IKZF4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | IKZF4, EOS, ZNFN1A4, IKAROS family zinc finger 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606239 MGI: 1343139 HomoloGene: 69103 GeneCards: IKZF4 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
вітиліго, цукровий діабет 1-го типу, бронхіальна астма, alopecia areata[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • nucleic acid binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • bHLH transcription factor binding • protein homodimerization activity • зв'язування з іоном металу • protein heterodimerization activity • zinc ion binding • protein domain specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • protein homooligomerization • protein heterooligomerization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/aa/PBB_GE_IKZF4_208472_at_fs.png/250px-PBB_GE_IKZF4_208472_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_022465 NM_001351089 NM_001351090 NM_001351091 NM_001351092 |
| | NM_011772 NM_001358536 NM_001358537 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_071910 NP_001338018 NP_001338019 NP_001338020 NP_001338021 |
| | NP_035902 NP_001345465 NP_001345466 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 56.01 – 56.04 Mb | Хр. 10: 128.47 – 128.51 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
IKZF4 (англ. IKAROS family zinc finger 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 585 амінокислот, а молекулярна маса — 64 106[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHTPPALPRR | | FQGGGRVRTP | | GSHRQGKDNL | | ERDPSGGCVP | | DFLPQAQDSN |
HFIMESLFCE | | SSGDSSLEKE | | FLGAPVGPSV | | STPNSQHSSP | | SRSLSANSIK |
VEMYSDEESS | | RLLGPDERLL | | EKDDSVIVED | | SLSEPLGYCD | | GSGPEPHSPG |
GIRLPNGKLK | | CDVCGMVCIG | | PNVLMVHKRS | | HTGERPFHCN | | QCGASFTQKG |
NLLRHIKLHS | | GEKPFKCPFC | | NYACRRRDAL | | TGHLRTHSVS | | SPTVGKPYKC |
NYCGRSYKQQ | | STLEEHKERC | | HNYLQSLSTE | | AQALAGQPGD | | EIRDLEMVPD |
SMLHSSSERP | | TFIDRLANSL | | TKRKRSTPQK | | FVGEKQMRFS | | LSDLPYDVNS |
GGYEKDVELV | | AHHSLEPGFG | | SSLAFVGAEH | | LRPLRLPPTN | | CISELTPVIS |
SVYTQMQPLP | | GRLELPGSRE | | AGEGPEDLAD | | GGPLLYRPRG | | PLTDPGASPS |
NGCQDSTDTE | | SNHEDRVAGV | | VSLPQGPPPQ | | PPPTIVVGRH | | SPAYAKEDPK |
PQEGLLRGTP | | GPSKEVLRVV | | GESGEPVKAF | | KCEHCRILFL | | DHVMFTIHMG |
CHGFRDPFEC | | NICGYHSQDR | | YEFSSHIVRG | | EHKVG |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
- Perdomo J., Holmes M., Chong B., Crossley M. (2000). Eos and pegasus, two members of the Ikaros family of proteins with distinct DNA binding activities. J. Biol. Chem. 275: 38347—38354. PMID 10978333 DOI:10.1074/jbc.M005457200
- Koipally J., Georgopoulos K. (2002). A molecular dissection of the repression circuitry of Ikaros. J. Biol. Chem. 277: 27697—27705. PMID 12015313 DOI:10.1074/jbc.M201694200
- Perdomo J., Crossley M. (2002). The Ikaros family protein Eos associates with C-terminal-binding protein corepressors. Eur. J. Biochem. 269: 5885—5892. PMID 12444977 DOI:10.1046/j.1432-1033.2002.03313.x
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з IKZF4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13179 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H2S9 (англ.) . Архів оригіналу за 19 січня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |