HM13

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1INQ, 1JUF

Ідентифікатори

Символи

HM13, H13, IMP1, IMPAS, IMPAS-1, MSTP086, PSENL3, PSL3, SPP, SPPL1, dJ324O17.1, histocompatibility (minor) 13, histocompatibility minor 13

Зовнішні ІД

OMIM: 607106 MGI: 95886 HomoloGene: 7749 GeneCards: HM13

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • aspartic-type endopeptidase activity • aspartic endopeptidase activity, intramembrane cleaving • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ubiquitin protein ligase binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • rough endoplasmic reticulum • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • integral component of cytoplasmic side of endoplasmic reticulum membrane • клітинна мембрана • Derlin-1 retrotranslocation complex • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • Golgi-associated vesicle membrane • lysosomal membrane • ендоплазматичний ретикулум • cell surface
Біологічний процес	• membrane protein proteolysis • протеоліз • membrane protein proteolysis involved in retrograde protein transport, ER to cytosol • membrane protein intracellular domain proteolysis • membrane protein ectodomain proteolysis • protein homotetramerization • signal peptide processing
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


81502


14950

Ensembl


ENSG00000101294


ENSMUSG00000019188

UniProt


Q8TCT9


Q9D8V0

RefSeq (мРНК)


NM_030789 NM_178580 NM_178581 NM_178582


NM_001159551 NM_001159552 NM_001159553 NM_010376

RefSeq (білок)


NP_110416 NP_848695 NP_848696 NP_848697


NP_001153023 NP_001153024 NP_001153025 NP_034506

Локус (UCSC)

Хр. 20: 31.51 – 31.58 Mb

Хр. 2: 152.51 – 152.55 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HM13 (англ. Histocompatibility minor 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 377 амінокислот, а молекулярна маса — 41 488^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDSALSDPHN	GSAEAGGPTN	STTRPPSTPE	GIALAYGSLL	LMALLPIFFG
ALRSVRCARG	KNASDMPETI	TSRDAARFPI	IASCTLLGLY	LFFKIFSQEY
INLLLSMYFF	VLGILALSHT	ISPFMNKFFP	ASFPNRQYQL	LFTQGSGENK
EEIINYEFDT	KDLVCLGLSS	IVGVWYLLRK	HWIANNLFGL	AFSLNGVELL
HLNNVSTGCI	LLGGLFIYDV	FWVFGTNVMV	TVAKSFEAPI	KLVFPQDLLE
KGLEANNFAM	LGLGDVVIPG	IFIALLLRFD	ISLKKNTHTY	FYTSFAAYIF
GLGLTIFIMH	IFKHAQPALL	YLVPACIGFP	VLVALAKGEV	TEMFSYEESN
PKDPAAVTES	KEGTEASASK	GLEKKEK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Weihofen A., Binns K., Lemberg M.K., Ashman K., Martoglio B. (2002). Identification of signal peptide peptidase, a presenilin-type aspartic protease. Science. 296: 2215—2218. PMID 12077416 DOI:10.1126/science.1070925
Urny J., Hermans-Borgmeyer I., Gercken G., Chica Schaller H. (2003). Expression of the presenilin-like signal peptide peptidase (SPP) in mouse adult brain and during development. Gene Expr. Patterns. 3: 685—691. PMID 12972007 DOI:10.1016/S1567-133X(03)00094-2
Grigorenko A.P., Moliaka Y.K., Korovaitseva G.I., Rogaev E.I. (2002). Novel class of polytopic proteins with domains associated with putative protease activity. Biochemistry (Mosc.). 67: 826—834. PMID 12139484 DOI:10.1023/A:1016365227942
Urny J., Hermans-Borgmeyer I., Schaller H.C. (2006). Cell-surface expression of a new splice variant of the mouse signal peptide peptidase. Biochim. Biophys. Acta. 1759: 159—165. PMID 16730383 DOI:10.1016/j.bbaexp.2006.02.007
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lemberg M.K., Bland F.A., Weihofen A., Braud V.M., Martoglio B. (2001). Intramembrane proteolysis of signal peptides: an essential step in the generation of HLA-E epitopes. J. Immunol. 167: 6441—6446. PMID 11714810 DOI:10.4049/jimmunol.167.11.6441

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16435 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8TCT9 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.