FCN3 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

FCN3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2J5Z, 2J60, 2J64

Ідентифікатори

Символи

FCN3, FCNH, HAKA1, ficolin 3

Зовнішні ІД

OMIM: 604973 HomoloGene: 130523 GeneCards: FCN3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0003823, GO:0051635 antigen binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • carbohydrate binding • serine-type endopeptidase activity
Клітинна компонента	• extracellular region • колаген • blood microparticle
Біологічний процес	• complement activation, lectin pathway • complement activation • recognition of apoptotic cell • negative regulation of RNA biosynthetic process • процес імунної системи • вроджений імунітет • протеоліз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8547


188512

Ensembl


ENSG00000142748


WBGene00020516

UniProt


O75636


Q5ZR75

RefSeq (мРНК)


NM_003665 NM_173452


NM_072342

RefSeq (білок)


NP_003656 NP_775628


NP_504743

Локус (UCSC)

Хр. 1: 27.37 – 27.37 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FCN3 (англ. Ficolin 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 299 амінокислот, а молекулярна маса — 32 903^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDLLWILPSL	WLLLLGGPAC	LKTQEHPSCP	GPRELEASKV	VLLPSCPGAP
GSPGEKGAPG	PQGPPGPPGK	MGPKGEPGDP	VNLLRCQEGP	RNCRELLSQG
ATLSGWYHLC	LPEGRALPVF	CDMDTEGGGW	LVFQRRQDGS	VDFFRSWSSY
RAGFGNQESE	FWLGNENLHQ	LTLQGNWELR	VELEDFNGNR	TFAHYATFRL
LGEVDHYQLA	LGKFSEGTAG	DSLSLHSGRP	FTTYDADHDS	SNSNCAVIVH
GAWWYASCYR	SNLNGRYAVS	EAAAHKYGID	WASGRGVGHP	YRRVRMMLR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, лектинами. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3625 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, O75636 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.