GTF2IRD1
GTF2IRD1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | GTF2IRD1, BEN, CREAM1, GTF3, MUSTRD1, RBAP2, WBS, WBSCR11, WBSCR12, hMusTRD1alpha1, GTF2I repeat domain containing 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 604318 MGI: 1861942 HomoloGene: 4158 GeneCards: GTF2IRD1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 7: 74.45 – 74.6 Mb | Хр. 5: 134.39 – 134.49 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
GTF2IRD1 (англ. GTF2I repeat domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 959 амінокислот, а молекулярна маса — 106 057[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MALLGKRCDV | PTNGCGPDRW | NSAFTRKDEI | ITSLVSALDS | MCSALSKLNA | ||||
EVACVAVHDE | SAFVVGTEKG | RMFLNARKEL | QSDFLRFCRG | PPWKDPEAEH | ||||
PKKVQRGEGG | GRSLPRSSLE | HGSDVYLLRK | MVEEVFDVLY | SEALGRASVV | ||||
PLPYERLLRE | PGLLAVQGLP | EGLAFRRPAE | YDPKALMAIL | EHSHRIRFKL | ||||
KRPLEDGGRD | SKALVELNGV | SLIPKGSRDC | GLHGQAPKVP | PQDLPPTATS | ||||
SSMASFLYST | ALPNHAIREL | KQEAPSCPLA | PSDLGLSRPM | PEPKATGAQD | ||||
FSDCCGQKPT | GPGGPLIQNV | HASKRILFSI | VHDKSEKWDA | FIKETEDINT | ||||
LRECVQILFN | SRYAEALGLD | HMVPVPYRKI | ACDPEAVEIV | GIPDKIPFKR | ||||
PCTYGVPKLK | RILEERHSIH | FIIKRMFDER | IFTGNKFTKD | TTKLEPASPP | ||||
EDTSAEVSRA | TVLDLAGNAR | SDKGSMSEDC | GPGTSGELGG | LRPIKIEPED | ||||
LDIIQVTVPD | PSPTSEEMTD | SMPGHLPSED | SGYGMEMLTD | KGLSEDARPE | ||||
ERPVEDSHGD | VIRPLRKQVE | LLFNTRYAKA | IGISEPVKVP | YSKFLMHPEE | ||||
LFVVGLPEGI | SLRRPNCFGI | AKLRKILEAS | NSIQFVIKRP | ELLTEGVKEP | ||||
IMDSQGTASS | LGFSPPALPP | ERDSGDPLVD | ESLKRQGFQE | NYDARLSRID | ||||
IANTLREQVQ | DLFNKKYGEA | LGIKYPVQVP | YKRIKSNPGS | VIIEGLPPGI | ||||
PFRKPCTFGS | QNLERILAVA | DKIKFTVTRP | FQGLIPKPDE | DDANRLGEKV | ||||
ILREQVKELF | NEKYGEALGL | NRPVLVPYKL | IRDSPDAVEV | TGLPDDIPFR | ||||
NPNTYDIHRL | EKILKAREHV | RMVIINQLQP | FAEICNDAKV | PAKDSSIPKR | ||||
KRKRVSEGNS | VSSSSSSSSS | SSSNPDSVAS | ANQISLVQWP | MYMVDYAGLN | ||||
VQLPGPLNY |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Osborne L.R., Campbell T., Daradich A., Scherer S.W., Tsui L.-C. (1999). Identification of a putative transcription factor gene (WBSCR11) that is commonly deleted in Williams-Beuren syndrome. Genomics. 57: 279—284. PMID 10198167 DOI:10.1006/geno.1999.5784
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tussie-Luna M.I., Bayarsaihan D., Ruddle F.H., Roy A.L. (2001). Repression of TFII-I-dependent transcription by nuclear exclusion. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 7789—7794. PMID 11438732 DOI:10.1073/pnas.141222298
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
- Franke Y., Peoples R.J., Francke U. (1999). Identification of GTF2IRD1, a putative transcription factor within the Williams-Beuren syndrome deletion at 7q11.23. Cytogenet. Cell Genet. 86: 296—304. PMID 10575229
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4661 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9UHL9 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 7
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |