ERC1

Ідентифікатори

Символи

ERC1, Cast2, ELKS, ERC-1, RAB6IP2, ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1

Зовнішні ІД

OMIM: 607127 MGI: 2151013 HomoloGene: 14229 GeneCards: ERC1

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• leucine zipper domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • PDZ domain binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • presynaptic active zone • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • синапс • IkappaB kinase complex • presynaptic membrane • мембрана • центросома • ciliary basal body • центр організації мікротрубочок • цитоскелет
Біологічний процес	• multicellular organism development • protein transport • retrograde transport, endosome to Golgi • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • I-kappaB phosphorylation • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • negative regulation of apoptotic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23085


111173

Ensembl


ENSG00000082805


ENSMUSG00000030172

UniProt


Q8IUD2


Q99MI1

RefSeq (мРНК)


NM_001301248 NM_178039 NM_178040


NM_053204 NM_178085

RefSeq (білок)


NP_001288177 NP_829883 NP_829884


NP_444434 NP_835186

Локус (UCSC)

Хр. 12: 0.99 – 1.5 Mb

Хр. 6: 119.57 – 119.85 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ERC1 (англ. ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 116 амінокислот, а молекулярна маса — 128 086^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYGSARSVGK	VEPSSQSPGR	SPRLPRSPRL	GHRRTNSTGG	SSGSSVGGGS
GKTLSMENIQ	SLNAAYATSG	PMYLSDHENV	GSETPKSTMT	LGRSGGRLPY
GVRMTAMGSS	PNIASSGVAS	DTIAFGEHHL	PPVSMASTVP	HSLRQARDNT
IMDLQTQLKE	VLRENDLLRK	DVEVKESKLS	SSMNSIKTFW	SPELKKERAL
RKDEASKITI	WKEQYRVVQE	ENQHMQMTIQ	ALQDELRIQR	DLNQLFQQDS
SSRTGEPCVA	ELTEENFQRL	HAEHERQAKE	LFLLRKTLEE	MELRIETQKQ
TLNARDESIK	KLLEMLQSKG	LSAKATEEDH	ERTRRLAEAE	MHVHHLESLL
EQKEKENSML	REEMHRRFEN	APDSAKTKAL	QTVIEMKDSK	ISSMERGLRD
LEEEIQMLKS	NGALSTEERE	EEMKQMEVYR	SHSKFMKNKV	EQLKEELSSK
EAQWEELKKK	AAGLQAEIGQ	VKQELSRKDT	ELLALQTKLE	TLTNQFSDSK
QHIEVLKESL	TAKEQRAAIL	QTEVDALRLR	LEEKETMLNK	KTKQIQDMAE
EKGTQAGEIH	DLKDMLDVKE	RKVNVLQKKI	ENLQEQLRDK	EKQMSSLKER
VKSLQADTTN	TDTALTTLEE	ALAEKERTIE	RLKEQRDRDE	REKQEEIDNY
KKDLKDLKEK	VSLLQGDLSE	KEASLLDLKE	HASSLASSGL	KKDSRLKTLE
IALEQKKEEC	LKMESQLKKA	HEAALEARAS	PEMSDRIQHL	EREITRYKDE
SSKAQAEVDR	LLEILKEVEN	EKNDKDKKIA	ELERQVKDQN	KKVANLKHKE
QVEKKKSAQM	LEEARRREDN	LNDSSQQLQD	SLRKKDDRIE	ELEEALRESV
QITAEREMVL	AQEESARTNA	EKQVEELLMA	MEKVKQELES	MKAKLSSTQQ
SLAEKETHLT	NLRAERRKHL	EEVLEMKQEA	LLAAISEKDA	NIALLELSSS
KKKTQEEVAA	LKREKDRLVQ	QLKQQTQNRM	KLMADNYEDD	HFKSSHSNQT
NHKPSPDQII	QPLLELDQNR	SKLKLYIGHL	TTLCHDRDPL	ILRGLTPPAS
YNLDDDQAAW	ENELQKMTRG	QLQDELEKGE	RDNAELQEFA	NAILQQIADH
CPDILEQVVN	ALEESS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література

Nakata T., Yokota T., Emi M., Minami S. (2002). Differential expression of multiple isoforms of the ELKS mRNAs involved in a papillary thyroid carcinoma. Genes Chromosomes Cancer. 35: 30—37. PMID 12203787 DOI:10.1002/gcc.10095
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ko J., Na M., Kim S., Lee J.R., Kim E. (2003). Interaction of the ERC family of RIM-binding proteins with the liprin-alpha family of multidomain proteins. J. Biol. Chem. 278: 42377—42385. PMID 12923177 DOI:10.1074/jbc.M307561200

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17072 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IUD2 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.