EP400 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | EP400, CAGH32, P400, TNRC12, E1A binding protein p400 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606265 MGI: 1276124 HomoloGene: 38779 GeneCards: EP400 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • nucleotide binding • protein antigen binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • hydrolase activity • GO:0008026 helicase activity |
---|
Клітинна компонента | • NuA4 histone acetyltransferase complex • nuclear speck • клітинне ядро • Swr1 complex • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • histone H2A acetylation • histone H4 acetylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e6/PBB_GE_EP400_212376_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_EP400_212376_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 131.95 – 132.08 Mb | Хр. 5: 110.81 – 110.92 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EP400 (англ. E1A binding protein p400) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 159 амінокислот, а молекулярна маса — 343 489[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHHGTGPQNV | | QHQLQRSRAC | | PGSEGEEQPA | | HPNPPPSPAA | | PFAPSASPSA |
PQSPSYQIQQ | | LMNRSPATGQ | | NVNITLQSVG | | PVVGGNQQIT | | LAPLPLPSPT |
SPGFQFSAQP | | RRFEHGSPSY | | IQVTSPLSQQ | | VQTQSPTQPS | | PGPGQALQNV |
RAGAPGPGLG | | LCSSSPTGGF | | VDASVLVRQI | | SLSPSSGGHF | | VFQDGSGLTQ |
IAQGAQVQLQ | | HPGTPITVRE | | RRPSQPHTQS | | GGTIHHLGPQ | | SPAAAGGAGL |
QPLASPSHIT | | TANLPPQISS | | IIQGQLVQQQ | | QVLQGPPLPR | | PLGFERTPGV |
LLPGAGGAAG | | FGMTSPPPPT | | SPSRTAVPPG | | LSSLPLTSVG | | NTGMKKVPKK |
LEEIPPASPE | | MAQMRKQCLD | | YHYQEMQALK | | EVFKEYLIEL | | FFLQHFQGNM |
MDFLAFKKKH | | YAPLQAYLRQ | | NDLDIEEEEE | | EEEEEEEKSE | | VINDEVKVVT |
GKDGQTGTPV | | AIATQLPPKV | | SAAFSSQQQP | | FQQALAGSLV | | AGAGSTVETD |
LFKRQQAMPS | | TGMAEQSKRP | | RLEVGHQGVV | | FQHPGADAGV | | PLQQLMPTAQ |
GGMPPTPQAA | | QLAGQRQSQQ | | QYDPSTGPPV | | QNAASLHTPL | | PQLPGRLPPA |
GVPTAALSSA | | LQFAQQPQVV | | EAQTQLQIPV | | KTQQPNVPIP | | APPSSQLPIP |
PSQPAQLALH | | VPTPGKVQVQ | | ASQLSSLPQM | | VASTRLPVDP | | APPCPRPLPT |
SSTSSLAPVS | | GSGPGPSPAR | | SSPVNRPSSA | | TNKALSPVTS | | RTPGVVASAP |
TKPQSPAQNA | | TSSQDSSQDT | | LTEQITLENQ | | VHQRIAELRK | | AGLWSQRRLP |
KLQEAPRPKS | | HWDYLLEEMQ | | WMATDFAQER | | RWKVAAAKKL | | VRTVVRHHEE |
KQLREERGKK | | EEQSRLRRIA | | ASTAREIECF | | WSNIEQVVEI | | KLRVELEEKR |
KKALNLQKVS | | RRGKELRPKG | | FDALQESSLD | | SGMSGRKRKA | | SISLTDDEVD |
DEEETIEEEE | | ANEGVVDHQT | | ELSNLAKEAE | | LPLLDLMKLY | | EGAFLPSSQW |
PRPKPDGEDT | | SGEEDADDCP | | GDRESRKDLV | | LIDSLFIMDQ | | FKAAERMNIG |
KPNAKDIADV | | TAVAEAILPK | | GSARVTTSVK | | FNAPSLLYGA | | LRDYQKIGLD |
WLAKLYRKNL | | NGILADEAGL | | GKTVQIIAFF | | AHLACNEGNW | | GPHLVVVRSC |
NILKWELELK | | RWCPGLKILS | | YIGSHRELKA | | KRQEWAEPNS | | FHVCITSYTQ |
FFRGLTAFTR | | VRWKCLVIDE | | MQRVKGMTER | | HWEAVFTLQS | | QQRLLLIDSP |
LHNTFLELWT | | MVHFLVPGIS | | RPYLSSPLRA | | PSEESQDYYH | | KVVIRLHRVT |
QPFILRRTKR | | DVEKQLTKKY | | EHVLKCRLSN | | RQKALYEDVI | | LQPGTQEALK |
SGHFVNVLSI | | LVRLQRICNH | | PGLVEPRHPG | | SSYVAGPLEY | | PSASLILKAL |
ERDFWKEADL | | SMFDLIGLEN | | KITRHEAELL | | SKKKIPRKLM | | EEISTSAAPA |
ARPAAAKLKA | | SRLFQPVQYG | | QKPEGRTVAF | | PSTHPPRTAA | | PTTASAAPQG |
PLRGRPPIAT | | FSANPEAKAA | | AAPFQTSQAS | | ASAPRHQPAS | | ASSTAASPAH |
PAKLRAQTTA | | QASTPGQPPP | | QPQAPSHAAG | | QSALPQRLVL | | PSQAQARLPS |
GEVVKIAQLA | | SITGPQSRVA | | QPETPVTLQF | | QGSKFTLSHS | | QLRQLTAGQP |
LQLQGSVLQI | | VSAPGQPYLR | | APGPVVMQTV | | SQAGAVHGAL | | GSKPPAGGPS |
PAPLTPQVGV | | PGRVAVNALA | | VGEPGTASKP | | ASPIGGPTQE | | EKTRLLKERL |
DQIYLVNERR | | CSQAPVYGRD | | LLRICALPSH | | GRVQWRGSLD | | GRRGKEAGPA |
HSYTSSSESP | | SELMLTLCRC | | GESLQDVIDR | | VAFVIPPVVA | | APPSLRVPRP |
PPLYSHRMRI | | LRQGLREHAA | | PYFQQLRQTT | | APRLLQFPEL | | RLVQFDSGKL |
EALAILLQKL | | KSEGRRVLIL | | SQMILMLDIL | | EMFLNFHYLT | | YVRIDENASS |
EQRQELMRSF | | NRDRRIFCAI | | LSTHSRTTGI | | NLVEADTVVF | | YDNDLNPVMD |
AKAQEWCDRI | | GRCKDIHIYR | | LVSGNSIEEK | | LLKNGTKDLI | | REVAAQGNDY |
SMAFLTQRTI | | QELFEVYSPM | | DDAGFPVKAE | | EFVVLSQEPS | | VTETIAPKIA |
RPFIEALKSI | | EYLEEDAQKS | | AQEGVLGPHT | | DALSSDSENM | | PCDEEPSQLE |
ELADFMEQLT | | PIEKYALNYL | | ELFHTSIEQE | | KERNSEDAVM | | TAVRAWEFWN |
LKTLQEREAR | | LRLEQEEAEL | | LTYTREDAYS | | MEYVYEDVDG | | QTEVMPLWTP |
PTPPQDDSDI | | YLDSVMCLMY | | EATPIPEAKL | | PPVYVRKERK | | RHKTDPSAAG |
RKKKQRHGEA | | VVPPRSLFDR | | ATPGLLKIRR | | EGKEQKKNIL | | LKQQVPFAKP |
LPTFAKPTAE | | PGQDNPEWLI | | SEDWALLQAV | | KQLLELPLNL | | TIVSPAHTPN |
WDLVSDVVNS | | CSRIYRSSKQ | | CRNRYENVII | | PREEGKSKNN | | RPLRTSQIYA |
QDENATHTQL | | YTSHFDLMKM | | TAGKRSPPIK | | PLLGMNPFQK | | NPKHASVLAE |
SGINYDKPLP | | PIQVASLRAE | | RIAKEKKALA | | DQQKAQQPAV | | AQPPPPQPQP |
PPPPQQPPPP | | LPQPQAAGSQ | | PPAGPPAVQP | | QPQPQPQTQP | | QPVQAPAKAQ |
PAITTGGSAA | | VLAGTIKTSV | | TGTSMPTGAV | | SGNVIVNTIA | | GVPAATFQSI |
NKRLASPVAP | | GALTTPGGSA | | PAQVVHTQPP | | PRAVGSPATA | | TPDLVSMATT |
QGVRAVTSVT | | ASAVVTTNLT | | PVQTPARSLV | | PQVSQATGVQ | | LPGKTITPAH |
FQLLRQQQQQ | | QQQQQQQQQQ | | QQQQQQQQQQ | | QQQQTTTTSQ | | VQVPQIQGQA |
QSPAQIKAVG | | KLTPEHLIKM | | QKQKLQMPPQ | | PPPPQAQSAP | | PQPTAQVQVQ |
TSQPPQQQSP | | QLTTVTAPRP | | GALLTGTTVA | | NLQVARLTRV | | PTSQLQAQGQ |
MQTQAPQPAQ | | VALAKPPVVS | | VPAAVVSSPG | | VTTLPMNVAG | | ISVAIGQPQK |
AAGQTVVAQP | | VHMQQLLKLK | | QQAVQQQKAI | | QPQAAQGPAA | | VQQKITAQQI |
TTPGAQQKVA | | YAAQPALKTQ | | FLTTPISQAQ | | KLAGAQQVQT | | QIQVAKLPQV |
VQQQTPVASI | | QQVASASQQA | | SPQTVALTQA | | TAAGQQVQMI | | PAVTATAQVV |
QQKLIQQQVV | | TTASAPLQTP | | GAPNPAQVPA | | SSDSPSQQPK | | LQMRVPAVRL |
KTPTKPPCQ |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
- Doyon Y., Cote J. (2004). The highly conserved and multifunctional NuA4 HAT complex. Curr. Opin. Genet. Dev. 14: 147—154. PMID 15196461 DOI:10.1016/j.gde.2004.02.009
- Doyon Y., Selleck W., Lane W.S., Tan S., Cote J. (2004). Structural and functional conservation of the NuA4 histone acetyltransferase complex from yeast to humans. Mol. Cell. Biol. 24: 1884—1896. PMID 14966270 DOI:10.1128/MCB.24.5.1884-1896.2004
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11958 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q96L91 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |