GCFC2

Ідентифікатори

Символи

GCFC2, C2orf3, DNABF, GCF, TCF9, GC-rich sequence DNA-binding factor 2

Зовнішні ІД

OMIM: 189901 MGI: 2141656 HomoloGene: 2411 GeneCards: GCFC2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• ядерце • клітинне ядро • U2-type post-mRNA release spliceosomal complex • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• mRNA processing • spliceosomal complex assembly • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6936


330361

Ensembl


ENSG00000005436


ENSMUSG00000035125

UniProt


P16383


Q8BKT3

RefSeq (мРНК)


NM_001201334 NM_001201335 NM_003203


NM_177884

RefSeq (білок)


NP_001188263 NP_001188264 NP_003194


NP_808552

Локус (UCSC)

Хр. 2: 75.65 – 75.71 Mb

Хр. 6: 81.92 – 81.96 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GCFC2 (англ. GC-rich sequence DNA-binding factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 781 амінокислот, а молекулярна маса — 89 385^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAHRPKRTFR	QRAADSSDSD	GAEESPAEPG	APRELPVPGS	AEEEPPSGGG
RAQVAGLPHR	VRGPRGRGRV	WASSRRATKA	APRADEGSES	RTLDVSTDEE
DKIHHSSESK	DDQGLSSDSS	SSLGEKELSS	TVKIPDAAFI	QAARRKRELA
RAQDDYISLD	VQHTSSISGM	KRESEDDPES	EPDDHEKRIP	FTLRPQTLRQ
RMAEESISRN	EETSEESQED	EKQDTWEQQQ	MRKAVKIIEE	RDIDLSCGNG
SSKVKKFDTS	ISFPPVNLEI	IKKQLNTRLT	LLQETHRSHL	REYEKYVQDV
KSSKSTIQNL	ESSSNQALNC	KFYKSMKIYV	ENLIDCLNEK	IINIQEIESS
MHALLLKQAM	TFMKRRQDEL	KHESTYLQQL	SRKDETSTSG	NFSVDEKTQW
ILEEIESRRT	KRRQARVLSG	NCNHQEGTSS	DDELPSAEMI	DFQKSQGDIL
QKQKKVFEEV	QDDFCNIQNI	LLKFQQWREK	FPDSYYEAFI	SLCIPKLLNP
LIRVQLIDWN	PLKLESTGLK	EMPWFKSVEE	FMDSSVEDSK	KESSSDKKVL
SAIINKTIIP	RLTDFVEFLW	DPLSTSQTTS	LITHCRVILE	EHSTCENEVS
KSRQDLLKSI	VSRMKKAVED	DVFIPLYPKS	AVENKTSPHS	KFQERQFWSG
LKLFRNILLW	NGLLTDDTLQ	ELGLGKLLNR	YLIIALLNAT	PGPDVVKKCN
QVAACLPEKW	FENSAMRTSI	PQLENFIQFL	LQSAHKLSRS	EFRDEVEEII
LILVKIKALN	QAESFIGEHH	LDHLKSLIKE	D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Kageyama R., Pastan I. (1989). Molecular cloning and characterization of a human DNA binding factor that represses transcription. Cell. 59: 815—825. PMID 2556218 DOI:10.1016/0092-8674(89)90605-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yoshimoto R., Okawa K., Yoshida M., Ohno M., Kataoka N. (2014). Identification of a novel component C2ORF3 in the lariat-intron complex: lack of C2ORF3 interferes with pre-mRNA splicing via intron turnover pathway. Genes Cells. 19: 78—87. PMID 24304693 DOI:10.1111/gtc.12114

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1317 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P16383 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.