HSPG2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3SH4, 3SH5 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | HSPG2, HSPG, PLC, PRCAN, SJA, SJS, SJS1, heparan sulfate proteoglycan 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 142461 MGI: 96257 HomoloGene: 68473 GeneCards: HSPG2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Schwartz-Jampel syndrome 1, Silverman-Handmaker type dyssegmental dysplasia[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium ion binding • protein C-terminus binding • amyloid-beta binding • extracellular matrix structural constituent conferring compression resistance • low-density lipoprotein particle receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • базальна мембрана • Golgi lumen • екзосома • lysosomal lumen • extracellular region • клітинна мембрана • GO:0005578 Позаклітинна матриця • focal adhesion • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix • plasma membrane protein complex |
---|
Біологічний процес | • glycosaminoglycan metabolic process • extracellular matrix disassembly • retinoid metabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • glycosaminoglycan catabolic process • Ангіогенез • extracellular matrix organization • lipid metabolism • рецептор-опосередкований ендоцитоз • inflammatory response • brain development • negative regulation of angiogenesis • диференціація клітин • animal organ morphogenesis • гістогенез • cell migration • substrate adhesion-dependent cell spreading |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 21.82 – 21.94 Mb | Хр. 4: 137.2 – 137.3 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HSPG2 (англ. Heparan sulfate proteoglycan 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 391 амінокислот, а молекулярна маса — 468 830[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGWRAAGALL | | LALLLHGRLL | | AVTHGLRAYD | | GLSLPEDIET | | VTASQMRWTH |
SYLSDDEDML | | ADSISGDDLG | | SGDLGSGDFQ | | MVYFRALVNF | | TRSIEYSPQL |
EDAGSREFRE | | VSEAVVDTLE | | SEYLKIPGDQ | | VVSVVFIKEL | | DGWVFVELDV |
GSEGNADGAQ | | IQEMLLRVIS | | SGSVASYVTS | | PQGFQFRRLG | | TVPQFPRACT |
EAEFACHSYN | | ECVALEYRCD | | RRPDCRDMSD | | ELNCEEPVLG | | ISPTFSLLVE |
TTSLPPRPET | | TIMRQPPVTH | | APQPLLPGSV | | RPLPCGPQEA | | ACRNGHCIPR |
DYLCDGQEDC | | EDGSDELDCG | | PPPPCEPNEF | | PCGNGHCALK | | LWRCDGDFDC |
EDRTDEANCP | | TKRPEEVCGP | | TQFRCVSTNM | | CIPASFHCDE | | ESDCPDRSDE |
FGCMPPQVVT | | PPRESIQASR | | GQTVTFTCVA | | IGVPTPIINW | | RLNWGHIPSH |
