HNRNPU
HNRNPU | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | HNRNPU, HNRPU, SAF-A, U21.1, hnRNP U, SAFA, HNRNPU-AS1, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U (scaffold attachment factor A), heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U, HNRNPU antisense RNA 1, C1orf199, NCRNA00201, EIEE54, pp120, GRIP120, DEE54 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602869 MGI: 1858195 HomoloGene: 22991 GeneCards: HNRNPU | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 244.84 – 244.86 Mb | н/д | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
HNRNPU (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 825 амінокислот, а молекулярна маса — 90 584[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSSSPVNVKK | LKVSELKEEL | KKRRLSDKGL | KAELMERLQA | ALDDEEAGGR | ||||
PAMEPGNGSL | DLGGDSAGRS | GAGLEQEAAA | GGDEEEEEEE | EEEEGISALD | ||||
GDQMELGEEN | GAAGAADSGP | MEEEEAASED | ENGDDQGFQE | GEDELGDEEE | ||||
GAGDENGHGE | QQPQPPATQQ | QQPQQQRGAA | KEAAGKSSGP | TSLFAVTVAP | ||||
PGARQGQQQA | GGKKKAEGGG | GGGRPGAPAA | GDGKTEQKGG | DKKRGVKRPR | ||||
EDHGRGYFEY | IEENKYSRAK | SPQPPVEEED | EHFDDTVVCL | DTYNCDLHFK | ||||
ISRDRLSASS | LTMESFAFLW | AGGRASYGVS | KGKVCFEMKV | TEKIPVRHLY | ||||
TKDIDIHEVR | IGWSLTTSGM | LLGEEEFSYG | YSLKGIKTCN | CETEDYGEKF | ||||
DENDVITCFA | NFESDEVELS | YAKNGQDLGV | AFKISKEVLA | GRPLFPHVLC | ||||
HNCAVEFNFG | QKEKPYFPIP | EEYTFIQNVP | LEDRVRGPKG | PEEKKDCEVV | ||||
MMIGLPGAGK | TTWVTKHAAE | NPGKYNILGT | NTIMDKMMVA | GFKKQMADTG | ||||
KLNTLLQRAP | QCLGKFIEIA | ARKKRNFILD | QTNVSAAAQR | RKMCLFAGFQ | ||||
RKAVVVCPKD | EDYKQRTQKK | AEVEGKDLPE | HAVLKMKGNF | TLPEVAECFD | ||||
EITYVELQKE | EAQKLLEQYK | EESKKALPPE | KKQNTGSKKS | NKNKSGKNQF | ||||
NRGGGHRGRG | GFNMRGGNFR | GGAPGNRGGY | NRRGNMPQRG | GGGGGSGGIG | ||||
YPYPRAPVFP | GRGSYSNRGN | YNRGGMPNRG | NYNQNFRGRG | NNRGYKNQSQ | ||||
GYNQWQQGQF | WGQKPWSQHY | HQGYY |
Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Fackelmayer F.O., Richter A. (1994). hnRNP-U/SAF-A is encoded by two differentially polyadenylated mRNAs in human cells. Biochim. Biophys. Acta. 1217: 232—234. PMID 7509195 DOI:10.1016/0167-4781(94)90044-2
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Jordan P., Heid H., Kinzel V., Kubler D. (1994). Major cell surface-located protein substrates of an ecto-protein kinase are homologs of known nuclear proteins. Biochemistry. 33: 14696—14706. PMID 7993898 DOI:10.1021/bi00253a007
- Fackelmayer F.O., Richter A. (1994). Purification of two isoforms of hnRNP-U and characterization of their nucleic acid binding activity. Biochemistry. 33: 10416—10422. PMID 8068679 DOI:10.1021/bi00200a024
- Barel M., Balbo M., Gauffre A., Frade R. (1995). Binding sites of the Epstein-Barr virus and C3d receptor (CR2, CD21) for its three intracellular ligands, the p53 anti-oncoprotein, the p68 calcium binding protein and the nuclear p120 ribonucleoprotein. Mol. Immunol. 32: 389—397. PMID 7753047 DOI:10.1016/0161-5890(95)00005-Y
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5048 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q00839 (англ.) . Архів оригіналу за 28 листопада 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
- Хромосома 1
|
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |