heterooligomerization

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
64375
22781
Ensembl
ENSG00000123411
ENSMUSG00000002578
UniProt
Q9H2S9
Q8C208
RefSeq (мРНК)
NM_022465
NM_001351089
NM_001351090
NM_001351091
NM_001351092
NM_011772
NM_001358536
NM_001358537
RefSeq (білок)
NP_071910
NP_001338018
NP_001338019
NP_001338020
NP_001338021
NP_035902
NP_001345465
NP_001345466
Локус (UCSC) Хр. 12: 56.01 – 56.04 Mb Хр. 10: 128.47 – 128.51 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

IKZF4 (англ. IKAROS family zinc finger 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 585 амінокислот, а молекулярна маса — 64 106[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MHTPPALPRRFQGGGRVRTPGSHRQGKDNLERDPSGGCVPDFLPQAQDSN
HFIMESLFCESSGDSSLEKEFLGAPVGPSVSTPNSQHSSPSRSLSANSIK
VEMYSDEESSRLLGPDERLLEKDDSVIVEDSLSEPLGYCDGSGPEPHSPG
GIRLPNGKLKCDVCGMVCIGPNVLMVHKRSHTGERPFHCNQCGASFTQKG
NLLRHIKLHSGEKPFKCPFCNYACRRRDALTGHLRTHSVSSPTVGKPYKC
NYCGRSYKQQSTLEEHKERCHNYLQSLSTEAQALAGQPGDEIRDLEMVPD
SMLHSSSERPTFIDRLANSLTKRKRSTPQKFVGEKQMRFSLSDLPYDVNS
GGYEKDVELVAHHSLEPGFGSSLAFVGAEHLRPLRLPPTNCISELTPVIS
SVYTQMQPLPGRLELPGSREAGEGPEDLADGGPLLYRPRGPLTDPGASPS
NGCQDSTDTESNHEDRVAGVVSLPQGPPPQPPPTIVVGRHSPAYAKEDPK
PQEGLLRGTPGPSKEVLRVVGESGEPVKAFKCEHCRILFLDHVMFTIHMG
CHGFRDPFECNICGYHSQDRYEFSSHIVRGEHKVG

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
  • Perdomo J., Holmes M., Chong B., Crossley M. (2000). Eos and pegasus, two members of the Ikaros family of proteins with distinct DNA binding activities. J. Biol. Chem. 275: 38347—38354. PMID 10978333 DOI:10.1074/jbc.M005457200
  • Koipally J., Georgopoulos K. (2002). A molecular dissection of the repression circuitry of Ikaros. J. Biol. Chem. 277: 27697—27705. PMID 12015313 DOI:10.1074/jbc.M201694200
  • Perdomo J., Crossley M. (2002). The Ikaros family protein Eos associates with C-terminal-binding protein corepressors. Eur. J. Biochem. 269: 5885—5892. PMID 12444977 DOI:10.1046/j.1432-1033.2002.03313.x

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з IKZF4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13179 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, Q9H2S9 (англ.) . Архів оригіналу за 19 січня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.