PRVTVTSEGG | | RGTLIIRDVK | | ESDQGAYTCE | | AMNARGMVFG | | IPDGVLELVP |
QRGPCPDGHF | | YLEHSAACLP | | CFCFGITSVC | | QSTRRFRDQI | | RLRFDQPDDF |
KGVNVTMPAQ | | PGTPPLSSTQ | | LQIDPSLHEF | | QLVDLSRRFL | | VHDSFWALPE |
QFLGNKVDSY | | GGSLRYNVRY | | ELARGMLEPV | | QRPDVVLMGA | | GYRLLSRGHT |
PTQPGALNQR | | QVQFSEEHWV | | HESGRPVQRA | | ELLQVLQSLE | | AVLIQTVYNT |
KMASVGLSDI | | AMDTTVTHAT | | SHGRAHSVEE | | CRCPIGYSGL | | SCESCDAHFT |
RVPGGPYLGT | | CSGCNCNGHA | | SSCDPVYGHC | | LNCQHNTEGP | | QCNKCKAGFF |
GDAMKATATS | | CRPCPCPYID | | ASRRFSDTCF | | LDTDGQATCD | | ACAPGYTGRR |
CESCAPGYEG | | NPIQPGGKCR | | PVNQEIVRCD | | ERGSMGTSGE | | ACRCKNNVVG |
RLCNECADGS | | FHLSTRNPDG | | CLKCFCMGVS | | RHCTSSSWSR | | AQLHGASEEP |
GHFSLTNAAS | | THTTNEGIFS | | PTPGELGFSS | | FHRLLSGPYF | | WSLPSRFLGD |
KVTSYGGELR | | FTVTQRSQPG | | STPLHGQPLV | | VLQGNNIILE | | HHVAQEPSPG |
QPSTFIVPFR | | EQAWQRPDGQ | | PATREHLLMA | | LAGIDTLLIR | | ASYAQQPAES |
RVSGISMDVA | | VPEETGQDPA | | LEVEQCSCPP | | GYRGPSCQDC | | DTGYTRTPSG |
LYLGTCERCS | | CHGHSEACEP | | ETGACQGCQH | | HTEGPRCEQC | | QPGYYGDAQR |
GTPQDCQLCP | | CYGDPAAGQA | | AHTCFLDTDG | | HPTCDACSPG | | HSGRHCERCA |
PGYYGNPSQG | | QPCQRDSQVP | | GPIGCNCDPQ | | GSVSSQCDAA | | GQCQCKAQVE |
GLTCSHCRPH | | HFHLSASNPD | | GCLPCFCMGI | | TQQCASSAYT | | RHLISTHFAP |
GDFQGFALVN | | PQRNSRLTGE | | FTVEPVPEGA | | QLSFGNFAQL | | GHESFYWQLP |
ETYQGDKVAA | | YGGKLRYTLS | | YTAGPQGSPL | | SDPDVQITGN | | NIMLVASQPA |
LQGPERRSYE | | IMFREEFWRR | | PDGQPATREH | | LLMALADLDE | | LLIRATFSSV |
PLAASISAVS | | LEVAQPGPSN | | RPRALEVEEC | | RCPPGYIGLS | | CQDCAPGYTR |
TGSGLYLGHC | | ELCECNGHSD | | LCHPETGACS | | QCQHNAAGEF | | CELCAPGYYG |
DATAGTPEDC | | QPCACPLTNP | | ENMFSRTCES | | LGAGGYRCTA | | CEPGYTGQYC |
EQCGPGYVGN | | PSVQGGQCLP | | ETNQAPLVVE | | VHPARSIVPQ | | GGSHSLRCQV |
SGSPPHYFYW | | SREDGRPVPS | | GTQQRHQGSE | | LHFPSVQPSD | | AGVYICTCRN |
LHQSNTSRAE | | LLVTEAPSKP | | ITVTVEEQRS | | QSVRPGADVT | | FICTAKSKSP |
AYTLVWTRLH | | NGKLPTRAMD | | FNGILTIRNV | | QLSDAGTYVC | | TGSNMFAMDQ |
GTATLHVQAS | | GTLSAPVVSI | | HPPQLTVQPG | | QLAEFRCSAT | | GSPTPTLEWT |
GGPGGQLPAK | | AQIHGGILRL | | PAVEPTDQAQ | | YLCRAHSSAG | | QQVARAVLHV |
HGGGGPRVQV | | SPERTQVHAG | | RTVRLYCRAA | | GVPSATITWR | | KEGGSLPPQA |
RSERTDIATL | | LIPAITTADA | | GFYLCVATSP | | AGTAQARIQV | | VVLSASDASP |
PPVKIESSSP | | SVTEGQTLDL | | NCVVAGSAHA | | QVTWYRRGGS | | LPPHTQVHGS |
RLRLPQVSPA | | DSGEYVCRVE | | NGSGPKEASI | | TVSVLHGTHS | | GPSYTPVPGS |
