FXR1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2CPQ, 3KUF, 3O8V | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | FXR1, FXR1P, FMR1 autosomal homolog 1, MYORIBF, MYOPMIL |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600819 MGI: 104860 HomoloGene: 3573 GeneCards: FXR1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein homodimerization activity • G-quadruplex RNA binding • mRNA 3'-UTR binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • nucleic acid binding • mRNA binding • RNA strand annealing activity • RNA binding • translation regulator activity |
---|
Клітинна компонента | • мембрана • ribonucleoprotein granule • dendritic spine • аксон • дендрит (нейробіологія) • ядерце • perinuclear region of cytoplasm • costamere • клітинне ядро • гіалоплазма • цитоплазма • Полісома • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • neuronal cell body • postsynapse • glutamatergic synapse |
---|
Біологічний процес | • диференціація клітин • muscle organ development • multicellular organism development • GO:0097285 апоптоз • GO:1905618 positive regulation of gene silencing by miRNA • negative regulation of translation • regulation of translation • regulation of mRNA stability • positive regulation of translation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001013438 NM_001013439 NM_005087 NM_001363882 |
| | NM_001113188 NM_001113189 NM_008053 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001013456 NP_001013457 NP_005078 NP_001350811 |
| | NP_001106659 NP_001106660 NP_032079 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 180.87 – 180.98 Mb | Хр. 3: 34.07 – 34.12 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
FXR1 (англ. FMR1 autosomal homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 621 амінокислот, а молекулярна маса — 69 721[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAELTVEVRG | | SNGAFYKGFI | | KDVHEDSLTV | | VFENNWQPER | | QVPFNEVRLP |
PPPDIKKEIS | | EGDEVEVYSR | | ANDQEPCGWW | | LAKVRMMKGE | | FYVIEYAACD |
ATYNEIVTFE | | RLRPVNQNKT | | VKKNTFFKCT | | VDVPEDLREA | | CANENAHKDF |
KKAVGACRIF | | YHPETTQLMI | | LSASEATVKR | | VNILSDMHLR | | SIRTKLMLMS |
RNEEATKHLE | | CTKQLAAAFH | | EEFVVREDLM | | GLAIGTHGSN | | IQQARKVPGV |
TAIELDEDTG | | TFRIYGESAD | | AVKKARGFLE | | FVEDFIQVPR | | NLVGKVIGKN |
GKVIQEIVDK | | SGVVRVRIEG | | DNENKLPRED | | GMVPFVFVGT | | KESIGNVQVL |
LEYHIAYLKE | | VEQLRMERLQ | | IDEQLRQIGS | | RSYSGRGRGR | | RGPNYTSGYG |
TNSELSNPSE | | TESERKDELS | | DWSLAGEDDR | | DSRHQRDSRR | | RPGGRGRSVS |
GGRGRGGPRG | | GKSSISSVLK | | DPDSNPYSLL | | DNTESDQTAD | | TDASESHHST |
NRRRRSRRRR | | TDEDAVLMDG | | MTESDTASVN | | ENGLVTVADY | | ISRAESQSRQ |
RNLPRETLAK | | NKKEMAKDVI | | EEHGPSEKAI | | NGPTSASGDD | | ISKLQRTPGE |
EKINTLKEEN | | TQEAAVLNGV | | S |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, міогенез, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Siomi M.C., Zhang Y., Siomi H., Dreyfuss G. (1996). Specific sequences in the fragile X syndrome protein FMR1 and the FXR proteins mediate their binding to 60S ribosomal subunits and the interactions among them. Mol. Cell. Biol. 16: 3825—3832. PMID 8668200 DOI:10.1128/MCB.16.7.3825
- Laggerbauer B., Ostareck D., Keidel E.M., Ostareck-Lederer A., Fischer U. (2001). Evidence that fragile X mental retardation protein is a negative regulator of translation. Hum. Mol. Genet. 10: 329—338. PMID 11157796 DOI:10.1093/hmg/10.4.329
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4023 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P51114 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |