GOPC

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DC2, 2LOB, 4E34, 4E35, 4JOE, 4JOF, 4JOG, 4JOH, 4JOJ, 4JOK, 4JOP, 4JOR, 4K6Y, 4K72, 4K75, 4K76, 4K78, 4NMO, 4NMP, 4NMQ, 4NMR, 4NMS, 4NMT, 4NMV, 4Q6H, 4Q6S

Ідентифікатори

Символи

GOPC, CAL, FIG, GOPC1, PIST, dJ94G16.2, golgi-associated PDZ and coiled-coil motif containing, golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing

Зовнішні ІД

OMIM: 606845 MGI: 2149946 HomoloGene: 10695 GeneCards: GOPC

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transmembrane transporter binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005110 frizzled binding • protein C-terminus binding • GO:0005083 GTPase regulator activity • protein homodimerization activity
Клітинна компонента	• lysosomal membrane • Golgi-associated vesicle membrane • trans-Golgi network transport vesicle • синапс • cell projection • міжклітинні контакти • Golgi membrane • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • postsynaptic membrane • дендрит (нейробіологія) • мембрана • комплекс Ґольджі • цитоплазма • клітинна мембрана • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • protein homooligomerization • apical protein localization • protein transport • Golgi to plasma membrane transport • negative regulation of anion channel activity • cytoplasmic sequestering of CFTR protein • negative regulation of protein localization to cell surface • spermatid nucleus differentiation • GO:0048552 regulation of catalytic activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57120


94221

Ensembl


ENSG00000047932


ENSMUSG00000019861

UniProt


Q9HD26


Q8BH60

RefSeq (мРНК)


NM_020399 NM_001017408


NM_001199272 NM_053187

RefSeq (білок)


NP_001017408 NP_065132


NP_001186201 NP_444417

Локус (UCSC)

Хр. 6: 117.56 – 117.6 Mb

Хр. 10: 52.21 – 52.26 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GOPC (англ. Golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 462 амінокислот, а молекулярна маса — 50 520^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAGGPCPAA	AGGGPGGASC	SVGAPGGVSM	FRWLEVLEKE	FDKAFVDVDL
LLGEIDPDQA	DITYEGRQKM	TSLSSCFAQL	CHKAQSVSQI	NHKLEAQLVD
LKSELTETQA	EKVVLEKEVH	DQLLQLHSIQ	LQLHAKTGQS	ADSGTIKAKL
SGPSVEELER	ELEANKKEKM	KEAQLEAEVK	LLRKENEALR	RHIAVLQAEV
YGARLAAKYL	DKELAGRVQQ	IQLLGRDMKG	PAHDKLWNQL	EAEIHLHRHK
TVIRACRGRN	DLKRPMQAPP	GHDQDSLKKS	QGVGPIRKVL	LLKEDHEGLG
ISITGGKEHG	VPILISEIHP	GQPADRCGGL	HVGDAILAVN	GVNLRDTKHK
EAVTILSQQR	GEIEFEVVYV	APEVDSDDEN	VEYEDESGHR	YRLYLDELEG
GGNPGASCKD	TSGEIKVLQG	FNKKAVTDTH	ENGDLGTASE	TPLDDGASKL
DDLHTLYHKK	SY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, апараті гольджі, синапсах.

Література

Neudauer C.L., Joberty G., Macara I.G. (2001). PIST: a novel PDZ/coiled-coil domain binding partner for the rho-family GTPase TC10. Biochem. Biophys. Res. Commun. 280: 541—547. PMID 11162552 DOI:10.1006/bbrc.2000.4160
Charest A., Lane K., McMahon K., Housman D.E. (2001). Association of a novel PDZ domain-containing peripheral Golgi protein with the Q-SNARE (Q-soluble N-ethylmaleimide-sensitive fusion protein (NSF) attachment protein receptor) protein syntaxin 6. J. Biol. Chem. 276: 29456—29465. PMID 11384996 DOI:10.1074/jbc.M104137200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cheng J., Wang H., Guggino W.B. (2004). Modulation of mature cystic fibrosis transmembrane regulator protein by the PDZ domain protein CAL. J. Biol. Chem. 279: 1892—1898. PMID 14570915 DOI:10.1074/jbc.M308640200
Hruska-Hageman A.M., Benson C.J., Leonard A.S., Price M.P., Welsh M.J. (2004). PSD-95 and Lin-7b interact with acid-sensing ion channel-3 and have opposite effects on H+- gated current. J. Biol. Chem. 279: 46962—46968. PMID 15317815 DOI:10.1074/jbc.M405874200
He J., Bellini M., Xu J., Castleberry A.M., Hall R.A. (2004). Interaction with cystic fibrosis transmembrane conductance regulator-associated ligand (CAL) inhibits beta1-adrenergic receptor surface expression. J. Biol. Chem. 279: 50190—50196. PMID 15358775 DOI:10.1074/jbc.M404876200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17643 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9HD26 (англ.) . Архів оригіналу за 16 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.