TRPIRIEPSS | | SHVAEGQTLD | | LNCVVPGQAH | | AQVTWHKRGG | | SLPARHQTHG |
SLLRLHQVTP | | ADSGEYVCHV | | VGTSGPLEAS | | VLVTIEASVI | | PGPIPPVRIE |
SSSSTVAEGQ | | TLDLSCVVAG | | QAHAQVTWYK | | RGGSLPARHQ | | VRGSRLYIFQ |
ASPADAGQYV | | CRASNGMEAS | | ITVTVTGTQG | | ANLAYPAGST | | QPIRIEPSSS |
QVAEGQTLDL | | NCVVPGQSHA | | QVTWHKRGGS | | LPVRHQTHGS | | LLRLYQASPA |
DSGEYVCRVL | | GSSVPLEASV | | LVTIEPAGSV | | PALGVTPTVR | | IESSSSQVAE |
GQTLDLNCLV | | AGQAHAQVTW | | HKRGGSLPAR | | HQVHGSRLRL | | LQVTPADSGE |
YVCRVVGSSG | | TQEASVLVTI | | QQRLSGSHSQ | | GVAYPVRIES | | SSASLANGHT |
LDLNCLVASQ | | APHTITWYKR | | GGSLPSRHQI | | VGSRLRIPQV | | TPADSGEYVC |
HVSNGAGSRE | | TSLIVTIQGS | | GSSHVPSVSP | | PIRIESSSPT | | VVEGQTLDLN |
CVVARQPQAI | | ITWYKRGGSL | | PSRHQTHGSH | | LRLHQMSVAD | | SGEYVCRANN |
NIDALEASIV | | ISVSPSAGSP | | SAPGSSMPIR | | IESSSSHVAE | | GETLDLNCVV |
PGQAHAQVTW | | HKRGGSLPSH | | HQTRGSRLRL | | HHVSPADSGE | | YVCRVMGSSG |
PLEASVLVTI | | EASGSSAVHV | | PAPGGAPPIR | | IEPSSSRVAE | | GQTLDLKCVV |
PGQAHAQVTW | | HKRGGNLPAR | | HQVHGPLLRL | | NQVSPADSGE | | YSCQVTGSSG |
TLEASVLVTI | | EPSSPGPIPA | | PGLAQPIYIE | | ASSSHVTEGQ | | TLDLNCVVPG |
QAHAQVTWYK | | RGGSLPARHQ | | THGSQLRLHL | | VSPADSGEYV | | CRAASGPGPE |
QEASFTVTVP | | PSEGSSYRLR | | SPVISIDPPS | | STVQQGQDAS | | FKCLIHDGAA |
PISLEWKTRN | | QELEDNVHIS | | PNGSIITIVG | | TRPSNHGTYR | | CVASNAYGVA |
QSVVNLSVHG | | PPTVSVLPEG | | PVWVKVGKAV | | TLECVSAGEP | | RSSARWTRIS |
STPAKLEQRT | | YGLMDSHAVL | | QISSAKPSDA | | GTYVCLAQNA | | LGTAQKQVEV |
IVDTGAMAPG | | APQVQAEEAE | | LTVEAGHTAT | | LRCSATGSPA | | PTIHWSKLRS |
PLPWQHRLEG | | DTLIIPRVAQ | | QDSGQYICNA | | TSPAGHAEAT | | IILHVESPPY |
ATTVPEHASV | | QAGETVQLQC | | LAHGTPPLTF | | QWSRVGSSLP | | GRATARNELL |
HFERAAPEDS | | GRYRCRVTNK | | VGSAEAFAQL | | LVQGPPGSLP | | ATSIPAGSTP |
TVQVTPQLET | | KSIGASVEFH | | CAVPSDRGTQ | | LRWFKEGGQL | | PPGHSVQDGV |
LRIQNLDQSC | | QGTYICQAHG | | PWGKAQASAQ | | LVIQALPSVL | | INIRTSVQTV |
VVGHAVEFEC | | LALGDPKPQV | | TWSKVGGHLR | | PGIVQSGGVV | | RIAHVELADA |
GQYRCTATNA | | AGTTQSHVLL | | LVQALPQISM | | PQEVRVPAGS | | AAVFPCIASG |
YPTPDISWSK | | LDGSLPPDSR | | LENNMLMLPS | | VRPQDAGTYV | | CTATNRQGKV |
KAFAHLQVPE | | RVVPYFTQTP | | YSFLPLPTIK | | DAYRKFEIKI | | TFRPDSADGM |
LLYNGQKRVP | | GSPTNLANRQ | | PDFISFGLVG | | GRPEFRFDAG | | SGMATIRHPT |
PLALGHFHTV | | TLLRSLTQGS | | LIVGDLAPVN | | GTSQGKFQGL | | DLNEELYLGG |
YPDYGAIPKA | | GLSSGFIGCV | | RELRIQGEEI | | VFHDLNLTAH | | GISHCPTCRD |
RPCQNGGQCH | | DSESSSYVCV | | CPAGFTGSRC | | EHSQALHCHP | | EACGPDATCV |
NRPDGRGYTC | | RCHLGRSGLR | | CEEGVTVTTP | | SLSGAGSYLA | | LPALTNTHHE |
LRLDVEFKPL | | APDGVLLFSG | | GKSGPVEDFV | | SLAMVGGHLE | | FRYELGSGLA |
VLRSAEPLAL | | GRWHRVSAER | | LNKDGSLRVN | | GGRPVLRSSP | | GKSQGLNLHT |
LLYLGGVEPS | | VPLSPATNMS | | AHFRGCVGEV | | SVNGKRLDLT | | YSFLGSQGIG |
QCYDSSPCER | | QPCQHGATCM | | PAGEYEFQCL | | CRDGFKGDLC | | EHEENPCQLR |
EPCLHGGTCQ | | GTRCLCLPGF | | SGPRCQQGSG | | HGIAESDWHL | | EGSGGNDAPG |
QYGAYFHDDG | | FLAFPGHVFS | | RSLPEVPETI | | ELEVRTSTAS | | GLLLWQGVEV |
GEAGQGKDFI | | SLGLQDGHLV | | FRYQLGSGEA | | RLVSEDPIND | | GEWHRVTALR |
EGRRGSIQVD | | GEELVSGRSP | | GPNVAVNAKG | | SVYIGGAPDV | | ATLTGGRFSS |
GITGCVKNLV | | LHSARPGAPP | | PQPLDLQHRA | | QAGANTRPCP | | S |
Задіяний у такому біологічному процесі як ангіогенез. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Kallunki P., Tryggvason K. (1992). Human basement membrane heparan sulfate proteoglycan core protein: a 467-kD protein containing multiple domains resembling elements of the low density lipoprotein receptor, laminin, neural cell adhesion molecules, and epidermal growth factor. J. Cell Biol. 116: 559—571. PMID 1730768 DOI:10.1083/jcb.116.2.559
- Cohen I.R., Graessel S., Murdoch A.D., Iozzo R.V. (1993). Structural characterization of the complete human perlecan gene and its promoter. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 10404—10408. PMID 8234307 DOI:10.1073/pnas.90.21.10404
- Mongiat M., Sweeney S.M., San Antonio J.D., Fu J., Iozzo R.V. (2003). Endorepellin, a novel inhibitor of angiogenesis derived from the C terminus of perlecan. J. Biol. Chem. 278: 4238—4249. PMID 12435733 DOI:10.1074/jbc.M210445200
- Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
- Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
- Murdoch A.D., Dodge G.R., Cohen I., Tuan R.S., Iozzo R.V. (1992). Primary structure of the human heparan sulfate proteoglycan from basement membrane (HSPG2/perlecan). A chimeric molecule with multiple domains homologous to the low density lipoprotein receptor, laminin, neural cell adhesion molecules, and epidermal growth factor. J. Biol. Chem. 267: 8544—8557. PMID 1569102
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з HSPG2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5273 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
- ↑ UniProt, P98160 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |