HLA-DPB1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3LQZ, 4P4K, 4P4R, 4P57, 4P5K, 4P5M | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | HLA-DPB1, DPB1, HLA-DP, HLA-DP1B, HLA-DPB, major histocompatibility complex, class II, DP beta 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 142858 HomoloGene: 129927 GeneCards: HLA-DPB1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
гепатит B[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • peptide antigen binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • endocytic vesicle membrane • clathrin-coated endocytic vesicle membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • trans-Golgi network membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • transport vesicle membrane • MHC class II protein complex • cell surface • lysosomal membrane • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • лізосома • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • endosome membrane |
---|
Біологічний процес | • antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • T cell costimulation • positive regulation of interferon-gamma production • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • positive regulation of T cell activation • positive regulation of T cell proliferation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • T cell receptor signaling pathway • адаптивна імунна відповідь |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | ENSG00000236693 ENSG00000230708 ENSG00000229295 ENSG00000226826 ENSG00000215048
| ENSG00000223865 ENSG00000230763 ENSG00000237710 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 33.08 – 33.09 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HLA-DPB1 (англ. Major histocompatibility complex, class II, DP beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 258 амінокислот, а молекулярна маса — 29 159[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MMVLQVSAAP | | RTVALTALLM | | VLLTSVVQGR | | ATPENYLFQG | | RQECYAFNGT |
QRFLERYIYN | | REEFARFDSD | | VGEFRAVTEL | | GRPAAEYWNS | | QKDILEEKRA |
VPDRMCRHNY | | ELGGPMTLQR | | RVQPRVNVSP | | SKKGPLQHHN | | LLVCHVTDFY |
PGSIQVRWFL | | NGQEETAGVV | | STNLIRNGDW | | TFQILVMLEM | | TPQQGDVYTC |
QVEHTSLDSP | | VTVEWKAQSD | | SARSKTLTGA | | GGFVLGLIIC | | GVGIFMHRRS |
KKVQRGSA |
Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.
Література
- Kelly A., Trowsdale J. (1985). Complete nucleotide sequence of a functional HLA-DP beta gene and the region between the DP beta 1 and DP alpha 1 genes: comparison of the 5' ends of HLA class II genes. Nucleic Acids Res. 13: 1607—1621. PMID 2987832 DOI:10.1093/nar/13.5.1607
- Compagnone-Post P., Turco E., Robinson C., Trucco M. (1988). The beta-chains of DP4 molecules from different haplotypes are encoded by the same gene. Genomics. 2: 8—13. PMID 2838415 DOI:10.1016/0888-7543(88)90103-6
- Korioth F., Hartung K., Deicher H., Frey J. (1992). A new HLA-DPB1 allele from a patient with systemic lupus erythematosus. Tissue Antigens. 39: 216—219. PMID 1529429 DOI:10.1111/j.1399-0039.1992.tb01938.x
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Rani R., Fernandez-Vina M.A., Zhang S., Stastny P. (1995). HLA-DPB1 alleles in a population from north India and description of a new variant (DPB1*5601). Tissue Antigens. 45: 264—269. PMID 7638863 DOI:10.1111/j.1399-0039.1995.tb02450.x
- Hessner M.J., Baxter-Lowe L.A. (1992). Characterization of novel HLA-DPB1 alleles by oligotyping and nucleotide sequencing. Tissue Antigens. 40: 261—263. PMID 1481203 DOI:10.1111/j.1399-0039.1992.tb02055.x
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з HLA-DPB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4940 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P04440 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |